HumanDoodlome

HumanDoodlome

пикабушник
пол: мужской
поставил 4721 плюс и 566 минусов
отредактировал 0 постов
проголосовал за 0 редактирований
19К рейтинг 27 подписчиков 489 комментариев 38 постов 20 в "горячем"
4

Бактерии сеют в рыбах ужас

Бактерии сеют в рыбах ужас Рыба, Иммунитет, Бактерии, Страх, Биология, Наука, Смерть, Видео, Длиннопост

Иллюстрация по мотивам исследования от первого автора статьи —Joanne Shu Ming Chia. Умирая, рыбы выпускают Schreckstoff-сигнал, приводящий cородичей в панику. Бактериальные лизаты частично воспроизводят эффект Schreckstoff

Рыбы, казалось бы, неспособны испытывать эмоции. Хотя по большей части это так, рыбы точно могут испытывать ужас. Для тех, кто не верит — видео снизу.

Рыба паникует при предъявлении Schreckstoff-сигнала: сначала мечется, а затем замирает на дне.

Такую реакцию у рыб вызывает загадочный Schreckstoff-сигнал, выделяющийся при смерти сородича. Известно, что рыбы чуют этот сигнал, но предыдущие попытки найти его химический носитель проваливались.


В недавно опубликованной статье NatureComms сообщается, что Schreckstoff удалось воспроизвести с помощью бактериальных лизатов, приготовленных из обитателей рыбьей микрофлоры. Похожую реакцию вызывал экстракт рыбьей кожи. Что интересно: экстракты безбактериальных рыб приводят к более яркому метанию, тогда как от бактериальных лизатов рыбы мечутся меньше и больше замирают. Авторы из-за этого предполагают, что за некоторые аспекты Schreckstoff ответственны бактерии, а за другие — сами рыбы.


Ещё один вопрос — как вообще Schreckstoff мог закрепиться в ходе эволюции? Какой толк отдельной рыбе, которую уже съели, от того, что произойдёт после её смерти? Возможно, Schreckstoff закрепился не как целенаправленный сигнал сородичам, а как побочный продукт иммунитета. Среди кожных клеток у рыб встречаются "club cells" (клетки трефы?) которые, способны поглощать другие клетки, слизь и бактерии. При внезапной и жестокой смерти они рвутся и высвобождают содержимое, которое окружающие рыбы в ходе многих поколений научились распознавать как подсказку о близкой угрозе.

Бактерии сеют в рыбах ужас Рыба, Иммунитет, Бактерии, Страх, Биология, Наука, Смерть, Видео, Длиннопост

Рыбья кожа под микроскопом (зелёный) , в которой club cells можно отличить по наличию в них бактерий (красный)

Статья

Заметка о статье

Показать полностью 1
122

ИИ от российских учёных создаёт новые лекарства

ИИ от российских учёных создаёт новые лекарства Наука, Искусственный интеллект, Нейронные сети, Химия, Биология, Медицина, Инновации, Длиннопост

Благодаря нейросети GENTRL, учёным удалось найти, синтезировать и проверить на животных новое лекарство от фиброза лёгких всего за 46 дней. (Иллюстрация из оригинальной статьи)

Ни для кого не секрет, что фармацевтический бизнес, пожалуй, самый неэффективный бизнес на свете. Стоимость вывода новой молекулы на рынок в среднем $1.8 млрд, а >90% потенциальных лекарств проваливаются на какой-либо стадии коммерческих испытаний. Причём >30% стоимости нового лекарства сконцентрировано ещё в доклинической стадии исследований, а сами исследования растягиваются на долгие годы (Рис.1).

Помимо этого, драг-дизайн находится в глобальном творческом тупике: всё сложнее придумать что-то новое. Весь низко висящий виноград уже собран, а чтобы дотянуться до верхних веток приходится тратить в разы больше, и при этом никто не гарантирует успех.


Но отечественным учёным похоже удалось разрешить эту проблему. В начале сентября Nature Biotechnology опубликовала статью "Deep learning enables rapid identification of potent DDR1 kinase inhibitors" ("Глубокое обучение позволяет быстро определять возможные ингибиторы DDR1 киназы"). Название в принципе хорошо раскрывает суть происходящего. Авторы утверждают, что за 46 дней придумали, синтезировали и экспериментально проверили действие 6 новых препаратов от фиброза лёгких.


Добиться таких успехов они смогли благодаря разработанной ими ИИ-платформе GENTRL. Знатоки машинного обучения могут найти оригинальную статью и написать в каментах, насколько GENTRL ИИ или не-ИИ. Я же скажу, что с помощью этой штуки удалось совершить то, с чем не справился бы ни один человек, а у группы людей заняло бы годы.

ИИ от российских учёных создаёт новые лекарства Наука, Искусственный интеллект, Нейронные сети, Химия, Биология, Медицина, Инновации, Длиннопост

Рис.1 — Cтоимость вывода нового препарата на рынок, разбитая по стадиям разработки. WIP (work in progress) — cколько нужно продуктов на этой стадии разработки, чтобы один из них вышел на рынок. Все затраты обозанчены в $ млн. В данной оценке не учитываются затраты на поиск новых таргетов и расходы компании, не связанные с RnD (например, з/п остальных отделов). Модель составлена по данным о 13 крупных фармкомпаниях. GENTRL относится преимущественно к стадии Target-to-hit

Сурс

Итак, GENTRL. C точки зрения техники, это "variational autoencoder" — нейросеть, которая позволяет, получив вход, дать похожий на него выход, но с некоторой вариацией, которую может задать её оператор. Например, имея фото лица, нарисовать на нём очки. Подробнее об этом типе сетей здесь.


Чтобы обучить GENTRL и фильтровать её (его?) выдачу, учёные использовали 6 баз данных, среди которых были базы, содержащие структуры сотен миллионов веществ, структуры известных DDR1-киназ и информацию из патентов.


Изначально GENTL произвела 30к потенциальных лекарств, из которых после нескольких раундов фильтрации и тестов была отобрана одна наиболее перспективная молекула (Рис.2).

ИИ от российских учёных создаёт новые лекарства Наука, Искусственный интеллект, Нейронные сети, Химия, Биология, Медицина, Инновации, Длиннопост

Рис.2 — из 30'000 молекул, сгенерированных GENTRL для ингибирования DDR1-киназы учёные отобрали одну самую перспективную, пропустив всю выдачу через различные фильтры и эксперименты.

Некоторым эта статья может показаться скучной, но это только до тех пор, пока они не задумаются о её значении для всей индустрии. GENTRL — первый, но вряд ли последний пример дизайна лекарств с помощью ИИ. В статье показаны только одна мишень, и только одна молекула прошла полный набор доклинических исследований. Но теоретически подобные пайплайны могут быть применены ко многим заболеваниям, выдавая десятки перспективных молекул. У такой парадигмы есть все шансы прочно укорениться и изменить весь ландшафт индустрии.


Низкие издержки на RnD позволят множеству игроков войти в эту отрасль и соревноваться с биг фармой. Лучшее перестанет быть врагом хорошего: разработка менее токсичных и более эффективных аналогов существующих лекарств станет финансово оправдана. Со сниженной стоимостью разработки больше редких заболеваний получат собственные, специфические препараты. И как всегда, рост конкуренции должен отразиться падением цен.


Напоследок я бы хотел отметить, что в данной публикации Nature больше дюжины авторов живут и работают в России. В этом плане статья уникальна (буду рад, если кинете в каменты статьи из группы Nature, где тоже внезапно куча русских). Если несложно, то твитаните оригинальную статью: так вы повысите её Altmetric Score и порадуете аторов.

https://www.nature.com/articles/s41587-019-0224-x

Показать полностью 1
869

Споры, воскрешающие мертвецов — не так уж и абсурдно

На той неделе сидели мы с другом да слушали музыку. Дошли до песни Металлики "All nightmare long", у которой весьма интересный клип.

Для тех, кто его не видел: советские ученые находят в воронке Тчнгзкого (sic!) метеорита споры, которые ускоряют исцеление ран и даже возвращают мертвых к жизни. Через некоторое время споры переделали в биологическое оружие для установления коммунизма на отдельно взятой планете.


Ну, фантастика, да. Посмеялись.

Но не всё так просто. Недавно по Культуре прошёл научпок сериал "Холод". Во 2й серии, где-то начиная с 27', идёт рассказ про тюменских учёных, которые в 2004 выделили "Bacillus Frost" — древнюю реликтовую бактерию из вечной мерзлоты. Эта бактерия у лаб животных не только ускоряет заживление ран, но и улучшает репродуктивную функцию и рост мышц.


Ладно, это просто же документалка. Есть ли что-то за всеми этими заявлениями?

Оказывается, правда есть нормальные публикации по этой Bacillus cereus Strain F, которые ищутся по именам авторов Brouchkov и Malnikov в пабмеде. Вот, например, статья про заживление ран: PMID28948546

А вот про геном этой чудо-бактерии: PMC3731846

А вот про то, как её метаболиты влияют на выработку человеческих цитокинов: PMID28726195

На применения бактерии выпущен ряд патентов: WIPO WO/2012/060729, RU 2413760, UA 96709, UA 101781, UA 102047, UA 103574, UA 10560


В Японии из Bacillus F уже делаются пробиотики — добавки к питанию


Согласно вот этой новостной заметке из 2015 один из исследователей вколол (?) себе Bacillus F и перестал болеть и стал работать дольше


Весьма круто, как по мне.

Но это всё старости, а написать эту заметку меня сподвигла новость по теме:


В Швеции начались клинические исследования генно-модифицированной бактерии, ускоряющей заживление ран при нанесении.


Вот такие дела. Весьма недооценённая тема в биогеронтологии эти бактерии. Все думают, что победа над старостью будет из себя представлять что-то связанное с модификацией генома, наномашинами, какими-то лекарствами, цифровизацией сознания... А теперь ещё есть вариант, что люди будут обмазываться бактериями из мерзлоты или ещё откуда.

Показать полностью
22

Продай мне эту ручку

В 1870х барон Джозеф Листер стал первым пропагандинстом антисептики в хирургии. Он мыл руки, стерилизовал оборудование, носил перчатки — делал всё не так, как его современники.

В 1879м американский химик Джозеф Лоренс назвал в честь этого выдающегося человека антисептический раствор общего назначения на основе спиртовых экстрактов мяты, тмина и эвкалипта — "Листерин".

И этот раствор спокойно торговался до для промывания ран, втирания в волосы и прочих процедур. Но в 1920х очередное поколение производителей решили, что "Листерин" достоен большего.

В итоге "Листерин" стали продавать исключительно как средство для ополаскивания рта.
А чтобы дело шло бойчее, в общественное сознание было решено подселить страх плохого дыхания. Появился ряд чудесных рекламок, персонажи из которых не могут найти работу, не могут жениться, не могут завести друзей — всё из-за плохого запаха изо рта. Что придать научности маркетинговой кампании, активно продвигался почти не используемый ранее медицинский термин "галитоз" вместо обывательского "вонь изо рта".

Самое коварное в галитозе — все вокруг не осмеливаются поднять с его жертвой разговор на столь деликатную тему. Поэтому нельзя знать наверняка, пахнет у тебя изо рта или нет. Поэтому на всякий случай купи ополаскиватель, ты ведь не хочешь остаться без работы из-за такой мелочи?

В итоге за 7 лет такого маркетинга ежегодные прибыли производителя "Листерина" выросли в 70 раз. А мы теперь живём в мире, где борьба с галитозом — часть общественного сознания, и подушки-подружки в принципе не подойдут к человеку, который не пользуется жвачкой или ополаскивателем.


Агрессивный маркетинг ополаскивателя для рта из 1920х: "Галитоз сделает из вас изгоя. Непростителен... но легко устраним. Не лгите себе: поскольку галитоз никогда не заявляет жертве о себе, люди с галитозом просто не догадываются о своей проблеме"


О том, что есть правда, а что есть ложь в мифе о галитозе читайте в этой статье

Продай мне эту ручку Галитоз, Листерин, Медицина, Мифы, Маркетинг, Текст
179

Дважды летальная доза радиации

Все помнят про ядерную аварию на Фукусиме, но далеко не все слышали про катастрофу в Токай. А между тем, это именно катастрофа, в которой погибли двое человек. Смерть одного из них была особенно страшной.

Итак,Токай, Япония, 1999. Во время испытаний экспериментального ядерного реактора неопытные рабочие заливают в него критическую массу раствора уранил нитрата.

Воздух пронизывает чернековское свечение, а людей вблизи реактора сразу же тошнит.


В итоги десятки людей были госпитализированы. Среди них — Хисаши Оуичи, напосредственно заливавший раствор. Он получил дважды летальную дозу радиации и потерял иммунитет.


Врачи прекрасно понимали, что человек в таком состоянии не способен выжить. Даже сегодня самые передовые технологии регенеративной медицины подразумевают, что больной должен предоставить здоровые клетки, из которых потом выращивают какую-либо ткань. Сильнейшая радиация разорвала хромосомы в каждой клетке Хисаши, что лишило их способности делиться и восстанавливать повреждения.

Несмотря на всю безнадёжность ситуации, Хисаши отвезли в Токио и стали "лечить": трансплантации кожи, костного мозга, экспериментальные препараты, медикаментозная кома, массивные переливания крови. Ничего не помогало. Спустя неделю терапии Хисаши уже умолял прекратить опыты над ним.

Тем не менее Хисаши продержали в его разлагающемся теле 83 дня, обещая исцеление.


Страшные фото жертв катастрофы

Детали произошедшего (много букв, английский)

Дважды летальная доза радиации Жесть, Радиация, Катастрофа, Япония, Токаимура, Врачи, Мучители
12

Расширение Еврейской АО

Смотрю новости по Первому, а там такие  вот дела.

Расширение Еврейской АО Новости, Еврейская автономная область, Красноярский край, Ошибка, Первый канал
Расширение Еврейской АО Новости, Еврейская автономная область, Красноярский край, Ошибка, Первый канал
Никогда не понимал, как такие ошибки совершаются. Надо было склепать картинку за 20 секунд до эфира? Автор был абсолютно уверен в своих ошибочных знаниях и даже не перепроверил, почему ЕАО не на Востоке, когда репортаж о Востоке? Надо было подставить редактора? Как?
6540

Всё ради науки

Всё ради науки Наука, Медицина, Альфред Нобель, Язва, Helicobacter pylori

Настоящий учёный стойко переносит лишения выбранного им пути, и Джеймс Маршалл, без сомнения — самый настоящий учёный.


Научное сообщество не воспринимало всерьёз его теорию о том, что язва желудка вызывается не стрессом и не острой пищей, а микробом Helicobacter pylori.

Чтобы доказать свою правоту, Маршалл выделил, вырастил и выпил культуру открытой бактерии. Ждать развития язвы он мог и месяцы, и годы, но тут ему повезло — уже через неделю его тошнило, а от боли сводило живот.


Руководствуясь своей теорией, он стал принимать антибиотики и скоро выздоровел.


Таким образом Джеймс Маршалл в 1984 не только доказал патогенность H.pylori, но и открыл новый способ лечить гастрит.
Из врача-отщепенца он сразу же превратился в мировое светило науки, которое хотели заполучить к себе институты и крупные компании со всего света.


В 2005 Маршалл получил нобелевскую премию в области медицины.


Ссылка

-31

Сын президента — аутист?

Вот в этом посте все потешаются над тем, как странно ведёт себя сына Дональда Трампа — Бэрон.

Тем временем некоторые считают, что причуды Бэррона — не повод для смеха.

Сын президента — аутист? Аутизм, Дональд Трамп, Бэррон, США, Президент, Длиннопост

СМИ давно заприметили странное поведение сына нового президента США. Он постоянно елозит на стуле, корчит рожи и зевает перед камерой, отказывается держать мать за руку и отталкивает обнимающего отца, играет с годовалым племянником, когда отец подписывает указы.

Сын президента — аутист? Аутизм, Дональд Трамп, Бэррон, США, Президент, Длиннопост

Некоторые считают, что Бэррон — просто невоспитаный подросток, но в последние месяцы в  Америке активно обсуждается вопрос: могут ли быть странные повадки сына президента вызваны аутизмом?

Сын президента — аутист? Аутизм, Дональд Трамп, Бэррон, США, Президент, Длиннопост

Полемику в конце ноября начала Рози О'Донелл, давно враждующая с Дональдом Трампом. Её дочь страдает аутизмом и повадки Бэррона ей показались признаками этого заболевания. Впрочем, через две недели Рози принесла свои извинения Мелании Трамп, которая оскорбилась предположением о болезни её ребёнка.

Странное поведение Бэррона она объяснила тем, что он очень устаёт.


====

В общем думайте сами: аутист, не аутист. Скрывает семья, не скрывает.
Просто заметил, что в рунете почти никто и не слышал о сраче Мелания-Рози, и решил просветить

Показать полностью 1
586

Про Ломоносова

Ломоносов, который в 1730 три недели с обозом ехал из Архангельска в Москву за образованием — символ авантюризма и тяги к знаниям.

Михаил Васильевич собирался поступать в навигацкую школу, а в итоге поступил в Славяно-Греко-Латинскую академию.

Некоторые считают, что Ломоносов изменил решение, поскольку только в СГЛА преподавали латынь. На самом же деле, он просто не знал, что навигацкую школу перенесли в Петербург и назвали Морской академией ещё в 1715 году.

Про Ломоносова Михаил Ломоносов, Fail, Образование, Москва, А надо было в питер

Твоё лицо, когда понял, что пришёл не в ту столицу

Опасный Китай: тропа смерти, тобогган с Великой Китайской стены и хардкорный поезд до Шанхая

Опасный Китай: тропа смерти, тобогган с Великой Китайской стены и хардкорный поезд до Шанхая Длиннопост

Наш герой Славик, олицетворяющий собирательный образ путешественника, продолжает колесить по миру (начало тут). Позади горы и яркая Турция. Впереди опять горы и таинственная Азия. В Китае Славик прошелся по дороге смерти и едва не устроил ДТП, спускаясь с Великой Китайской стены. Все основано на реальных событиях, а все совпадения (не)случайны.


В Пекине я запланировал остановку на полтора дня. Для тех, у кого пересадка в столице часов восемь, реально успеть посетить Стену. К ней идет поезд из Сианя. Вообще, многие русские туристы предпочитают путешествовать по Китаю по такому треугольнику: Пекин — Сиань — Шанхай. Так можно быстро посмотреть все самое важное, не рассеивая внимания и время на всю страну — она большая.


Глава 1. Та самая Великая и Китайская


Великая Китайская стена, точнее, одна из ее сторон — Мутяньюй, в двух часах езды от Пекина. Сначала вы едете на метро до станции «Дунчжимэнь», а потом садитесь на автобус до парка Шэньчжэнь.


По фразе «Грейт вол» местные сразу направляют к «нужному» автобусу. Не доезжая до нужной остановки, один китаец стал настойчиво просить меня выйти из автобуса вместе с ним. Я вроде как знал, что мне нужно ехать дальше, но автобус зашумел и буквально выставил на улицу. Как выяснилось, это хитрая схема. Туристов сажают на автобус, не довозят до нужного места, заставляя выйти, а потом предлагают за бешеные деньги доставить их до Стены или парка на машине. Но я и еще один турист оказались не лыком шиты и сторговались за относительно небольшие деньги. Китаец, походу, был разочарован. Позже прочитал множество подобных историй. Будьте бдительны и помните, что англоговорящих в Пекине почти нет. Так что неплохо, помимо иероглифов 不辣 «бу ла» («неострый»), выучить еще несколько.


Что почитать

Как сделать визу в Китай и сколько это будет стоит

Говорят, количество туристов на Великую Китайскую стену сократят. Это правда?

Опасный Китай: тропа смерти, тобогган с Великой Китайской стены и хардкорный поезд до Шанхая Длиннопост

Есть два способа добраться до Стены из парка Шэньчжэнь: пешком или на канатке. Я выбрал второй вариант.


Сама Великая Китайская стена оказалась не такой древней, как я ожидал. Дело в том, что все здесь не столько реставрируют, сколько достраивают. В конце красивого туристического маршрута я увидел нетронутый участок Стены. Это были руины, совсем непохожие на то, что мы привыкли видеть на фотографиях. А потом я увидел строителей и то, как они откровенно достраивали башню там, где ее никогда не было, и совсем загрустил. Не этого я ждал от этого места — ни трепета перед древностью, ни какой-то эпичности я не почувствовал.


Спуститься со Стены можно тоже двумя способами: на канатке или на тобоггане — бесполозных санках, которые едут с вершины по трассе, похожей на бобслейную. На канатке я поднимался, значит, спускаться надо на санях. Ведь все делают что-то впервые: чувствовал себя Роном Уизли, который сел за руль летающего Форда «Англия», чтобы добраться до Хогвартса.

Опасный Китай: тропа смерти, тобогган с Великой Китайской стены и хардкорный поезд до Шанхая Длиннопост

В кабине была только ручка для тормоза — и она нужна! Я люблю скорость, но сани разгонялись так, что я уже готовился вылететь с трассы, поэтому притормаживал. Это было правильным решением. Потому что турист, который спускался передо мной, еле плелся. Я просто чудом не врезался в его сани. Так что будьте осторожны, если решите спускаться на тобоггане. Контролируйте скорость и не зевайте.


Глава 2. Тропа над пропастью и стоячие места в поезде


На скором поезде Пекин — Сиань за пять часов добрался до парка Хуашань, недалеко от города Сиань. Там находится главный аттракцион, ради которого я и прилетел, — Тропа смерти. Увидел однажды на фото и загорелся.

Опасный Китай: тропа смерти, тобогган с Великой Китайской стены и хардкорный поезд до Шанхая Длиннопост

Тропа смерти — это тонкий деревянный настил, прибитый к скале над пропастью, по которому идут испуганные туристы. Платишь деньги, на тебя надевают страховочное снаряжение и отправляют в путь-дорогу. Никаких ограждений. Медленно идешь вдоль скалы, доходишь до конечной точки, делаешь фото на память, разворачиваешься и идешь обратно. При этом нужно разойтись с людьми, которые идут навстречу.


Адреналин я испытал, но на фотографиях выглядит зрелищнее. Может, потому, что я не боюсь высоты, а сама тропа не особо длинная. Больше боялся, что уроню телефон в пропасть, а не за себя. А еще о Тропе писали на Пикабу — почитайте.


Что почитать

Куда слетать на Новый год 2020: идеи для путешествий в праздники

Что делать, если вас обокрали в путешествии


Как добирался от Сианя до Шанхая — отдельная история. В китайских поездах своя классификация мест: лежачие, сидячие и стоячие. Почему-то не думал, что с билетами может быть проблема. В итоге все, что смог купить, — стоячее место. Огромный поезд дальнего следования, куча вагонов, битком набитые людьми. Нет ни одного угла, чтобы забиться или прижаться: 16 часов стоя до Шанхая без надежды поспать. Так я себе представлял индийские поезда. Но вокруг одни китайцы, которые косо на меня поглядывали: мол, парень, что ты здесь забыл? Поездку запомню надолго — абсолютное издевательство.

Опасный Китай: тропа смерти, тобогган с Великой Китайской стены и хардкорный поезд до Шанхая Длиннопост

В Шанхае туристов больше, но чувствуешь себя на удивление комфортнее. Вокруг чисто, при этом плюнуть посреди улицы или прямо в ресторане бросить мусор на пол — норма. Китайцы чем-то напоминают русских: хитростью и пронырливостью. Особенно таксисты. А еще заметно, что в стране не хватает работы. Так, в пекинском метро есть люди, задача которых поторапливать пассажиров заходить в вагон.


Шашлык из скорпиона я съел (не впечатлило), порцию адреналина получил, пора ехать дальше.

Показать полностью 4
Отличная работа, все прочитано!