trazi

пикабушник
поставил 18193 плюса и 1519 минусов
отредактировал 0 постов
проголосовал за 0 редактирований
20К рейтинг 90 подписчиков 1785 комментариев 156 постов 21 в горячем
1 награда
5 лет на Пикабу

Учиться на чужих ошибках

Ежедневно в России сотни людей умирают от коронавируса. Попробую угадать их последнюю мысль перед уходом в кому с трубкой во рту на аппарате искусственной вентиляции лёгких:


"Какой же я дебил, что не вакцинировался. Был бы жив и здоров."



Учитесь на чужих ошибках и не повторяйте их.

Причины техасской энергетической трагедии кратко

Про неё уже много написано, однако подмечаю, что люди рассуждают без фактов или неправильно трактуют графики. Хотел накатать простынь, но подумал, что всем будет пофиг.


В итоге придумал как можно просто и коротко объяснить ситуацию в Техасе без кучи текста и графиков.


В США, Европе, Китае и так далее существенная доля ВИЭ в энергосистеме. Проектировщики энергосистемы не дураки и знают, что каждую ночь не светит солнце и периодически не дует ветер. Поэтому их резервируют газовыми электростанциями. Каждую, допустим, десятую ночь одновременно и не светит солнце, и не дует ветер. Соответственно, каждую десятую ночь работают остальные источники энергии, особенно газ.


Внимание, вопрос: что должно было случиться 15-го февраля в Техасе, когда ночью стукнуло -25°C, обледенела часть ветряков и ветер ослаб? Правильно, должен был дополнительно включиться газ и остальные источники энергии и всё должно было быть ок. Но газ замёрз и не включился...

8

Где автомобилисту в Москве купить квартиру? Big Data отвечает

Транспортная ситуация в Москве похорошела при карантине. Однако красные пятна автодорожных коллапсов в часы пик по-прежнему пестрят на яндекс-карте столицы.

Анализ транспортных вопросов это вычислительно-ёмкий процесс, который вдобавок сложно визуализировать традиционными линейными и другими диаграммами, отсюда редкие публикации по теме. Мы решили заполнить эту лакуну в инфографическом медиапространстве. К тому же в последние месяцы многие решили вложиться в московскую недвижимость, может быть, кому-то наша работа поможет с выбором.

Где автомобилисту в Москве купить квартиру? Big Data отвечает Москва, Транспорт, Инфографика, Диаграмма, График, Жилье, Длиннопост

Для участия в обзоре были отобраны жилые дома Москвы без посёлков и удалённых участков города. Получилось 30'754 дома во всех районах города. Для каждого дома определён маршрут на авто и общественном транспорте в утренний час пик до центра Москвы - Красной Площади. Карты отрисованы с высокой детализацией вплоть до каждого дома и кликабельны. Для упрощения ориентирования наложен слой водных объектов:

Где автомобилисту в Москве купить квартиру? Big Data отвечает Москва, Транспорт, Инфографика, Диаграмма, График, Жилье, Длиннопост

Вопреки центральной симметрии, путь до центра из равноудалённых районов запада и востока различается на полчаса в пользу запада. Южные и юго-восточные районы достигают отметок в полтора часа. Из радиальных направлений лучше всего смотрятся Можайское и Ленинградское шоссе - их окрестности даже около МКАДа подсвечиваются зелёным цветом и добраться до центра реально за полчаса.


Интересно, что районы вне МКАДа на западе и северо-западе выглядят привлекательнее, чем некоторые юго-восточные и северные районы внутри МКАДа. В целом, вся Москва укладывается в один час. Часть домов, выделяющихся относительно соседних, являются статистическими артефактами.


СРЕДНЯЯ СКОРОСТЬ


Время поездки из периферийных районов часто страдает не по причине пробок, а из-за большой удалённости от центра. Для различения причин долгой поездки отобразим среднюю скорость для каждой отправной точки при поездке до центра:

Где автомобилисту в Москве купить квартиру? Big Data отвечает Москва, Транспорт, Инфографика, Диаграмма, График, Жилье, Длиннопост

Бутово на карте помечено не самым плохим зелёным цветом и в центр можно прокатиться с ветерком на скорости 20-25 км/ч. В отличие от Измайлово, где средняя скорость при поездке в утренний час пик составит 15 км/ч. Если дружить со спортом, то можно на спор обогнать авто на своих двоих. Северо-запад для автомобилистов смотрится удивительно - вплоть до 35 км/ч. Эта цифра уже вблизи максимальной разрешённой скорости во многих европейских городах. Хорошо это или плохо - судить не нам.


МАРШРУТЫ АВТО


На карте выше некоторым соседним домам присвоены разные цвета - дело в маршрутах. Для севера Москвы иногда выгодно не сразу направиться в центр, а выехать на МКАД и доехать до центра по Ленинградскому шоссе вместо ближайшего Алтуфьевского или Дмитровского. Аналогично для Измайлово: части района оптимальнее сделать крюк через МКАД и шоссе Энтузиастов вместо Щёлковского шоссе. 30'754 маршрута перегрузят визуализацию, поэтому для наглядности мы нанесли на карту и соединили только ключевые точки у каждого маршрута:

Где автомобилисту в Москве купить квартиру? Big Data отвечает Москва, Транспорт, Инфографика, Диаграмма, График, Жилье, Длиннопост

Таким образом, иногда спасает наличие быстрого выезда на МКАД. На периферии Москвы просматривается множество перпендикулярных участков, напоминающих Гипподамову систему, как на Манхеттене. А в остальном это прямые участки пути до центра.


ОБЩЕСТВЕННЫЙ ТРАНСПОРТ


Если присоединиться к "лиге общественного транспорта", то ситуация выглядит более равномерной. Восток и юг уже не производят удручающего впечатления - в метро нет пробок:

Где автомобилисту в Москве купить квартиру? Big Data отвечает Москва, Транспорт, Инфографика, Диаграмма, График, Жилье, Длиннопост

Внутри МКАДа негативно смотрятся только Дмитровский район и Бирюлёво, у которых до сих пор нет быстрого доступа к метрополитену.


МАРШРУТЫ ОБЩЕСТВЕННОГО ТРАНСПОРТА


Граф маршрутов общественного транспорта аналогичен автомобильному. Множество перпендикуляров к радиальным линиям, ведущим в центр:

Где автомобилисту в Москве купить квартиру? Big Data отвечает Москва, Транспорт, Инфографика, Диаграмма, График, Жилье, Длиннопост

Метро используется в 86% маршрутах, автобус с троллейбусом в 60%. Трамвай москвичами используется незначительно, как и электрички.


АВТО vs ОБЩЕСТВЕННЫЙ ТРАНСПОРТ


Устроим логистическое соревнование между авто и общественным транспортом - кто быстрее. Из каждого дома по два жителя выезжают в центр: один на авто, другой "своим ходом". Результаты соревнования на карте:

Где автомобилисту в Москве купить квартиру? Big Data отвечает Москва, Транспорт, Инфографика, Диаграмма, График, Жилье, Длиннопост

Анализ показывает, что в случае 19'566 (64%) домов победу одержит автомобилист и в 11'188 (36%) домах любитель общественного транспорта. Северная, восточная и южная оконечности Москвы плохо приспособлены для водителей и даже в карантин оттуда быстрее добираться на общественном транспорте, выиграв десяток-другой минут.


Однако у "красных" домов, расположенных преимущественно на окраинах, выше средняя этажность и в них проживает больше людей. Получается особая форма жилищно-транспортного неравенства: большая часть населения живёт в меньшей части домов, для которых неудобен автомобиль. И наоборот.


Самые большие значения для синего поля, то есть преимущество авто в 40 минут, находятся на окраине Куркино - район спроектирован с низкой плотностью населения, с него есть прямой выход на МКАД и далее на Ленинградское шоссе, а вот с общественным транспортом гораздо хуже - метро и электричка далеко. Из-за отсутствия быстрого доступа к подземке выделяется и Дмитровский район.


Пользователи общественного транспорта получат наибольшее преимущество в случае Бирюлёво и Измайлово, сэкономив полчаса относительно авто.


РАСПРЕДЕЛЕНИЕ СРЕДНЕЙ СКОРОСТИ


Медиана распределения средней скорости авто в час пик составляет 22.6 км/ч. Без пробок на 5 км/ч больше:

Где автомобилисту в Москве купить квартиру? Big Data отвечает Москва, Транспорт, Инфографика, Диаграмма, График, Жилье, Длиннопост

ГЕОМЕТРИЯ МАРШРУТОВ


К счастью для автомобилистов московские улочки не петляют бездумно по городу. В среднем маршрут всего на 23% длиннее чем путь по прямой. Присутствуют и исключения: для некоторых домов на удалении 15 километров от центра оптимальные маршруты в час пик приближаются к 35 километрам. Это как раз случаи ухода на МКАД и проезда в центр по соседним радиальным шоссе. Всё это можно увидеть по такой диаграмме:

Где автомобилисту в Москве купить квартиру? Big Data отвечает Москва, Транспорт, Инфографика, Диаграмма, График, Жилье, Длиннопост

И напоследок время поездки в центр на автомобиле и общественном транспорте в разбивке по районам:

Где автомобилисту в Москве купить квартиру? Big Data отвечает Москва, Транспорт, Инфографика, Диаграмма, График, Жилье, Длиннопост

Анализировать, рисовать карты и строить диаграммы можно бесконечно, как смотреть на костёр или течение реки. Однако во всём должна быть мера и графический лонгрид подходит к концу. Оставайтесь с нами, мы постараемся продолжить радовать вас инфографикой и анализом по редким, но интересным темам!


Источник: https://celado-ai.ru/blog/Where-can-a-motorist-buy-an-apartm...

Показать полностью 9
12

Что запустило "ядерную зиму" после падения чиксулубского метеорита (минус динозавры)

Один из источников сажи в воздухе после удара чиксулубского метеорита - масштабные лесные пожары на территории америк.


Второй - горение углеводородов из осадочных пород. Метеорит угодил в карбонатную платформу, высвободив углерод из недр.


Если смотреть на отложения того времени в разных частях планеты, то соотношения полициклических ароматических углеводородов (>=2 бензольных колец) и их паттерны алкилирования указывают на горение, в основном, углеводородов из осадочных пород, а не лесов.


Так остановился фотосинтез на нашей планете и началось мел-палеогоновое массовое вымирание.


https://www.pnas.org/content/117/41/25327

https://agupubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/201...

13

Сконструировали искусственное антитело, ингибирующее s-протеин коронавируса

Оно в 20 раз меньше естественного антитела. Протестировали на мышах и хомяках - работает. Для производства (экспрессии) не нужны клетки млекопитающих - для правильного фолдинга достаточно чего попроще.


https://science.sciencemag.org/content/early/2020/09/08/scie...

https://www.scientificamerican.com/article/lab-made-miniprot...

68

Прикольные места и пляжи Крыма

С востока на запад.

1. город Керчь. Водяная станция с вышками для прыжков в воду высотой 3, 5, 7 метров:

Прикольные места и пляжи Крыма Крым, Пляж, Длиннопост

2. город Керчь. Ансамбль античных колонн:

Прикольные места и пляжи Крыма Крым, Пляж, Длиннопост

3. деревня Курортное. Солёно-грязевое озеро Чокрак. Можно обмазаться всяким говном:

Прикольные места и пляжи Крыма Крым, Пляж, Длиннопост

4. деревня Азовское - деревня Мысовое. Безлюдные и бесконечные пляжи Татарской бухты:

Прикольные места и пляжи Крыма Крым, Пляж, Длиннопост

5. посёлок Новый Свет. Тропа Голицина. Изящная тропа по побережью и горам, есть интересные места для купания

Прикольные места и пляжи Крыма Крым, Пляж, Длиннопост

6. посёлок Форос. Скалы над Форосом. Тропа на скалы начинается чуть выше Форосской церкви:

Прикольные места и пляжи Крыма Крым, Пляж, Длиннопост

7. город Ялта. Ботанический сад с пальмами, бамбуком, кипарисами и т.п.:

Прикольные места и пляжи Крыма Крым, Пляж, Длиннопост

8. город (район) Балаклава. Скалы, мыс Фиолент. Можно взять напрокат байдарку, поплавать вдоль отвесных скал, покупаться:

Прикольные места и пляжи Крыма Крым, Пляж, Длиннопост

9. город Севастополь. Набережная. Единственная набережная Крыма без примитивного курортного развлекалова, более творческая и культурная.



10. город Евпатория. Исторический центр:

Прикольные места и пляжи Крыма Крым, Пляж, Длиннопост

11. Мыс Тарханкут. Спуск к воде у "Аллеи Вождей". Можно попрыгать со скал, справа в 10 метрах от спуска есть подводный подплыв под скалой с глубиной около 2 метров. На нём можно потренироваться перед подводным участком у чаши любви:

Прикольные места и пляжи Крыма Крым, Пляж, Длиннопост

11. мыс Тарханкут. Чаша любви. С 9 утра толпы народа. Со стороны моря в "чашу" есть подводный подплыв глубиной около 3.5 - 4 метров. Если не уметь продуваться, то есть реальные риски повредить что-то ушное при подплыве. Хорошо бы иметь маску, ласты:

Прикольные места и пляжи Крыма Крым, Пляж, Длиннопост

12. мыс Тарханкут. пляж с прозрачной водой в 2.5 км к западу от деревни Морское:

Прикольные места и пляжи Крыма Крым, Пляж, Длиннопост

Помимо прикольных мест, рекомендую следить за северными и северо-восточными ветрами на азовском побережье: при ~ 15 м/с будут прикольные волны. На чёрном море норм волны редкость.

Показать полностью 10
463

Как мутирует коронавирус и насколько это плохо? Смотрим на реальных примерах

Для тех, кто в детстве читал научно-популярные книги 1970-х годов по техническим дисциплинам, давно уже настали скучные времена: про бозон Хиггса или особенности горизонта событий заряженной вращающейся чёрной дыры можно было прочитать ещё полвека назад. Сегодня областью, за прогрессом в которой сложно уследить, является биология. И если рунет заполнен материалами по техническим дисциплинам, что традиционно для России, то биология и биоинформатика представлены крайне слабо.


За последние 18 лет стоимость секвенирования человеческого генома упала в сто тысяч раз до $1000. При этом длина генома человека это три миллиарда нуклеотидов, а геном коронавируса SARS-CoV-2 состоит из всего 30 тысяч нуклеотидов. Учитывая дешевизну и актуальность, множество геномов коронавируса уже секвенировано и выложено в открытый доступ.

Как мутирует коронавирус и насколько это плохо? Смотрим на реальных примерах Научпоп, Наука, Биоинформатика, Геном, Туториал, ДНК, Видео, Длиннопост, Коронавирус

Геном коронавируса настолько короткий, что его можно открыть как текстовый файл в блокноте, а различия в нуклеотидной последовательности двух разных геномов видны невооружённым взглядом.


Скачать геномы одной кнопкой можно в GenBank'e , там же есть и начальный, референсный геном от декабря 2019 года из китайского Уханя. Геном это последовательность из всего четырёх типов нуклеотидов - А/Г/Т/Ц, то есть аденин, гуанин, тимин, цитозин. Соответственно, кроме минимальной описательной части и кучи букв A/G/T/C там ничего и нет. Пожалуй, это один из тех редчайших случаев, когда сбор данных для анализа занимает меньше времени, чем сам анализ.

Как мутирует коронавирус и насколько это плохо? Смотрим на реальных примерах Научпоп, Наука, Биоинформатика, Геном, Туториал, ДНК, Видео, Длиннопост, Коронавирус

Геномы коронавируса. Слева "начальный" геном из китайского Уханя от 2019 года, справа от 24 марта 2020 года, взятый у одного из инфицированных в США. Начало первого гена в геноме выделено синим цветом. Для удобства просмотра последовательность делят на столбцы одной ширины.



Что есть что?


К счастью, уже построена карта генома и известны нуклеотидные последовательности всех генов коронавируса. Например, первый ген кодирует белок orf1a, его первые 21 нуклеотида такие: ATGGAGAGCCTTGTCCCTGGT - как раз найдены и выделены на скриншоте. Зная начальные и конечные участки генов, не говоря уже о генах целиком, несложно разметить геном и понять что есть что в данном экземпляре коронавируса.



"Мусорная" ДНК


Какие-то участки генома не входят ни в один ген - это мусорная ДНК (РНК), которая не несёт наследственной информации и может мутировать (изменяться) как ей вздумается без вреда и пользы для вируса. Мусорной ДНК сформированы промежутки между генами, а также самое начало и конец генома. На картинке выше первые несколько строк как раз представляют из себя мусорную ДНК, и, например, первая строка не совпадает.



S-протеин


Так как геном во всех своих частях по сути одинаковый набор букв А/Г/Т/Ц, то для простоты анализа можно сфокусироваться на участке генома - на каком-нибудь одном гене.

За проникновение вируса в клетку отвечают белки (s-protein), выглядящие как шип на поверхности, в совокупности образующие ту самую "корону", давшую название этому типу вирусов. Именно на эти белки направлены создающиеся сейчас вакцины, которые должны остановить распространение эпидемии.


Если s-протеин мутирует быстро и сильно, то вакцины не будут поспевать за новыми мутациями, как в случае сезонного гриппа, Если медленно, то одна вакцина избавит человечество от проблем надолго.


Мутации гена, отвечающего за кодирование s-протеина мы и рассмотрим.

Как мутирует коронавирус и насколько это плохо? Смотрим на реальных примерах Научпоп, Наука, Биоинформатика, Геном, Туториал, ДНК, Видео, Длиннопост, Коронавирус

Схематичное изображение коронавируса. S-протеин отмечен вверху справа



От слов к нуклеотидам


Весь геном коронавируса это около 30'000 "букв". Последовательность нуклеотидов гена s-протеина известна, их всего 3822 штуки. Вот, например, первые пятьдесят:

ATGTTTGTTTTTCTTGTTTTATTGCCACTAGTCTCTAGTCAGTGTGTTAA


Вот последние пятьдесят:

АAGACGACTCTGAGCCAGTGCTCAAAGGAGTCAAATTACATTACACATAA


Если, как Микеланджело, в каждом геноме отрезать всё что до этих первых пятидесяти букв и после последних пятидесяти, то останется ген s-протеина. Поместив каждый ген в строку экселя удобно подмечать мутации. Например, на скриншоте ниже у некоторых гонконгских инфицированных на 22-й позиции стоит G вместо обычного T:

Как мутирует коронавирус и насколько это плохо? Смотрим на реальных примерах Научпоп, Наука, Биоинформатика, Геном, Туториал, ДНК, Видео, Длиннопост, Коронавирус

Скриншот с общими данными по геному и начальной частью гена s-протеина. Стрелками отмечены мутации (замены) Т -> G



Мутации


Геном или один ген это просто наследственная информация. По этой информации производится то, что уже в дальнейшем будет функционировать - белок (1 ген -> 1 белок). Мутация в гене это, обычно, и в нашем случае, замена одной "буквы" на другую. Некоторые мутации в гене приводят к изменению белка, некоторые нет. Некоторые слабо изменяют белок, некоторые сильно, что скорее всего приведёт к недееспособности вируса, так как сделанный по сильно мутированному гену белок будет неправильным и не сможет выполнять свои функции. С другой стороны, против изменённого белка может не подействовать вакцина, спроектированная под предыдущую "версию".


Пройтись циклом по всем геномам, найти ген s-протеина и поискать замены относительно начальной версии от 2019 года это несколько десятков строк простого программирования.



Визуализация


Традиционные линейные или столбчатые диаграммы не подходят для отображения 3822 нуклеотидов и их замен. Для наглядности удобнее расположить последовательность нуклеотидов как текст, слева направо, сверху вниз, а наличие мутации и их количество заменить цветом поля:

Как мутирует коронавирус и насколько это плохо? Смотрим на реальных примерах Научпоп, Наука, Биоинформатика, Геном, Туториал, ДНК, Видео, Длиннопост, Коронавирус

Wake up, Neo...


Цветами обозначено количество вариантов для данной "буквы" среди проанализированных геномов. Например, жёлтый цвет означает, что для данного нуклеотида существуют все три возможных варианта мутации и каждый из которых приводит к немного другой белковой молекуле. Если для "буквы" существует только одна мутация, и та безобидная, то цвет - ближайший к начальному фиолетовому.


Анимация по дням:

Мутации, мягко говоря, присутствуют, не одна и не две, и большинство несинонимичные. То есть те, которые изменяют белок "шипа" коронавируса. Но много это или мало в контексте мутации вируса и вакцин?


Исследователи говорят, что коронавирус SARS-CoV-2 мутирует относительно медленно. Например, сезонный грипп мутирует в разы быстрее. То есть можно рассчитывать, что вакцины, которые уже проходят клинические испытания на людях в семи лабоработориях, будут актуальны и эффективны продолжительный период времени. Раз так, ждём вакцину! =)


Источник: http://celado-ai.ru/blog/How-coronavirus-mutates-and-how-bad-is-it

Показать полностью 4 1
10

Количественный прогноз распространения коронавируса в Москве

Плюс ключевые тайминги, которые важны для понимания причинно-следственных связей и динамики.


Чтобы спрогнозировать данные по заболевания новым коронавирусом в Москве, достаточно внимательно изучить его статистику по провинциям Китая, где уже прошёл как пик новых случаев заболевания, так и текущих больных и вообще давно всё закончилось.


На основе этих данных мы построим модель, проверим её на Италии и далее построим для Москвы.


Ключевым фактором, влияющим на распространение болезни является введение карантина. Почти во всех провинциях Китая он был введён 24-25 января.

Распространение вируса после карантина:

Количественный прогноз распространения коронавируса в Москве Коронавирус, Моделизм, Модели, График, Эпидемия, Длиннопост

Как видно, пик новых зафиксированных инфицированных в сутки возникает примерно на 9-12 день карантина. Эти цифры оказались одинаково верны как для провинций Китая так и для Испании и Италии.


Сравнение по количеству инфицированных не показало зависимости длительности эпидемии от числа инфицированных:

Количественный прогноз распространения коронавируса в Москве Коронавирус, Моделизм, Модели, График, Эпидемия, Длиннопост

Статистика показывает, что на момент пика новых случаев количество заболевших равно примерно половине от общего числа тех, кто заболел:

Количественный прогноз распространения коронавируса в Москве Коронавирус, Моделизм, Модели, График, Эпидемия, Длиннопост

То есть снижение числа заболевших будет происходить примерно так же как до этого шёл рост. Общее число заболевших хорошо описывается S-кривой:

Количественный прогноз распространения коронавируса в Москве Коронавирус, Моделизм, Модели, График, Эпидемия, Длиннопост

Если взять ту же модель для Италии и методами машинного обучения подобрать коэффициенты, то модель показывает следующие значения:

Количественный прогноз распространения коронавируса в Москве Коронавирус, Моделизм, Модели, График, Эпидемия, Длиннопост

Как видно, итальянский кейс также описывается математикой, которая была в Китае. Модель, приложенная к текущим данным по Москве, показывает следующий результат:

Количественный прогноз распространения коронавируса в Москве Коронавирус, Моделизм, Модели, График, Эпидемия, Длиннопост

Пик новых заболевших в день будет примерно 9 апреля, пик находящихся в стадии болезни - 17 апреля. Новые случаи прекратятся лишь к концу апреля. Всё это в условиях строго карантина.


Отсюда: https://celado-ai.ru/blog/Covid-Disease-Peak-Forecast-in-Moscow

Показать полностью 5

Третьеклассник-двоечник участвует в наполнении контентом одного из самых популярных сайтов рунета

Орфографическая ошибка из третьего класса на заглавном сайте компании с оборотом миллиард долларов.


Ребята, у меня для вас коммерческое предложение! Наймите пятиклассника за конфеты, чтобы он чекал вам контент.

Третьеклассник-двоечник участвует в наполнении контентом одного из самых популярных сайтов рунета Mail ru, Орфография

Думал, что дно, но снизу постучали

Отличная работа, все прочитано!