Горячее
Лучшее
Свежее
Подписки
Сообщества
Блоги
Эксперты
#Круги добра
Войти
Забыли пароль?
или продолжите с
Создать аккаунт
Я хочу получать рассылки с лучшими постами за неделю
или
Восстановление пароля
Восстановление пароля
Получить код в Telegram
Войти с Яндекс ID Войти через VK ID
Создавая аккаунт, я соглашаюсь с правилами Пикабу и даю согласие на обработку персональных данных.
ПромокодыРаботаКурсыРекламаИгрыПополнение Steam
Пикабу Игры +1000 бесплатных онлайн игр Уникальная игра, объединяющая популярные механики Match3 и пошаговые бои!

Магический мир

Мидкорные, Ролевые, Три в ряд

Играть

Топ прошлой недели

  • AlexKud AlexKud 38 постов
  • Animalrescueed Animalrescueed 36 постов
  • Oskanov Oskanov 7 постов
Посмотреть весь топ

Лучшие посты недели

Рассылка Пикабу: отправляем самые рейтинговые материалы за 7 дней 🔥

Нажимая кнопку «Подписаться на рассылку», я соглашаюсь с Правилами Пикабу и даю согласие на обработку персональных данных.

Спасибо, что подписались!
Пожалуйста, проверьте почту 😊

Помощь Кодекс Пикабу Команда Пикабу Моб. приложение
Правила соцсети О рекомендациях О компании
Промокоды Биг Гик Промокоды Lamoda Промокоды МВидео Промокоды Яндекс Директ Промокоды Отелло Промокоды Aroma Butik Промокоды Яндекс Путешествия Постила Футбол сегодня
0 просмотренных постов скрыто
9
Programma.Boinc
Programma.Boinc
4 года назад

Новый код на основе метода Монте-Карло для решения уравнений лучистого переноса⁠⁠

В новом исследовании Сяолинь Ян (Yang Xiaolin) и его коллеги из Юньнаньской астрономической обсерватории Академии наук Китая разработали новый быстрый код под названием Lemon (Linear Integral Equations" Monte Carlo Solver Based on Neumann Solution), который предназначен для точного решения уравнений лучистого переноса. Схема построения этого кода основана на линейном интегральном уравнении и серии его решений, называемой серией Ньюмана.


Лучистый перенос представляет собой широко распространенный в астрофизике процесс, который играет большую роль как в теоретических исследованиях, так и в практических наблюдениях. Для решения уравнений лучистого переноса были предложены различные методы, среди которых метод Монте-Карло является наиболее важным и широко используемым численным методом из-за его простоты и высокой производительности.


Обычная реализация метода Монте-Карло (или схема отслеживания фотонов), однако, имеет неотъемлемый недостаток, состоящий в том, что в результате проведения большого количества вычислений достигается не очень устойчивое решение с высокими величинами отклонений, поэтому большая часть вычислительных мощностей расходуется впустую.


Для преодоления этого недостатка Сяолинь Ян и его коллеги предложили новую схему, в которой они предлагают использовать для решения уравнений лучистого переноса интегральное уравнение и его ньюмановское решение вместо отслеживания фотонов.

У этой новой схемы есть значительные преимущества. Она предполагает учет вклада фотонов в итоговый результат на каждом участке рассеяния, что существенно повышает эффективность и точность расчетов.


В результате описанный выше недостаток метода удается устранить. Метод может быть использован как для уравнений лучистого переноса, в которых присутствует поляризация излучения, так и для уравнений, описывающих неполяризованное излучение, в рамках единого подхода. Процедура расчета упрощается, если система имеет осевую или сферическую симметрию. Кроме того, метод может быть применен напрямую для решения любых дифференциально-интегральных уравнений с корректно указанными начальными или граничными условиями.


Код Lemon разработан полностью на этих новых принципах и написан на языке FORTRAN 90. Он находится в открытом доступе и может быть скачан по ссылке: github.com/yangxiaolinyn/Lemon

Исследование появилось на сервере предварительных научных публикаций arxiv.org.

Новый код на основе метода Монте-Карло для решения уравнений лучистого переноса Программирование, Новый код, Уравнение, Fortran
Показать полностью 1
Программирование Новый код Уравнение Fortran
3
Programma.Boinc
Programma.Boinc
4 года назад

Ваш компьютер может помочь в поиске лекарства от рака и СПИДа"⁠⁠

Ваш компьютер может помочь в поиске лекарства от рака и СПИДа".


Предстоящие изменения кода помогут улучшить отображение маркеров рака


3 декабря 2020 Резюме


В этом обновлении группа исследователей Mapping Cancer Markers объясняет, как относительно небольшое изменение кода может сильно повлиять на способность проекта анализировать маркеры для различных типов сарком.


Background


Картирование раковых маркеров направлено на идентификацию маркеров (иногда называемых сигнатурами), связанных с различными типами рака. В рамках проекта анализируются миллионы точек данных, собранных из тысяч образцов тканей здоровых и злокачественных пациентов. До сих пор это были ткани с раком легких, раком яичников и саркомой. Но мы расширяем наши возможности работы с наборами данных. Скоро будут внесены изменения в код для улучшения проекта Mapping Cancer Markers. Эти изменения расширят возможности приложения Mapping Cancer Markers работать с наборами данных с несколькими метками и позволят ему искать в них более конкретные сигнатуры.


Рисунок 1A

Ваш компьютер может помочь в поиске лекарства от рака и СПИДа" Наука, Помощь, Отображение, Новый код, Длиннопост

(вверху): это представляет набор данных саркомы с семью подтипами образцов. При сопоставлении маркеров рака можно использовать набор данных с несколькими метками как есть и искать мультиклассовые (один против всех) сигнатуры. (Программное обеспечение проекта теперь может это сделать.)

Перед набором данных о саркоме проект проанализировал наборы данных о раке легких и яичников, оба из которых имеют двоичные метки. В нашем наборе данных о раке легких образцы помечены как «рак» или «без рака». В нашем наборе данных по яичникам образцы помечены как короткая или длительная выживаемость. Набор данных саркомы состоит из нескольких меток и маркирует образцы с семью различными подтипами саркомы (см. Рисунок 1A выше).


Рисунок 1B

Ваш компьютер может помочь в поиске лекарства от рака и СПИДа" Наука, Помощь, Отображение, Новый код, Длиннопост

На рисунке 1B (выше) показано, как MCM может уменьшить саркому до двоичного набора данных, разделив подтипы на две группы и ища двоичные сигнатуры. (Программное обеспечение проекта теперь может это сделать.)


Рисунок 1С

Ваш компьютер может помочь в поиске лекарства от рака и СПИДа" Наука, Помощь, Отображение, Новый код, Длиннопост

На рисунке 1C показан альтернативный вариант сокращения двоичного набора данных. (Программное обеспечение проекта теперь может это сделать.)


Если в наборе данных есть двоичные метки, Mapping Cancer Markers найдет сигнатуры, которые могут предсказать эту двоичную метку. Однако с помощью набора данных с несколькими метками мы можем направить отображение маркеров рака для поиска либо двоичных, либо многоклассовых сигнатур (примеры см. На рисунках 1B и 1C выше).


В настоящее время проект ищет оба в наборе данных по саркоме. Сигнатура мультиклассовой саркомы отличает каждый подтип от любого другого; учитывая любой образец саркомы, он диагностирует конкретный подтип рака. Бинарная сигнатура саркомы отличает одну группу подтипов от остальных, но не отличает конкретные подтипы. Например, среди семи подтипов саркомы есть два подтипа леймиосаркомы (ЛМС), мягкотканная и маточная. Mapping Cancer Markers в настоящее время направлен на поиск двоичных сигнатур, которые отличают LMS от остальных.


Рисунок 1D

Ваш компьютер может помочь в поиске лекарства от рака и СПИДа" Наука, Помощь, Отображение, Новый код, Длиннопост

На рисунке 1D показано, как новые возможности картирования онкологических маркеров позволят рабочему подразделению сосредоточиться на определенных подтипах. Исключенные образцы выделены серым цветом и перечеркнуты. (Новый код.)


Рисунок 1E

Ваш компьютер может помочь в поиске лекарства от рака и СПИДа" Наука, Помощь, Отображение, Новый код, Длиннопост

На рис. 1Е показаны новые возможности картирования онкологических маркеров в полном объеме, за исключением отдельных образцов и изменения их меток.


Обозначенные образцы обведены черным контуром. (Новый код.)


Планируя переход проекта к саркоме, мы поняли, что у наших экспертов по саркоме были научные вопросы о саркоме, которые они хотели изучить, и которые требовали большей гибкости в дизайне рабочих единиц, чем это было возможно с существующим приложением. Они хотели изучить различия между двумя или более конкретными подтипами саркомы и исключить другие из анализа (см. Рисунок 1D). (Например, они хотели изучить биомаркеры, которые различают подтипы LMS.)


К сожалению, возможность исключения образцов не была встроена в исходное приложение Mapping Cancer Markers. Работая вместе, команда Mapping Cancer Markers разработала небольшое расширение для приложения, которое добавит необходимые возможности, обеспечит дополнительную гибкость для будущих потребностей и сохранит обратную совместимость, минимизируя при этом общие изменения кода (рисунок 1E). За последние месяцы волонтеры World Community Grid обработали тысячи рабочих единиц для бета-тестирования нового кода. Эти изменения дают нам возможность вносить мелкие корректировки, которые адаптируют набор данных к конкретному вопросу, который будет исследовать каждое рабочее подразделение.


Спасибо всем, кто поддерживает Mapping Cancer Markers.


Хотите принять участие в борьбе против рака с туберкулезом, тогда, Вам сюда:


https://boinc.ru

Показать полностью 5
Наука Помощь Отображение Новый код Длиннопост
1
49
Mihip
Mihip
10 лет назад

Новогодняя ёлка⁠⁠

Написано на fast assembler-e :)
Новогодняя ёлка Написано на fast assembler-e :)
[моё] FASM Fast Assembler Фаст ассемблер Assembler Моё Код Новый код Новый год
2
9
Fona
Fona
11 лет назад

Disney's Frozen "Let It Go"⁠⁠

Walt Disney Company Мультфильмы Холодное сердце Песня Снег Новый код Красота Видео
6
Посты не найдены
О нас
О Пикабу Контакты Реклама Сообщить об ошибке Сообщить о нарушении законодательства Отзывы и предложения Новости Пикабу Мобильное приложение RSS
Информация
Помощь Кодекс Пикабу Команда Пикабу Конфиденциальность Правила соцсети О рекомендациях О компании
Наши проекты
Блоги Работа Промокоды Игры Курсы
Партнёры
Промокоды Биг Гик Промокоды Lamoda Промокоды Мвидео Промокоды Яндекс Директ Промокоды Отелло Промокоды Aroma Butik Промокоды Яндекс Путешествия Постила Футбол сегодня
На информационном ресурсе Pikabu.ru применяются рекомендательные технологии