Ответы к посту
Как я проходил ДНК-тест
8

Ответ на пост «Как я проходил ДНК-тест»

Американцам повезло больше. Они могут совершенно бесплатно отследить свои корни на 1000 (!!!) лет назад.

Эту возможность, не поверите, предоставляет сайт мормонов. Если забить в поиск на английском слова мормоны+ генеалогия, то первым как-раз нужный сайт и будет.

Сайт очень простой в обращении. Забиваешь имя интересующего тебя человека и смотришь, с кем он связан родством. Можно вывести результаты в виде древа, которое, разветвляясь, уходит на многие столетия назад.

Для того, чтобы сайт стал возможным, мормоны отсканировал и обработали огромное количество публично доступных документов. Некоторые записи начала 20, конца 19 века даже содержат фотографии.

Кстати, если помните, в 90-х и начале 00-х мормоны приезжали и в Россию. И тоже сканировали и обрабатывали записи из ЗАГСов.

Россия в итоге не разрешила выкладывать эту информацию в свободный доступ, и десять лет назад она была доступна лишь в так называемых информационных центрах мормонов. На тот момент там была доступна следующая информация по России:

Россия

Россия, Бракосочетания, 1793-1919 
Россия, Нижний Новгородская перепись подушного налога (ревизские сказки), 1782-1858
Россия, Рождения и крещения, 1755-1917
Россия, Самарские Акты гражданского состояния, 1918-1922
Россия, Самарские метрические книги, 1779-1923
Россия, Симбирская перепись подушного налога (ревизские сказки), 1782-1858
Россия, Симбирские метрические книги, 1768-1939
Россия, Смерти и Погребения, 1815-1917 
Россия, Татарстанская перепись подушного налога (ревизские сказки), 1719-1859
Россия, Татарстанские метрические книги, 1721-1939
Россия, Тверская перепись подушного налога (ревизские сказки). 1744-1874
Россия, Тверские исповедные ведомости, 1728-1913
Россия, Тверские метрические книги, 1722-1918 
Россия, дубликаты Лютеранских метрических книг, 1833-1885

Понятно, что мормоны делали всю эту работу со своей личной целью - они верят, что обратить в Христианство можно любого человека при должном желании. Даже, если он жил 500 лет назад в районе Саудовской Аравии. Нужно лишь знать имя этого человека.

Ну в любом случае, какой бы ни была их цель, побочный продукт получился очень полезным и интересным.

Показать полностью
0

Ответ на пост «Как я проходил ДНК-тест»

Абсолютно согласна. Тест показывает во-первых: с учётом политических границ сегодняшнего дня. И это реально странно и смешно. Для интереса посмотрите на карты прошлого, позапрошлого, позапозапрошлого века. И найдите 100 отличий.

Так и база у него преимущественно из тех, кто сдавал в Москве, Подмосковье, максимум центральной России. И это будет то, что люди, которые дальше своих родителей-дедов не знают, указали в качестве их населённых пунктов жизни, рождения и смерти. С ошибками.

Моих коренных народностей не увидел (Дальневосточные и сибирские, они тесты не сдавали). Но зато, когда я составила длиннющее древо и подписала места рождения и смерти моих прародителей и тд.., вся эта информация подтянулась к моему братику, который сдал позднее меня. Если бы я, ради прикола, указала бы ложную инфу, это бы отразилось и у него в этническом составе.

К слову, это не только генотека проблема. Знакомые сдавали в 23эндми, там тоже шнягу по этносу показывает.

Но полезную инфу, немножко, но все-таки я для себя там откопала.

Насчёт меня, может 50% правды есть. Но база маленькая. У меня крови редкие для РФ, возможно. Не хватает данных. И плохо, что подтягивается косячная информация пользователей. Мало, кто знает точную информацию о предках и записи "со слов" не отражают картину мира.

Тем более, в СССР все переезжали с места на место на протяжении жизни. И человек, родившийся, на юге, корней может южных вовсе и не иметь, а исключительно, уральские например. Однако, в древе он будет указан как родившийся на юге. Генотек это считывает, как южный генофонд. Поэтому очень много вопросов, касательно национальностей.

Поэтому нет ничего лучше ручного поиска по архивам и сборам сведений по росдственникам. Как ни странно, родственники обладают более точной информацией, чем генетические исследования (пока).

А поиграться прикольно. В целом, довольна. Кое-что они все-таки подтвердили. Например, бабушка вспомнила, что её мать действительно из рода нагайбаков и мишари где-то пробегали.

Так что, в целом, инфу можно накопать/подтвердить частично, но все перепроверять требуется. Многое очень тест не видит, так как база сдаваших, весьма ограничена. С европейцами вообще проблема по тесту

P.S. Есть ещё один популярный тест генетический, у них база в Израиле. Так всех он показывает как евреев. Потому что база сдававших, преимущественно израильтяне.

Доверяй, но проверяй :)

На побаловаться и найти новое хобби - просто отлично. Составить древо - очень вряд ли, только если очень повезёт.

Показать полностью
61

Ответ на пост «Как я проходил ДНК-тест»

Это всё работает не так. У Генотека есть база образцов с анкетными данными этнической принадлежности + открытые международные базы, включая данные палеоДНК. Используя определённые алгоритмы (популяционные калькуляторы можно посмотреть на Гедматч, там есть сноски на научные статьи, в которых обосновывается механизм расчёта) данные секвенирования преобразуются в набор координат и далее через PCA схлопываются до двух точек, которые можно отразить на координатной сетке и показать на графике для наглядности. А "проценты" схожести высчитывают через суммаризацию евклидова (или иного) расстояния между образцами.

Короче такой тест показывает "кто ты" в пределах собранной выборки, и это на самом деле маркетинговый ход. Настоящая ценность таких тестов в сырых данных, с которыми можно работать дальше, так как позволяет находить боковые ветви своего генеалогического дерева плюс оценивать себя относительно палеоДНК, а с ними всегда есть описание где найдены и среди какой археологической культуры.

И да, Генотек дорогой, FTDNA делает в два раза дешевле и с бОльшим покрытием (но и Генотек делает честно, это настоящий анализ). Если вы не понимаете нахрена вам это - не тратьте деньги впустую.

42

Ответ на пост «Как я проходил ДНК-тест»

В общих чертах ваш геном (не весь, а только наиболее общие, не редкие и независимые варианты, закодированные как 0 - если обе копии аллели референсные, например АА, 1 - если гетерозигота АT, и 2 - если TT) добавляется в матрицу к референсной выборке, состоящей из таких же геномов других людей. Чем разнообразнее и больше выборка, тем лучше.

Далее проводится principal component analysis, который уменьшает размерность матрицы до нескольких наиболее значимых векторов. Вектора 1 и 2 чаще всего используются для визуализации кластеров, как на картинке ниже. Т.е. люди, которые генетически ближе друг к другу, будут рядом. Чтобы определить с какой-то точностью, к какой группе ты определен, проводится анализ кластеризации на этих наиболее важных векторах. Это чаще всего модели машинного обучения.

Понятно, что если у вас в предках были чисто калмыки, то вы будете идеально лежать в своем калмыцком кластере. Но если в роду у вас намешено, то вы можете считаться, что называют, Admixture. И обычно с таким самый гемморой для алгоритма. Также, если в выборке не будет калмыков, а вы калмык, то вам калмыка не покажут, покажут кого-то другого, наиболее близкого.

Территориальная привязанность не определяется 100% происхождением. Если у вас указан Казахстан, то это не значит, что вас казахом назвали. В Казахстане живет много русских, и наверное среди них бОльший процент клиентов генотека, чем среди местных казахов.

Гаплогруппа - это не значит, что вы негр. Известно, что люди вышли из Африки, это та кучка, которая разошлась по миру и наплодила потомков, и несла как раз гаплогруппы, которых вполне ограниченное количество. Т.е. если вы начнете идти по предкам далеко назад, то в конце концов вы придете к одной из веток, исходящей из этой кучки: https://ru.wikipedia.org/wiki/Гаплогруппы

Но нужно понимать, что если именно ваш результат не совпал с ожиданиями, это не значит, там даже не старались. Все данные проходят одинаковый алгоритм, никто не придумывает с потолка результаты. В общем, чтобы правильно интерпретировать результаты, нужно хоть немного понимать тему.

Общий скептицизм мне понятен, но эта не та тема, на которую стоит гнать. Одна из самых больших генетических баз данных в мире - это UK Biobank, они собрали 500к человек, генотипировали, секвенировали и собрали огромную базу фенотипов по ним. И сейчас тысячи исследований были проведены и проводятся на этой базе, множество клинически значимых результатов. И знаете кто выигрывает от этого - британцы, так как все эти результаты релевантны именно для людей их происхождения. Я очень надеюсь, что в России тоже будет такая база когда-нибудь. У нас есть очень умные люди в науке, есть деньги, это не такие огромные суммы сравнительно, нужно только грамотное руководство, которое, в том числе, должно подогревать интерес людей. Генотек, хоть и коммерческая компания, но это не корпорация зла. В эти 9к реагентов на 7к, а то и больше.

Ответ на пост «Как я проходил ДНК-тест»
Показать полностью 1
284

Ответ на пост «Как я проходил ДНК-тест»

Решил сделать отдельным постом с расширенным списком сайтов из комментариев (спасибо @194363, @czuker, @UtkaShutka)

В генотеке (да и наверное в других сервисах) есть возможность скачать сырые данные, которые можно потом проверить на других сайтах и посмотреть как они интерпретируют их.

Площадки по поиску родственников: gedmatch.com, myheritage.com, familytreedna.com, livingdna.com, geni.com

dnasolves.com - расследование нераскрытых преступлений по ДНК, за загрузку данных в награду дают информацию про происхождение

sanogenetics.com - постоянно обновляемая база научных статей с ДНК исследованиями, при загрузке своих данных показывает признаки и ссылки на исследование

genomelink.io - происхождение/характеристики, в основном платно, но есть бесплатные отчеты и ежедневные награды, есть поиск родственников

mytrueancestry.com - поиск совпадений с древними цивилизациями

tendna.com (не пробовал) - отчет по здоровью, вроде есть бесплатная версия

И небольшой комментарий от себя - родственники, найденные через генотек и другие сервисы, с большей вероятностью, реальные - наследование хорошо изучено. У меня близкие совпали.

Генетические заболевания тоже, но их там крайне мало, хотелось бы более расширенный список (например нет дальтонизма, мало рисков к тому или иному виду злокачественных образований).

Всякие склонности/способности очень спорно, на уровне у спортсмена какого-то нашли и у вас есть

Разделение на предков - тут уже полет фантазии кто выборку составлял, но на сайтах вроде mytrueancestry.com опираются на древние останки в различных регионах и там будут более объективные результаты ИМХО

Показать полностью
359

Ответ на пост «Как я проходил ДНК-тест»

По поводу анкетирования...
Пришёл я как-то в поликлинику к терапевту (тут такая система, что к 96% профильным врачам доступ есть только если терапевт тебе "откроет" на небольшое время "окошко" для записи). Попасть в это "окошко" бывает местами невозможно. Поэтому, либо платная клиника, либо ловишь удачу месяц, а если не попал, то идешь опять "открывать себе окошко". Если попал, то конечно "красотаааа" - заходишь, а там чисто, красиво, народу нет (странное же при таком подходе?), кофе, плюшки.

Так в чем суть, - понадобилось вот такое вот "окошко". Захожу, а мне говорят, - "эээ, брат, тебе срочно на диспансеризацию, иначе никак - компьютер не пускает". Дали листок, и достаточно быстро без очереди (откуда она там?) я сдал кровь, экг, рост, вес и обязательно нужно пройти тест.

Тест - такое ощущение, что его писал "капитан-очевидность", уже на втором вопросе я понял к чему идёт. Примеры вопросов:

1 Едите ли вы колбасу? (без уточнений периодичности, сорта и т.д.) - я не очень колбасу, но раз в месяц может и ем - жму "Да".

2 Выпиваете ли вы 3 литра воды в день (чай, соки, минералка - не считается). - стараюсь конечно, но прям вот так отдельно, ну литр-полтора в день. - жму "нет".

3 Принимаете ли вы алкоголь? (без уточнений периодичности, крепости и т.д.) - ну может в месяц литр пива там - жму "Да"

4. Едите ли вы каждый день 1 кг и более фруктов и овощей? (картошка, капуста не в счет). Ну видимо "Нет"

5. Едите ли вы сладкое (конфеты, например). Ну видимо "Да".

и т.д.

К вопросу 20 я уже устал нажимать.

Вывод электронного болвана - "Вы едите колбасу, пьете менее 3 литров воды, принимаете алкоголь, едите мало фруктов и овощей, а вместо этого жрёте конфеты! - вам хана, нужно срочно что-то делать".

В конце ожидал, что нужно срочно затариться каким-нибудь кококоциумом, но пока до этого технологии не дошли. Им бы ещё рекламные вставки вхреначить, пока талон себе пробиваешь, но это ещё видимо в планах.

п.с. анкеты теперь втюхали даже в момент записи к врачу. Т.е. думаешь - дайка гляну когда терапевт принимает, - не даёт, пока опросник не заполнишь.

Показать полностью
8236

Как я проходил ДНК-тест

Купил ради интереса ДНК-тест за 9т.р., на рекламе обещали всё-всё рассказать о моём происхождении и наследственных заболеваниях, заинтересовало.

Как я проходил ДНК-тест

В пункт выдачи привезли коробочку в ней колбочка с пробкой и инструкция. Наплевав полную колбочку, упаковал, вызвонил курьера и сел ждать результатов. Через 3 месяца на почту пришел ответ, что результат готов.
За ответом нужно прийти к ним на сайт. Результат, при этом, никак не выгрузить в виде брошюрки pdf, можно только читать на сайте. Чтобы показать результаты родственнику, то ему нужно по предоставленной мной ссылке зайти на сайт и зарегистрироваться, ну или можно колхозно наделать принтскринов.

По происхождению сайт показывает вот такое (и это фактически вся информация по происхождению):

Как я проходил ДНК-тест

Самое интересное, что у меня сразу по 2 бабушкиным линиям и 1 дедушкиной море предков из сельской Белоруссии. Тест не увидел ни одного. Второй дед - старообрядец из подмосковья. Тест нарисовал меня почти казахом.
Гаплогруппа порадовала. «Е» - теперь я по ней негр. Негр-казах (средний жуз)
Зачем то вставили про неандертальца «это на 41% больше, чем у клиентов». Не понятно, что взято за 0%. Это значит, что я меня на 41% больше, чем у среднего клиента, либо если средний — это 50%, то генов неандертальца у меня меньше, хз. Но ладно, я негр-неандерталец, пускай.

Как я проходил ДНК-тест

Генетическое происхождение в тесте при этом жестко завязано с текущими политическими границами. Выделены русские, белорусы, украинцы и в дополнение мордва. Вот так странно совпала генетическая карта и политическая, а то что внутри русских России намешана куча народов от русских до балтов, финнов и прочих угров. При этом намешана не равномерно, а с разными пропорциями от региона к региону. Но нет, русский — моноэтничен, белорус — тоже моноэтничен и ровно по политической границе 1991 года. Исключение — мордва, их выделили.

Как я проходил ДНК-тест

При этом, например, евреев при этом 7 вариантов в списке народов, завидую.

Вторая часть заявленного теста - это здоровье. Я в предвкушении ждал именно этой части, но мне предложили заполнить подробный медицинский опросник. Написал вес-рост и, о чудо, результат показал, что у меня видимо лишний вес и мне надо худеть. Написал, что употребляю алкоголь и он показал, что пить — вредно. Чудесный результат генетического теста, который равен результату любого опросника в интернете ради которого не нужно плевать в пробирку и ждать 3 месяца.

Но я подумал, что может это мне профану так выдали, но можно выгрузить подробный результат и показать профессиональному врачу. Хрен там плавал. Только общие слова на основании опросника и которые врачу можно показать только на принскрине.

Есть еще генетическое древо, количество нодов в котором ограничено и которое тоже никак не выгрузить. Есть список пятиюродных родственников, которые когда то попали в базу.

И реклама витаминов.
Как по мне, результат не заслуживает потраченного времени и денег.

upd: Если что, я негр-неандерталец (средний жуз) и критика меня и этого моего поста — это расизм и нацизм.

Показать полностью 3
Отличная работа, все прочитано!

Темы

Политика

Теги

Популярные авторы

Сообщества

18+

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Игры

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Юмор

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Отношения

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Здоровье

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Путешествия

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Спорт

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Хобби

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Сервис

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Природа

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Бизнес

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Транспорт

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Общение

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Юриспруденция

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Наука

Теги

Популярные авторы

Сообщества

IT

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Животные

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Кино и сериалы

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Экономика

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Кулинария

Теги

Популярные авторы

Сообщества

История

Теги

Популярные авторы

Сообщества