Простите, но Вы видимо тоже не очень умная. Больше читайте околоайтишного, т.к. работаете все же с техникой, наймите админа(грамотного). С виду он будет нихера не делать, весь день играть в компьютер, по факту капитально снизит риски потери данных, помимо вирусов бывают ребята в масках, пожары, недобросовестные сотрудники и т.п. Я Вам как админ с хорошим стажем и "послужным списком" говорю. Изолируйте зараженный пк от сети и попробуйте всякие касперски вирус ремовал и т.п.. Флешку после переноса антивирусных программ форматируйте на компьютере с любой никс системой, либо на маке
Похороните файлы, наймите админа грамотного и делайте чаще бекапы в хранилища не подключенные к сети. Сотрудника увольте нахер, т.к. видимо он не очень умный, с другими сотрудниками проведите тренинг по банальной работе в сети интернет. Объясните что такое ссылки, как они выглядят, что такое файлы, какие бывают популярные расширения файлов. Если админ есть, но не делал бекапы, то увольте его с внесением в трудовую, он еблан.