Скоро будет так...⁠⁠

Автор, твоей проблемы не существует в огромном количестве операционных систем :)
Например, в Ubuntu и основанных на нем дистрибутивах процесс удаления программы вместе со всеми ее настройками обычно выглядит так:
apt-get --purge remove <programname>
И не нужно отслеживать никаких пунктиков и галочек в меню :)
Установка софта, как правило, аналогична (только чуть другие опции у команды), тоже без всяких разношерстных инсталляторов с сюрпризами.