Классификация вирусов по Балтимору
Эта классификация вирусов была предложена американским учёным Дэвидом Балтимором в 1971 году. Она основана на различиях генетических систем вирусов. Классификация по Балтимору разделяет вирусы на 7 классов.
Класс 1.
Вирусы этого класса содержат двухцепочечную ДНК. Для репликации они попадают в ядро клетки: им требуется клеточная ДНК-полимераза. Иногда вирус может вызывать деления клетки, что может приводить к злокачественным новообразованиям. Примеры: порядок Herpesvirales, семейство Adenoviridae, семейство Papillomaviridae, семейство Polyomaviridae.
Класс 2.
Вирусы этого класса содержат одноцепочечную ДНК. Репликация происходит в ядре, в процессе образуется интермедиат- двухцепочечная ДНК. К классу 2 относятся семейства Circoviridae и Parvoviridae.
Класс 3.
Вирусы данного класса используют двухцепочечную РНК. Репликация происходит в цитоплазме, использование полимераз хозяина сведено к минимуму. Класс 3 включает в себя семейства Reoviridae и Birnaviridae.
Класс 4.
Это вирусы, которые содержат одноцепочечную (+)РНК, то есть синтез белка может идти непосредственно на рибосомах хозяина. Класс 4 разделён на две группы:
1) Вирусы с полицистронной мРНК, у которых трансляция приводит к образованию полипротеина, который затем разрезается на отдельные белки. Длина генов снижена, потому что с одной цепи РНК может синтезироваться несколько разных белков.
2) Вирусы со сложной трансляцией: синтез белка идёт со сдвигом рамки считывания, используется протеолитический процессинг полипротеинов. Эти механизмы обеспечивают синтез разных белков с одной цепи РНК.
К классу 4 относятся: порядок Nidovirales, семейство Picornaviridae, семейство Astroviridae, семейство Flaviviridae, семейство Togaviridae, семейство Virgaviridae.
Класс 5.
Вирусы класса 5 содержат одноцепочечную (-)РНК, то есть для репликации на рибосомах хозяина предварительно требуется транскрипция (-)РНК в (+)РНК. Класс 5 разделяют на две группы:
1) Вирусы, содержащие несегментированный геном. На первом этапе репликации происходит транскрипция (-)РНК вирусной РНК-зависимой РНК-полимеразой в моноцистронную мРНК, далее синтезируются дополнительные копии (+)РНК, служащие матрицами для синтеза геномных (-)РНК. Репликация происходит в цитоплазме.
2) Вирусы, содержащие сегментированный геном. Репликация геномных РНК происходит в ядре клетки-хозяина, вирусная РНК-зависимая РНК-полимераза синтезирует моноцистронные мРНК с каждого сегмента генома. Репликация осуществляется в двух местах.
Вирусы класса 5 входят в состав таксонов: порядок Bunyavirales, порядок Mononegavirales, семейство Arenaviridae, семейство Orthomyxoviridae, Deltavirus.
Класс 6.
Вирусы класса 6 содержат одноцепочечную (+)РНК, реплицируются через стадию ДНК. Для синтеза ДНК из одноцепочечной (+)РНК они используют фермент обратную транскриптазу; получившаяся ДНК встраивается в геном клетки-хозяина с помощью фермента интегразы. Лучше всего изученное семейство класса 6- ретровирусы, например, Вирус Иммунодефицита Человека (ВИЧ).
Класс 7.
Вирусы этого класса содержат двухцепочечную ДНК и реплицируются через стадию одноцепочечной РНК. Двухцепочечная геномная ДНК ковалентно замкнута в форме кольца и является матрицей для синтеза мРНК вируса, а также субгеномных РНК. Субгеномная РНК служит матрицей для синтеза ДНК-генома ферментом обратной транскриптазой вируса. К классу относят семейства Caulimoviridae и Hepadnaviridae.
...