А.... Ну, да, тут интересно... Тут и расстояние играет роль, как близко подходить, среда, в воду вы их топите или по лесу разбрасываете, и насколько скрытно надо установить метку. Я так предполагаю что это более приоритетно, что бы метку не нашли и не удалили?
Тогда использовать что то нестандартное, какой то экзотический стандарт, например на 13 мГц, а не на 127-134 как обычно делают.
Если человек будет знать что именно искать, он её найдет, тут хоть акустомагнитку хоть RFID хоть NFR цепляй... Или нелинейным локатором - тут вообще все пищать будет.
Вопрос опять таки в стоимости решения... Если деньги позволяют, то можно взять толкового схемотехника, что бы он просто взял да и перепаял антенны на метках под нестандартную частоту, за пределами общеизвестных диапазонах, и под них сделать считыватели. А потом китайцам тираж заказать 100500 штук :)