103

О чем говорят рибосомы...

С появлением средств массовой информации мы все даже нехотя пропитываемся ею (информацией) насквозь. К сожалению количество источников не увеличивает качества этой информации.


Газеты, журналы, телевидение, Интернет и т. д. с приходом массового неподготовленного писателя заражаются снижением качества подаваемой информации.


Вокруг нас столько научпопа и псевдонаучпопа, что всякие модные научные словечки в великом множестве прочно вошли в обиход, вошел в нашу повседневную речь и точный термин - "генетический код".


- А-а-а. В его генетический код внесены изменения - он мутирует! А-а-а.

В код. Внесены изменения. В генетический код. Рукалицо.


Слушаешь порой, и вянут уши. Сложно, сложно и противно авторам и переводчикам дается правда о генетическом коде, хотя при некотором рассмотрении проще вещи не найти.


Давайте попробуем в этом разобраться, и нам поможет наш детский опыт и разделение термина на две составляющие - код и генетический.


Начнем с кода. Для полного понимания того, что это такое, нужно понимать, что такое информация, как она передается и что собой представляют процессы кодирования и декодирования. А мы пока попробуем обойтись минимальным минимумом аналогий для неполного, но понимания.


Вот, например, Петя и Маша встретились в парке, и Маша делает вот так:

Что происходит, и как это понимать? Маша, очевидно, передает Пете некоторую информацию, получив которую Петя может продолжать общение дальше в определенном русле. Но все ли так просто?


Мы с детства передаем и получаем информацию, используя все органы чувств. Мы слышим речь родителей, начинаем ее понимать и пытаемся говорить в ответ. Видим мимику и жесты и копируем их. Чувствуем вкусы и запахи, ощущаем прикосновения.


При этом это все физические процессы. Речь - упругие колебания, вкусы и запахи - химия, мимика и жесты - оптические явления. Что же происходит внутри нашего общения?


Мы кодируем и декодируем информацию.


Зная код, обменявшись им с окружающими, мы, используя этот код, облекаем наши мысли в физические процессы, которые передают информацию собеседникам, а те превращают эти физические процессы обратно в образы внутри сознания.


Еще раз, имея код, зная способ кодирования, собеседники (передатчик информации и приемник) могут информацией обмениваться.


Процессы передачи информации окружают нас с самого начала даже в утробе и до конца - биение материнского сердца, упомянутые выше разговорная речь, осязание, жесты, мимика, запах и вкус еды, далее письменная речь, парфюмерия и косметика, жаргон, азбука морзе, шрифт Брайля, шифры и т. п.


А что такое генетический? Это, соответственно, относящийся к части биологии - генетике, изучающей закономерности наследственности и изменчивости. Последние два термина достойны отдельного разговора, а здесь ограничимся пока только упоминанием генетики.


Кто помнит школьную программу по общей биологии, вспомнят и центральную догму молекулярной биологии: упрощенно ДНК->РНК->белок.


Я напомню здесь, что при всем многообразии различных химических веществ входящих в состав клеток живых организмов, белки и нуклеиновые кислоты (ДНК и РНК) занимают среди них совершенно особое уникальное место, обеспечивая практически все особенности живых организмов, отличающие их от неживых предметов. При этом можно вспомнить слова великих о жизни - "Жизнь есть способ существования белковых тел", чтобы понять, насколько существенным считалось биологическое значение белков учеными более 100 лет назад. Надо сказать, что к текущему времени в этом мало что изменилось.


Белки и нуклеиновые кислоты в отличии от других веществ, входящих в состав клеток, являются нерегулярными биологическими полимерами, состоящими из нескольких мономеров. Нуклеиновые кислоты - из нуклеотидов (5 основных), а белки - из аминокислот (20 основных). И нуклеотиды и аминокислоты первоначально расположены в соответствующих полимерах последовательно один за другим в виде цепи. Потом эти цепи собираются в норме в разнообразные трехмерные структуры, практически полностью зависящие от первоначальной последовательности. Разнообразие возможных комбинаций цепей белков состоящих из 20 аминокислот - 104857600000000000000000000 (1.05*10^26), при этом типичные белки содержат десятки и сотни аминокислотных остатков. Разнообразию трехмерных структур белков мы обязаны своим биологическим существованием таким как есть.


Теперь нужно упомянуть откуда берутся белки и нуклеиновые кислоты и можно будет переходить к сути статьи.


Белки производятся в клетке на рибосомах с использованием матрицы РНК, в которой записывается последовательность аминокислот белка в виде последовательности нуклеотидов РНК. То есть из РНК читается информация о последовательности аминокислот в белке с одновременным синтезом белка. Этот процесс называется - трансляция.


РНК производятся на матрице ДНК, то есть из ДНК считывается информация о последовательности нуклеотидов в молекуле РНК с одновременным синтезом РНК. Этот процесс называется - транскрипция. Потом с РНК происходит ряд дополнительных преобразований, о них позже.


ДНК производятся на матрице существующих ДНК перед делением клетки, то есть информация о последовательности нуклеотидов в новой молекуле ДНК считывается из существующей молекулы ДНК с одновременным синтезом новой ДНК. Этот процесс называется - репликация (редупликация) ДНК.


Вернемся к центральной догме молекулярной биологии:

Генетический код непосредственно связан с процессом трансляции и аминоацетилирования (в следующих статьях), когда последовательность нуклеотидов в молекуле РНК используется для синтеза белка, то есть для создания цепи аминокислот с совершенно определенной последовательностью.


Генетический код это способ передачи информации о последовательности аминокислот в белке при помощи последовательности нуклеотидов в молекуле РНК.


Еще раз, генетический код это способ передачи генетической информации. К сожалению, устоявшаяся биологическая традиция в этом месте вносит дополнительные терминологические затруднения. Поскольку "передача генетической информации" является строгим термином обозначающим репликацию, а передача информации от РНК к белку в процессе трансляции называется - "реализация генетической информации". Ну тут уж ничего не поделать - так исторически сложилось. Но сущность генетического кода такова же как и сущность разговорной или письменной речи - они не есть информация, они лишь способ ее передачи.


Генетический код нельзя изменить без искажения передачи всей информации о структуре белков, и, соответственно, без утраты возможности правильного синтеза всех белков клетки.


Если речь идет о мутациях - меняется генетическая информация, меняется ДНК, но не генетический код. Надеюсь, что кому-то станет немного понятнее.

Наука | Научпоп

9.3K постов82.8K подписчиков

Правила сообщества

Основные условия публикации

- Посты должны иметь отношение к науке, актуальным открытиям или жизни научного сообщества и содержать ссылки на авторитетный источник.

- Посты должны по возможности избегать кликбейта и броских фраз, вводящих в заблуждение.

- Научные статьи должны сопровождаться описанием исследования, доступным на популярном уровне. Слишком профессиональный материал может быть отклонён.

- Видеоматериалы должны иметь описание.

- Названия должны отражать суть исследования.

- Если пост содержит материал, оригинал которого написан или снят на иностранном языке, русская версия должна содержать все основные положения.


- Посты-ответы также должны самостоятельно (без привязки к оригинальному посту) удовлетворять всем вышеперечисленным условиям.

Не принимаются к публикации

- Точные или урезанные копии журнальных и газетных статей. Посты о последних достижениях науки должны содержать ваш разъясняющий комментарий или представлять обзоры нескольких статей.

- Юмористические посты, представляющие также точные и урезанные копии из популярных источников, цитаты сборников. Научный юмор приветствуется, но должен публиковаться большими порциями, а не набивать рейтинг единичными цитатами огромного сборника.

- Посты с вопросами околонаучного, но базового уровня, просьбы о помощи в решении задач и проведении исследований отправляются в общую ленту. По возможности модерация сообщества даст свой ответ.


Наказывается баном

- Оскорбления, выраженные лично пользователю или категории пользователей.

- Попытки использовать сообщество для рекламы.

- Фальсификация фактов.

- Многократные попытки публикации материалов, не удовлетворяющих правилам.

- Троллинг, флейм.

- Нарушение правил сайта в целом.


Окончательное решение по соответствию поста или комментария правилам принимается модерацией сообщества. Просьбы о разбане и жалобы на модерацию принимает администратор сообщества. Жалобы на администратора принимает @SupportComunity и общество Пикабу.

4
Автор поста оценил этот комментарий

Куда, интересно, делись ссылки? Остался один Энгельс. (

показать ответы
2
Автор поста оценил этот комментарий

Прочитал статью, так и не понял, какую информацию Маша передает Пете :(

раскрыть ветку (1)
3
Автор поста оценил этот комментарий

Это потому что не умеешь декодировать! Это как с чтением, пока не научишься, книги без картинок - бесполезны, никакой информации не несут.

0
Автор поста оценил этот комментарий
Машу вать... Кто-нибудь разъясните вкратце о чем написано....
раскрыть ветку (1)
2
Автор поста оценил этот комментарий

Короче не получилось. И так одни опущения...

Автор поста оценил этот комментарий

Запрещённые домены? На предпросмотре поста были на месте?

раскрыть ветку (1)
2
Автор поста оценил этот комментарий

Да нет, википедия, вот вернул, что вспомнил.

0
Автор поста оценил этот комментарий

Вы пишите очевидные вещи и нигде мне не противоречите. В чем "странность" моих аргументов?

Что значит "выгодно" кодировать многие аминокислоты несколькими кодонами?

раскрыть ветку (1)
1
Автор поста оценил этот комментарий

Вы пишите очевидные вещи и нигде мне не противоречите. В чем "странность" моих аргументов?

Что значит "выгодно" кодировать многие аминокислоты несколькими кодонами?

Я, честно говоря, не вижу смысла дальше дискутировать. Но все-таки напишу.

Вы спросили про сколько нуклеотидов в элементе кода, я ответил про триплетность и сколько нужно кодировать аминокислот.


Вы написали про "степени четверки не при чем", я ответил, что если опираться на комбинаторику, то очень даже причем, так как 16 - недостаточно, а 256 - сильно избыточно.


Темы про "осталось 20 аминокислот в процессе эволюции" - какая-то фигня, непонятно откуда вы это взяли и зачем написали.


Про "20 тРНК" - вообще неверно, вы не знакомы с матчастью.


Генетический код - сложное, разностороннее явление, обладающее множеством различных свойств и до сих пор преподносящее сюрпризы.


Чтобы о чем-то аргументировано говорить, почитайте о свойствах генетического кода, о классах аминокислот и о связи между первым и вторым, почитайте хотя бы Ратнеровскую "Генетический код как система" http://www.pereplet.ru/nauka/Soros/pdf/0003_017.pdf.


И не продолжайте. Не нужно и не за чем.

0
Автор поста оценил этот комментарий
Как это степени четверки не при чем?

Читаем ваш текст: "Надо погуглить [...] отношения числа 20 и степеней четвёрки". Ответ: в контексте разбираемого вопроса, число 20 и степени четверки не соотносятся никак. Поэтому степени четверки и не причем. Если прочитать не только первое предложение из моего ответа, но и второе и третье, то можно узнать почему.

Прочитайте про комбинаторику

Читаем на это раз мой текст: "Если переставлять в кодоне четыре типа нуклеотида по принципу размещения с повторениями, то получается 64 возможные комбинации" Как по вашему, из какой области знаний выделенные слова? А число 64 получается, если применить законы какой науки? Какая-то глупая рекомендация от вас, да?

Речь про сколько нужно нуклеотидов в элементе кода, чтобы однозначно кодировать то, что нужно.

Вы, зачем-то очень расширяете первоначальный вопрос. Я его напомню: "Сколько нуклеотидов нужно для кодирования синтеза одной аминокислоты (и почему именно столько)?" Если под квантором всеобщности "то, что нужно" подразумевается аминокислота, то формулировка верная, если нет, то сформулировано не правильно, слишком обобщенно.

И своим предыдущим комментарием, я, собственно, на первоначальный вопрос ответил.

раскрыть ветку (1)
0
Автор поста оценил этот комментарий
Как это степени четверки не при чем?

Читаем ваш текст: "Надо погуглить [...] отношения числа 20 и степеней четвёрки". Ответ: в контексте разбираемого вопроса, число 20 и степени четверки не соотносятся никак.


Соотносятся аж в путь. 4^2 < 20, а 4^3 > 20, зачем этот бесполезный спор?

0
Автор поста оценил этот комментарий

Похоже, что степени четверки особо не причем. Если переставлять в кодоне четыре типа нуклеотида по принципу размещения с повторениями, то получается 64 возможные комбинации. Что намного большее 20, с явным избытком. Большинство аминокислот кодируются сразу несколькими типами кодонов. Почему аминокислот 20, а не по числу возможных комбинаций нуклеотидов, вопрос, похоже, дискуссионный. Видимо, в ходе эволюции остались именно эти аминокислоты из-за каких-то своих свойств. Кроме того, для каждой из 20 аминокислот существует своя тРНК, то есть их тоже 20.

Задающий вопрос "почему именно столько", видимо, подразумевал ответ, что для синтеза белка используется тРНК, которая несет на себе анти-кодон, состоящий из трех нуклеотидов.

раскрыть ветку (1)
0
Автор поста оценил этот комментарий

Как это степени четверки не при чем? Прочитайте про комбинаторику. Речь про сколько нужно нуклеотидов в элементе кода, чтобы однозначно кодировать то, что нужно. тРНК больше 20ти, сложные вопросы лучше пока оставить за бортом, они только запутают.

показать ответы
1
Автор поста оценил этот комментарий

Недавно вот такой диалог на баше читал (да, я все еще его читаю):

------

xxx: вообще, общественная дискуссия на тему пользы/вреда ГМО - вещь полезная и нужная.

xxx: только вот хорошо бы не допускать до таких дискуссий людей заведомо некомпетентных.

xxx: ну хотя бы уровень понимания школьного курса биологии проверять.

xxx: не знаешь, сколько нуклеотидов нужно для кодирования синтеза одной аминокислоты (и почему именно столько)? давайдосвидания.

------

И мне прям интересно стало узнать ответ на вопрос. Не может ли уважаемый Автор на него ответить?

раскрыть ветку (1)
0
Автор поста оценил этот комментарий

Надо погуглить на тему триплета, и отношения числа 20 и степеней четвёрки. Дойду до соответствующей статьи - напишу подробно, если тема будет интересна.

показать ответы
6
Автор поста оценил этот комментарий

Насколько я поняла:

- днк с точки зрения биологии: AGGTCTCAA...

- генетический код с точки зрения биологии: "если видишь A - запили белок №1; если видишь G - запили белок №2, итд" (автор, правильно?)

- генетический код с точки зрения фильма Валериан: AGGTCTCAA...


- изменение днк с точки зрения биологии: "под действием радиации вторая G превратилась в A"

- изменение генетического кода с точки зрения биологии: "если видишь A - запили белок №6, пусть организм сдохнет нахрен"

- изменение генетического кода с точки зрения фильма Валериан: "под действием радиации вторая G превратилась в A"


так?

раскрыть ветку (1)
0
Автор поста оценил этот комментарий

Почти так!

Темы

Политика

Теги

Популярные авторы

Сообщества

18+

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Игры

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Юмор

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Отношения

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Здоровье

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Путешествия

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Спорт

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Хобби

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Сервис

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Природа

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Бизнес

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Транспорт

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Общение

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Юриспруденция

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Наука

Теги

Популярные авторы

Сообщества

IT

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Животные

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Кино и сериалы

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Экономика

Теги

Популярные авторы

Сообщества

Кулинария

Теги

Популярные авторы

Сообщества

История

Теги

Популярные авторы

Сообщества