Один из потерянных легионов⁠⁠

Но если нелояльных космодесов отправляют в лояльный легион, то общий процент лояльности легиона снижается

Deus Ex Machina - это именно бог, тогда как Омниссия - позиционирует себя как пророк Бога-машины. Именно на этом и сыграл Император, когда прибыл на Марс, чтобы проверить свои долгосрочные вложения и принудить их к сотрудничеству. Так что это два разных понятия.

Есть теория, что во время войны с рангдой об этих ксеносов, которые вполне могли уничтожить Империю Человечества, убился целый легион вместе с примархом. Косвенно это подтверждается тем, что I легион понес тяжёлые потери и не успел восстановиться к началу Ереси, а Омегон Альфарий был найден Альфарием в тылу этого конфликта, при чём примарху пришлось очень тяжело и он вполне мог погибнуть.

Про увеличение численности XIII легиона есть другая, не менее мрачная история - один легион обратился против Императора и был силой принужден к повиновению. Принуждение было кровавым и выполнил его VI легион. Предположительно примарх был отправлен в специальную тюрьму на Титане, где его в настоящий момент сторожат Очистители Серых Рыцарей, легион расформирован, а остатки личного состава пополнили ряды XIII, как одного из наиболее лояльных легионов.