Микроорганизмы

Украла вконтакте, детство не моё, но очень похоже. читала взахлеб, долго вспоминала не одно лето у бабули в Краснодарском крае, где заброшенные дачи это завтрак обед и ужин, на речке сомы размером с собаку, и рыбки краснопёрки, которых можно поймать на кусочек листа с ближайшей плакучей ивы. Где подорожник это лекарство от любой рваной раны, а велосипед это один из способов самоубийства.

Исследователи из Университета Монаша заявили об успешном испытании методики обнаружения бактерий-возбудителей кишечных инфекций в трущобах и сельских районах.

Защита от заболеваний для живущих в условиях проблем с санитарией, доступностью воды и гигиеной людей имеет важное значение. По данным ВОЗ, кишечные инфекции находятся на пятом месте среди ведущих причин смерти по всему миру. В 2019 году смертность составила 1,5 миллиона человек, преимущественно детей до 5 лет. Кроме того, они приводят к проблемам с питанием и развитием.

Из-за огромного количества патогенов и их источников очень сложно отслеживать их распространение. Многочисленные энтеропатогены становятся причиной диареи и других желудочно-кишечных заболеваний. Это могут быть вирусы, бактерии, амёбы и черви, каждый из которых обладает собственными особенностями. Более того, они распространяются сложными путями через людей, животных, окружающую среду и пищу. Обычно микробиологи отслеживают отдельные патогены и проверяют источник появления.

В исследовании, опубликованном в журнале The Lancet Planetary Health, впервые испытали лабораторный метод под названием TaqMan Array Card (TAC). Его сравнили со стандартным методом количественной полимеразной цепной реакции (ПЦР). Оказалось, что ТАС быстрее и дешевле ПЦР. Оба способа обнаруживают одновременно свыше 30 патогенов со сравнимой точностью.

Микробиолог Института биомедицинских исследований Университета Монаша доктор Рэйчел Лаппан, одна из руководителей исследования, использовала для проверки метода образцы из сточных вод Мельбурна, образца стула человека, помёта животных, образцов почвы и воды из трущоб в столице Фиджи городе Сува. По словам Рейчел, проверка методики ТАС — важный шаг в борьбе со сложной и забытой проблемой детской диареи.

«В трущобах энтеропатогены можно обнаружить разными способами, а их отслеживание может стать большой проблемой, поскольку существует огромное количество энтеропатогенов, вызывающих заболевание, — сказала доктор Лаппан. — ТАС предлагает относительно простой и доступный способ отслеживания и анализа патогенов на основе любого образца».

«ТАС очень важен, поскольку поможет нам лучше понять и отслеживать пути заражения людей и настроить на их основе эффективные меры по распоряжению водными ресурсами. Эти меры могут привести по улучшению здоровья людей, как те, что мы испытываем в рамках программы по возрождению неформальных поселений и их окружающей среды (RISE)», — сказала Лаппан.

Соавтор исследования доцент Крис Грининг из Института биомедицинских исследований Университета Монаша добавил, что сравнивая эти методы, учёные хотели понять, будет ли способность эффективно обнаруживать широкий спектр энтеропатогенов обладать существенным недостатком чувствительности. Однако мы показали, что характеристики ТАС сопоставимы с ПЦР и он идеально подходит для широкого скрининга бактерий, который не целесообразно проводить с использованием ПЦР.

Исследование было проведено в рамках программы по восстановлению сельских поселений и окружающей среды — Revitalising Informal Settlements and their Environments (RISE). RISE включает в себя комплекс мероприятий и исследований направленных на улучшение управления водными ресурсами и разрешение вопросов с санитарией в неформальных поселениях с природной инфраструктурой. RISE и другие трансформационные программы в области водоснабжения, санитарии и гигиены нуждаются в методах, позволяющих проводить всесторонний и эффективный контроль за энтеропатогенами для понимания степени загрязнения окружающей среды и серьёзности болезней до и после вмешательства.

***

Перевод подготовили: Вера Круз, Антон Меньшенин, Екатерина Хананова.

Источник.

Сообщества микробов, наполняющих кишечник современного человека, были разделены на три устойчивые группы, называемые «энтеротипами», каждая из которых характеризуется определённым набором бактерий. И такое разделение на отдельные группы поднимает несколько вопросов о происхождении и эволюции этих различных по составу групп микробных сообществ. К примеру, если формирование энтеротипов обусловлено разнообразием рациона человека, то энтеротипы могли эволюционно возникнуть совсем недавно, но если энтеротипы являются следствием более древних особенностей, таких как иммунная система или физиология кишечника, то они, вероятно, возникли до или во время образования большинства групп больших обезьян. Поэтому изучение состава микробиоты кишечника обезьян и прослеживание его изменения, поможет проявить свет на происхождение этих самых энтеротипов.

Учёные проверили наличие разделения микробов кишечника 35 шимпанзе из национального парка в Танзании на энтеротипы. Эти анализы показали, что все микроорганизмы, населяющие кишечник шимпанзе, разделяются на основе их состава на три отдельные группы (то есть энтеротипы!), которые не имеют существенной связи с возрастом или полом хозяина. Также им удалось проследить некоторое соответствие в составе энтеротипов шимпанзе и человека.

И так как энтеротипы присутствуют как у людей, так и у шимпанзе, то можно предположить, что такое разделение микроорганизмов кишечника на группы характерно в целом для всех больших обезьян, а значит энтеротипы всё-таки возникли уже достаточно давно.

Но всё же самый главный вопрос для учёных заключается в том, изменяется ли состав энтеротипов у отдельных организмов с течением времени. Этот вопрос рассмотрели опять же на шимпанзе, оценив вариабельность их энтеротипов в течение восьми лет. И если кратко, то да, они изменились. Как уже говорилось, нет очевидной связи между энтеротипом шимпанзе и их генетикой или географией их места обитания. Так, например, в одном из похожих исследований было выявлено, что братья и сёстры шимпанзе Сэнди и Шелдон, а также их мать обладали разными энтеротипами, и их энтеротипы с течением времени изменились и всё ещё различались в более поздних исследованиях. Но при этом, три других шимпанзе, которые не являются членами одной семьи, и которые имели географически разные места обитания, обладали одинаковыми энтеротипами в каждой из трёх временных точек. Однако учёные так и не смогли обнаружить устойчивой связи между энтеротипом и условиями обитания, в которых отбирались пробы. У человека же, скорее всего, в условиях разнообразия пищи, энтеротип будет меняться с изменением диеты, но это требует дополнительных исследований.

Таким образом, учёные показали, что сообщества микробов кишечника шимпанзе всё-таки разделяется на три устойчивые группы (на энтеротипы), которые по своему составу в какой-то мере аналогичны тем, которые наблюдаются у человека. И хотя состав энтеротипов остаётся стабильным, он всё же может меняться с течением времени.

Оригинальная статья:  https://www.nature.com/articles/ncomms2159

Натуралист и естествоиспытатель Антони ван Ливенгук известен нам в первую очередь, по двум фактам из его научной карьеры. Во-первых, он конструировал довольного годные микроскопы. Во-вторых, он с помощью этих микроскопов заглядывал в самые «темные» уголки окружающего мира. Ну и вот однажды в пятницу 24 апреля 1676 года он решил с помощью своего очередного детища посмотреть в каплю воды. Увиденные там диковинные микроскопические живые существа, повергли его в шок, а тот день считается началом такой науки как микробиология! Правда наука эта ближайшие 50 лет развивалась просто в формате аттракционов «посмотри на маленьких животных» и очень поверхностного описания микроорганизмов, и ни о каком углубленном изучении в те времена речи не шло.

Я каждый день с 8 февраля рисую по комиксу, связанному с событием произошедшим в эту дату, когда она была пятницей! Если хотите поддержать меня, то вот — http://desvvt.art/

я в телеграме — https://t.me/desvvt