Сам когда то наблюдал такое явление над Средиземным морем. Помню такие смерчи появлялись и быстро пропадали, их было несколько.
Если верить ВИКИ, то подобный смерч может появится между большими водоемами и кучевыми облаками. И еще нужна жара, что и спровоцирует восходящие потоки.
В отличие от классического смерча, водяной смерч существует всего 15-30 минут, намного меньше в диаметре (от 5 до 200 м), скорость движения и вращения ниже в два-три раза, не обязан сопровождаться ураганным ветром.
Интересный факт, подобные "водяные смерчи" можно наблюдать и в РФ над Волгой.