Видите это эмм.. сердечко?
Вы с ним определенно знакомы.
Перед вами один из белков из Saccharomyces cerevisiae.
Под этим страшнопроизносимым названием спрятались "обычные" пекарские дрожжи. То есть любители пива и булочек видятся с ним значительно чаще, чем я (не любитель пива и не... Вру. Любитель булочек).
Какую статью по биологии (и около) не открой, везде пишут про кишечную палочку - E.coli. Ее постоянно модифицируют, чтобы что-то полезное получить для человечества, с ней ставят опыты и эксперименты, с ней что-то изобретают и даже пишут картины!
Но в сердцах генетиков у этой горячей крошки есть конкурент. Да еще какой. Ведь глупая маленькая кишечная палочка всего-то прокариот. А дрожжи ядром в процессе эволюции все-таки озаботились. А потому, гордо размахивая флагами, стройным шагом многочисленной армии втопали на поле эукариотов.
Чем же так важно для нас это их свойство, а сами дрожжи, соответственно, для генетиков?
Saccharomyces cerevisiae - один из наиболее изученных модельных организмов, говорит нам вечно умничающая Википедия. Что значит модельных? Во-первых, что изученных вдоль и поперек, а потом еще разочек. Что генОм их давно секвенирован и разобран.
Во-вторых, с генетическим кодом этих дрожжей сравнивают другие организмы. (Зачем - надо отдельный пост)
В дрожжах биотехнологи, фармакологи и прочие ологи могут выращивать всякие нужные белки. Для лекарств, продуктов, промышленности итдитп.
Но ведь у нас для этой грязной работы уже есть E.coli - спросят обладатели самой цепкой памяти. Ответ: ядро! У нас, эукариотов, в отличие от палочки-прокариота, процесс приготовления белков по книге рецептов, спрятанной в ДНК, отличается одним ключевым моментом.
Разберемся с этим. Как прочитать текст бактерии о схеме сборки ее белков? Взять цепочку ДНК, расплести косичку, по буквам последовательно прочитать ее в другую цепочку (РНК), потом аккуратненько взять эту новую цепочку за хвостик и положить на фабрику - в рибосому. Там внутри специальная генетическая машинка строчку РНК прочитает и по готовому тексту на ниточку, как бусинки, понацепляет аминокислот. А из аминокислот потом сложится белок - бинго!
Для этого бактерии понадобилось в начале днк-книжки читать начать, а в конце книжки закончить. Р-раз и все.
А эукариоты решили выпендриться. Их, наши, белоккодирующие гены записаны не сплошным текстом.
Представьте, что вы серьезный взрослый человек, а вам подсовывают книжку с картинками. Да не такую, чтоб с красивыми иллюстрациями, а как ужас моей юности - сборник отрывко-рассказов Коэльо, где на 5 строчек текста приходится странная картинка и две белых страницы. А потом следующий в таком же духе.
То есть "здесь читаем - тут перелистываем - тут снова читаем...". Повторить много раз. Такую книжку приходится читать короткими фрагментами и пролистывать "мусорные" куски.
Как такое читать? Сначала расплетем ДНК (ага, было), потом скопируем нужную часть цепи в РНК (делали), а теперь порежем новую ниточку на ломтики. Затем выберем только кусочки нужного нам текста (они называются "экзоны") - самого белоккодирующего гена, а "картинки" и "белые листы" ("интроны") кинем в мусорку. Теперь сшиваем вместе весь текст и...Оп! Но ведь этот рассказик шел совсем на другой странице! Вот-вот.
Порезать книжку и потом сложить обратно текстики, называется "сплайсинг".
А когда кусочки текста не складываются в "правильной" последовательности - это альтернативный сплайсинг.
Сшитую вместе книжку мы также кладем на грузовичок транспортной РНК (тРНК) и отправляем в рибосому, готовить аминокислотные бусики. То есть прокариоты "начали-сделали-закончили", а эукариоты "почитали-пролистнули-почитали-пролистнули...".
И именно в этом моменте собака порылась. Оказывается, что некоторые хитрые белки эукариот просто не умеют приготавливаться по книжке, которую написали непрерывным текстом. В этом месте такие солдатики как дрожжи отодвигают в сторонку грустную безработную палочку и начинают трудиться во благо человека.
А вы говорите, пиво - это вредно:)
(О том, зачем эволюции понадобилось так все усложнить, в другой раз)
"Иллюстрации" "выполнены" в софте для докинга.