До этой битвы в правящих верхах Пруссии царил настоящий военный психоз. После образования новой антифранцузской коалиции (уже четвертой) им хотелось как можно скорее ринуться в бой. Пруссия, уверенная в том, что её армия — истинная хранительница заветов победоносного Фридриха II Великого, торопилась начать войну первой, чтобы ни с кем не делить лавры победы над Бонапартом. В победе не сомневался никто: высшее дворянство, генералитет и офицерство заверяли, что проучат корсиканского выскочку. Никаких трудностей в ходе этой компании пруссаки не ожидали. Наполеон, в отличие от прусского командования, подошёл к подготовке кампании со всей тщательностью.
Итогом нескольких битв, в числе которых была битва при Ауэрштедте, французы наголову разбили прусскую армию. В результате ошеломившего всю Пруссию поражения при Йене и Ауэрштедте, пруссаки потеряли более 20 000 человек убитыми и ранеными, а также 18 000 пленными. Большая часть прусской артиллерии оказались в руках французов. Было убито, ранено и пленено 20 генералов.
Наполеон в битве при Йене. 14 октября 1806 г.
27 октября, то есть менее, чем через две недели после битвы, император французов с триумфом въехал в Берлин в окружении четырёх своих маршалов и нескольких элитных подразделений Великой армии. Моральное состояние пруссаков было столь сильно подавлено, что всего через месяц после начала войны Наполеону сдался прекрасно укреплённый Магдебург, а затем и другие немецкие города и крепости.
Пруссия пала. Победа французского оружия в кампании 1806 года была полной, сокрушительной и безоговорочной. Правительство, генералитет и народ Пруссии были подавлены и отказались от сопротивления императору. По мнению самого Наполеона, Йена и Ауэрштедт стала третьим самым счастливым днем в его жизни после победы при Маренго и под Аустерлицем.
Картина Шарля Мейнира «Наполеон в Берлине»
Как отмечал Клаузевиц, Пруссия «погибла из-за своих форм государственного устройства». Феодальное королевство Фридриха Вильгельма III, опиравшееся на одни лишь заслуги своих предков, не выдержало столкновения с революционно-новаторским подходом Франции, выраженным в новой тактике ведения боевых действия.
После поражения при Йене и Ауэрштедте руководящими кругами были сделаны соответствующие выводы, в результате которых была начата модернизация армии, одними из идеологов и претворителей в жизнь которой были Карл фон Клаузевиц, Герхард фон Шарнхорст и Август фон Гнейзенау.
"В Йене Наполеон выиграл сражение, которого не мог проиграть. В Ауэрштедте Даву выиграл сражение, которого не мог выиграть."
"Ни одна из побед Наполеона не была столь же эффективна и полна, как эта".