- EGF: эпидермальный фактор роста, белок, который играет ключевую роль в росте и дифференцировке клеток.

- Гомолог: в генетическом контексте гомолог - это общий ген двух видов, имеющих общего предка.

- Биожидкость: любой вид биологической жидкости, вырабатываемый организмом.

- РНК: рибонуклеиновая кислота, молекула, которая транскрибируется с помощью ДНК клетки, после чего может быть использована для создания белка при трансляции кода РНК.

- Патогенез: процесс, посредством которого развивается заболевание, от первоначальной причины до симптомов и изменений тканей.

- Онкогенез: процесс, посредством которого нормальные клетки превращаются в раковые клетки.

- Контралатеральная сторона: сторона тела, противоположная той, где что-то возникло.

- Изоформа: белок, который имеет сходную биологическую функцию с другим белком, но не имеет точно такой, же аминокислотной последовательности.

Предыстория проекта

MCM использует замечательную вычислительную мощность World Community Grid (WCG), предоставляемую глобальным сообществом из более чем 817 000 добровольцев, для анализа миллионов различных точек данных, собранных из тысяч образцов здоровых и раковых тканей. Благодаря систематическому изучению этих данных мы выявили 26 генов человека, которые тесно связаны с развитием рака легких. По состоянию на октябрь 2025 года устройства MCM для добровольцев выдали более 2,77 миллиарда результатов для картирования онкомаркеров. Мы искренне благодарим вас за постоянную поддержку и ценим вашу помощь в развитии гуманитарных наук.

В нашем последнем исследовании основное внимание уделялось безэквивалентному регулятору клеточного цикла (ECD), гену, участвующему в пролиферации раковых клеток и подавлении опухолей. В этом обновлении будет описано NELL2, ген, имеющий решающее значение для развития нервной системы.

Представляем NELL2!

Рисунок 1. Структура белка NELL2.

NELL2 - это ген, который кодирует экспрессию белка, выделяемого клетками при развитии нервной системы (рис. 1). Этот гликопротеин содержит множество EGF-подобных повторов, которые обеспечивают связывание с кальцием и белками, участвующими в процессе роста (PMID: 32198364).

NELL2 был обнаружен наряду с NELL1 как гомолог куриного белка (PMID: 8975702). После его открытия оказалось, что версия NELL2 у млекопитающих существует и у многих других видов животных, что указывает на эволюционную важность его функции.

NELL2 в основном обнаруживается в нервной системе, но также значительно экспрессируется в репродуктивных тканях, таких как яички и фаллопиевы трубы (рис. 2). Это может быть связано с его ролью в созревании сперматозоидов и эстрогензависимых изменениях в головном мозге (PMID: 32499443, PMID: 20538601).

Тем не менее, основная часть исследований NELL2 сосредоточена на конкретных изменениях, которые он вызывает в развивающейся нервной системе, и на том, как он их запускает. Одним из возможных методов является секреция, поскольку NELL2 передает информацию между клетками после того, как выделяется из этих клеток и перемещается по различным биожидкостям. Такая форма межклеточной коммуникации делает его ценным потенциальным биомаркером, поскольку его можно обнаружить с помощью неинвазивных методов, таких как анализ крови.

Рисунок 2. Данные по экспрессии тканевой РНК для NELL2 (Human Protein Atlas).

Хотя NELL2 широко экспрессируется в головном мозге, он также имеет специфические паттерны экспрессии в каждой области в соответствии с различными типами клеток в этой области (рис. 3).

Например, клетки мозга взаимодействуют друг с другом с помощью сигналов, которые либо активируют, либо деактивируют следующую ячейку в их сети, эффективно передавая сообщение или препятствуя его передаче. Клетки, которые передают сообщения, являются возбуждающими, в то время как те, которые препятствуют передаче сообщений, являются тормозящими.

Экспрессия NELL2 в мозжечке ограничена клетками головного мозга, которые используют тормозную сигнализацию, но преимущественно экспрессируется в возбуждающих клетках Брайана гиппокампа (PMID: 18677093). Хотя оба типа клеток мозга проявляют совершенно противоположные действия, NELL2, скорее всего, экспрессируется в обоих из-за их коллективной зависимости от кальция, влияющего на коммуникацию.

Рисунок 3. Данные по экспрессии РНК в тканях головного мозга для NELL2 (Human Protein Atlas).

Помимо дифференциально регулируемых паттернов экспрессии генов, белок NELL2 обладает многими предполагаемыми механизмами действия. В следующем разделе описаны ключевые функции NELL2 в организме и то, как он участвует в управлении аксонами и развитии нейронов, а также его значение в качестве маркера рака.

Управление аксонами в нервной системе

Рак легких имеет один из самых высоких показателей смертности от рака в мире. Отчасти это связано с его частым метастазированием в мозг, и он является источником примерно 50% метастазов в мозг (опухолей, возникающих в результате рака, возникшего в другом месте). Из-за этого общего пути от рака легких к метастазированию в головной мозг изучение патогенеза этого явления является важной частью понимания заболевания в целом (PMID: 28921309). Таким образом, мы исследуем роль NELL2 в развитии нервной системы, чтобы обеспечить обоснованный подход к роли NELL2 в онкогенезе.

Спинной мозг координирует движения и ощущения в теле с помощью обширной сети нервов. По мере развития эмбриона большинство его нервов пересекают среднюю линию спинного мозга и продолжают отходить в противоположную сторону по пути к головному мозгу (рис. 4). Этот процесс называется перекрещиванием и гарантирует, что то, что ощущается правой стороной вашего тела, в основном обрабатывается левой частью мозга. Часть нерва, которая пересекает нервную систему, является магистралью, по которой передается информация: аксон. Чтобы правильно проложить эти пути прохождения нервных волокон и обеспечить правильную связь конечностей и мышц с мозгом, рост аксонов регулируется многими факторами, которые влияют на длину и направление (PMID: 24040928).

Рисунок 4. Пересечение чувствительного нерва с правой стороны тела на левую сторону мозга.

Сенсорная информация передается вверх по нервному аксону от правой руки, через тело клетки в дорсальном корешковом узле и вверх по спинному мозгу по пути к головному мозгу. Когда аксон достигает ствола головного мозга, он пересекает среднюю линию спинного мозга через перекресток и направляется к контралатеральной стороне головного мозга.

Рисунок 4. Пересечение чувствительного нерва с правой стороны тела на левую сторону мозга. Сенсорная информация передается вверх по нервному аксону от правой руки, через тело клетки в дорсальном корешковом узле и вверх по спинному мозгу по пути к головному мозгу. Когда аксон достигает ствола головного мозга, он пересекает среднюю линию спинного мозга (перекресток) и направляется на противоположную сторону головного мозга.

NELL2 связывается с рецептором Robo3 на клеточной поверхности аксонов, направляя их к контралатеральной стороне мозга (PMID: 26586761).

В ходе этого процесса аксон экспрессирует изоформу Robo3, называемую Robo3.1, перед пересечением. Реакция NELL2, связывающего Robo3.1, направляет аксон по средней линии спинного мозга, где он начинает изменяться. Достигнув средней линии, аксон начинает экспрессировать новую изоформу рецептора, называемую Robo3.2.

NELL2 больше не может взаимодействовать с этим новым белком, поэтому аксон снова начинает расти прямо (PMID: 32198364). Таким образом, эта система обеспечивает правильный рост нейронов спинного мозга и возможность передачи сигналов по мере развития нервной системы млекопитающих.

Помимо раннего развития нервной системы, NELL2 также связан с нейробластомой и имеет высокую экспрессию в раковых тканях. Таким образом, его участие в развитии рака у детей в сочетании с его ролью в развитии нервной системы требует дальнейшего изучения его роли в опухолеобразовании нейробластомы (PMID: 11803583).

NELL2 при раке легких

Рак легких является одним из наиболее часто диагностируемых видов рака во всем мире. Его сложная диагностика и неблагоприятный прогноз делают его лечение серьезной проблемой для пациентов, но исследования продолжают искать новые способы выявления этого заболевания.

Данные об экспрессии в тканях указывают на значительное вовлечение NELL2 в развитие рака щитовидной железы, предстательной железы, колоректального рака и рака поджелудочной железы (рис. 5), однако, несмотря на ограниченную экспрессию при раке легких, наши недавние результаты указывают на его потенциальный биомаркер.

Рисунок 5. Данные по экспрессии РНК в раковых тканях для NELL2 (Human Protein Atlas).

Аденокарцинома (ADC) и плоскоклеточный рак (SQC) являются двумя наиболее распространенными подтипами немелкоклеточного рака легких (НМРЛ), которые вместе составляют большинство случаев как НМРЛ, так и рака легких в целом. Хотя NELL2 в основном изучался при таких видах рака, как почечно-клеточный рак (ПКР) и гепатоцеллюлярная карцинома (ГЦК), значительное улучшение показателей выживаемости пациентов было связано с высокой экспрессией NELL2 в АЦП легких (рис. 6А). Однако эти преимущества, по-видимому, не распространяются на SQC легких (рис. 6Б).

Рисунок 6. Кривые выживаемости Каплана-Мейера при аденокарциноме легкого (ADC) и плоскоклеточном раке легкого (SQC) в контексте экспрессии NELL2. A. Высокая экспрессия NELL2 связана со значительно большей вероятностью выживания (ось y) с течением времени (ось x) при ADC (HR = 0,69 - 0,97, р = 0,023; снижение риска до 31%). B. Экспрессия NELL2 не оказывает существенного влияния на выживаемость пациентов при SQC (ОР = 0,72 - 1,05, р = 0,15).

Рисунок 6. Кривые выживаемости Каплана-Мейера при аденокарциноме легкого (ADC) и плоскоклеточном раке легкого (SQC) в контексте экспрессии NELL2.

A. Высокая экспрессия NELL2 связана со значительно большей вероятностью выживания (ось y) с течением времени (ось x) при ADC (HR = 0,69 - 0,97, р = 0,023; снижение риска до 31%).

B. Экспрессия NELL2 не оказывает существенного влияния на выживаемость пациентов при SQC (ОР = 0,72 - 1,05, p = 0,15). Данные получены с помощью KM Plotter.

АЦП возникает из железистых клеток (клеток, которые вырабатывают и секретируют жидкости), в то время как SQC образуется из плоских клеток, которые выстилают поверхность кожи и других органов. Эти данные могут свидетельствовать о том, что NELL2 играет более важную роль в биологии железистых опухолей, чем в плоскоклеточных, благодаря своей природе как белка, который секретируется с помощью биожидкостей. Это также является убедительным показателем его потенциала в качестве биомаркера рака, поскольку его можно обнаружить неинвазивно. Однако высокая экспрессия NELL2 способствует выживанию только у женщин с АЦП (рис. 1). 7А), в то время как выживаемость пациентов с АЦП у мужчин остается неизменной (рис. 7Б).

Рисунок 9. Кривые выживаемости Каплана-Мейера при ADC в легких у пациентов мужского и женского пола в контексте экспрессии NELL2.

A. Высокая экспрессия NELL2 связана с большей вероятностью выживания с течением времени при ADC (ОР = 0,49 - 0,86, р = 0,0021; снижение риска до 51%).

B. Экспрессия NELL2, по-видимому, не влияет на выживаемость пациентов мужского пола (ОР = 0,74 - 1,18, р = 0,58).

Рисунок 9. Кривые выживаемости Каплана-Мейера при ADC в легких у пациентов мужского и женского пола в контексте экспрессии NELL2.

A. Высокая экспрессия NELL2 связана с большей вероятностью выживания с течением времени у женщин с ADC (ОР = 0,49 - 0,86, р = 0,0021; снижение риска до 51%)..

B. Экспрессия NELL2, по-видимому, не влияет на выживаемость пациентов с ADC у мужчин (ОР = 0,74 - 1,18, p = 0,58). Данные получены с помощью KM Plotter.

Дальнейшие исследования влияния курения на ADC или SQC в контексте экспрессии NELL2 не дали существенных результатов. Тем не менее, зависящее от пола влияние NELL2 на выживаемость поднимает интересные вопросы, касающиеся взаимодействия NELL2 с гормонами, специфичными для пола, и генетическими факторами, влияющими на биологию опухоли.

Предыдущие исследования установили связь между передачей сигналов эстрогена и транскрипцией NELL2 в головном мозге, а также потенциальное влияние NELL2 на дифференцировку мозга в зависимости от пола, но эти связи еще предстоит изучить в контексте развития рака легких (PMID: 20538601, PMID: 21643849).

Вывод

NELL2 - это ген, который влияет на множество ключевых процессов в организме, от развития нервной системы и передачи сигналов клетками до созревания сперматозоидов. Наши анализы показывают, что он также играет важную роль при раке легких, особенно при аденокарциноме (ADC), где высокая экспрессия коррелирует с улучшением выживаемости пациенток женского пола. Хотя его экспрессия при плоскоклеточном раке (SQC), по-видимому, менее выражена, различия в выживаемости при ADC в зависимости от пола указывают на интригующие взаимодействия между NELL2, гормонами и генетическими факторами, которые еще предстоит полностью изучить. В целом, эти результаты указывают на новые захватывающие возможности в поиске прогностических и диагностических маркеров рака легких, и проект MCM находится на переднем крае этого важнейшего исследования.

Пожалуйста, свяжитесь с нами, если у вас есть какие-либо вопросы или комментарии по поводу нашего исследования, или не стесняйтесь поделиться своими мыслями на форуме проекта.

Спасибо, что продолжаете поддерживать World Community Grid и расширяете возможности наших исследований.

Искренне, Команда MCM

https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/article.s?articleId=827

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:

https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view

https://boinc.berkeley.edu/download_all.php

https://boinc.ru

Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC.

https://github.com/BOINC/boinc

Ссылка на телеграмм https://t.me/TSCRussia

https://kmplot.com/analysis/index.php?p=service&cancer=lung

https://www.proteinatlas.org/ENSG00000184613-NELL2/cancer

https://www.uniprot.org/uniprotkb/Q99435/feature-viewer

https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/article.s?articleId=825

Коактиватор транскрипции: белок, который взаимодействует с другими белками-партнерами, чтобы “включить” экспрессию определенного гена и активировать транскрипцию.

Пролиферация: процесс роста и деления клеток, который необходим для поддержания жизнедеятельности клеток, но при отсутствии контроля может привести к раку.

Клеточный цикл: серия строго регламентированных этапов, через которые проходит клетка для репликации. Это включает интерфазу (фазы G1, S и G2), которая представляет собой рост клеток и репликацию ДНК, за которой следуют ядерное и клеточное деление (фаза M).

p53: белок, который защищает от ракового роста и избыточной пролиферации, но часто мутирует или отсутствует при многих видах рака.

E2F: белок, который необходим для “включения” генов, обеспечивающих прогрессирование в течение клеточного цикла.

Рисунок 1. Белковая структура ECD (UniProt).

Фон

Проект MCM использует возможности крупномасштабного компьютерного анализа, чтобы улучшить наше понимание рака и способов его лечения. Исследуя миллионы сигнатур здоровых и раковых тканей, мы, систематически выявляем ключевые факторы развития рака, начиная с самого начала.

Этот проект реализуется благодаря вкладу наших добровольцев, чьи вычислительные мощности позволяют идентифицировать важные гены, определяющие прогрессирование рака легких и эффективность лечения. По состоянию на июль 2025 года волонтеры MCM получили более 2,7 миллиарда результатов, которые помогли нам определить генетические маркеры, определяющие риск и тяжесть развития рака. Мы высоко ценим вашу постоянную поддержку!

Проект MCM привел к открытию 26 генов с высокой оценкой, которые связаны с развитием рака легких. Мы исследовали PDE8B в нашем обновленном исследовании за май 2025 года, и следующий ген, на котором мы сосредоточимся, - это ECD.

ECD, белковый продукт гена ECD, выполняет множество функций в клетке, что делает его ключевым игроком как при здоровых, так и при раковых заболеваниях. Ниже кратко описаны его ключевые функции.

Коактивация транскрипции

ECD может функционировать как коактиватор транскрипции. Это означает, что ECD работает совместно с другими белками в ядре, “включая” гены в процессе, называемом транскрипцией, когда генетическая информация копируется из ДНК, чтобы получить инструкции для производства белков, которые выполняют различные функции в организме. Ключевым белком-партнером ECD является р300, который регулирует транскрипцию многих генов, в том числе тех, которые участвуют в пролиферации клеток. Хотя пролиферация является нормальной частью роста и заживления, если ее не контролировать, она может привести к раку. Поскольку ECD помогает регулировать этот процесс, это подтверждает его роль в развитии рака [PMID: 19919181,PMID:23307074].

Рисунок 2. Схема коактивации транскрипции ECD.

Прогрессирование клеточного цикла

Помимо своей роли в транскрипции генов, ECD также непосредственно влияет на пролиферацию клеток. Этот процесс регулируется клеточным циклом, серией строго регламентированных этапов, которые обеспечивают деление клеток в нужное время.

Движущей силой клеточного цикла является белок под названием E2F, который активирует гены, необходимые для завершения деления. Как правило, E2F регулируется другим белком под названием Rb, который обеспечивает репликацию клеток только тогда, когда это необходимо. ECD может напрямую связываться с Rb, освобождая E2F, позволяя E2F-опосредованному прогрессированию клеточного цикла продолжаться.

При чрезмерной активности ECD может быть нарушен контроль над клеточным циклом, что потенциально может привести к неконтролируемой репликации клеток и повышению риска развития рака. Однако потеря ECD также может быть вредной. Без достаточного количества ECD активность E2F может быть слишком ограниченной, что может препятствовать нормальному делению клеток, необходимому для таких важных процессов, как восстановление клеток. Таким образом, активность ECD должна тщательно регулироваться для поддержания надлежащего контроля клеточного цикла [PMID: 19640839].

Рисунок 3. Схема связывания ECD-Rb и его влияние на прогрессирование клеточного цикла, опосредованное E2F. При высоком уровне ECD высвобождается E2F, что приводит к усилению пролиферации в течение клеточного цикла.

Супрессорная регуляция опухолей

Несмотря на свою роль в передаче сигналов, способствующих росту, ECD в определенных условиях также замедляет процессы, препятствующие росту. Например, ECD является положительным регулятором р53, одного из важнейших белков для подавления роста опухоли.

В не раковых условиях р53 расщепляется белком MDM2, который поддерживает низкий уровень р53. ECD может связываться с MDM2 и предотвращать деградацию p53; таким образом, повышая активность p53 и способствуя опосредованной p53 репарации и остановке клеточного цикла [PMID: 16849563].

Рисунок 4. MDM2 способствует разрушению p53. Изолируя MDM2, ECD помогает стабилизировать p53, который усиливает свою противоопухолевую активность.

Сочетая анти - и пролиферативную роль ECD

Как описано выше, ECD может способствовать пролиферации клеток, взаимодействуя с p300 и Rb. Однако ECD также может защищать от рака, поддерживая передачу сигналов p53, пути подавления опухоли, который предотвращает деление поврежденных клеток. Эти, казалось бы, противоположные роли можно лучше понять, изучив более широкую картину развития рака. При многих видах рака р53 инактивируется или мутирует, а это означает, что роль ECD, стабилизирующая р53, не имеет значения. Следовательно, в этом контексте пролиферативная роль ECD становится более доминирующей и с большей вероятностью способствует прогрессированию рака [PMID:36400749].

Проявление ЭКД

ECD можно обнаружить практически в каждом органе тела, особенно высоко его содержание в пищеварительной системе (рис. 5). Экспрессия ECD, совпадающая с его присутствием в различных тканях, была обнаружена при множественных видах рака, таких как колоректальный рак, рак молочной железы, рак яичек и рак легких (рис. 6).

Как и ожидалось, учитывая его парадоксальную роль в пролиферативных и антипролиферативных процессах, ECD связан как с благоприятными, так и с неблагоприятными исходами при различных видах рака. Например, высокая экспрессия ECD связана с улучшением выживаемости при мультиформной глиобластоме, типе рака головного мозга. И наоборот, экспрессия ECD связана с более неблагоприятными исходами при почечно-хромофобном раке почки (также называемом почечно-клеточной карциномой). Таким образом, при оценке роли ECD в развитии рака важно учитывать специфику ткани и пациента.

Рисунок 5. Экспрессия ECD в тканях (Protein Atlas).

Рисунок 6. Экспрессия белка ECD была обнаружена при различных видах рака (Protein Atlas).

ECD при раке легких

Большинство исследований по ECD на сегодняшний день проводилось в контексте других видов рака, таких как рак молочной железы, желудка и шейки матки, и его роль при раке легких остается в значительной степени неизученной. Однако данные о результатах лечения пациентов свидетельствуют о том, что пациенты с аденокарциномой легкого (ADC) и низкой экспрессией ECD имеют большую вероятность выживания (рис. 7А). Однако при другом типе рака легких, называемом плоскоклеточной карциномой (SQC), уровни ECD, по-видимому, не влияют на выживаемость (рис. 7B).

В нашем предыдущем исследовании мы обнаружили, что различия в показателях выживаемости при ADC, основанные на экспрессии PDE8B, были связаны с курением. В частности, только у пациентов с ADC, которые курили в анамнезе, показатели выживаемости улучшились при высокой экспрессии PDE8B. Что касается ECD, то как курильщики, так и некурящие с ADC имели улучшенную выживаемость при низкой экспрессии ECD (рис. 8). Примечательно, что некурящие, по-видимому, в большей степени выигрывают от низкой экспрессии ECD (ОР: 2,29 у некурящих против 1,36 у курильщиков). Однако, учитывая короткий период наблюдения за исследованием, на эти результаты могут влиять и другие факторы, такие как возраст, пол и наличие других сопутствующих заболеваний (например, ожирения).

Рисунок 7. Кривая выживаемости Каплана-Мейера при аденокарциноме легкого (ADC) (A) и плоскоклеточном раке легкого (SQC) (B). Этот график описывает вероятность выживания (ось y) с течением времени (ось x). (А) Низкая экспрессия ECD (черная кривая) связана с большей вероятностью выживания при ADC легких по сравнению с низкой экспрессией ECD (красная кривая). В частности, низкая экспрессия ECD по сравнению с высокой экспрессией ECD связана с большими шансами на выживание (ОР = 1,47 (1,23-1,75), р = 1,4 ≈ 10-5). (B) Низкая экспрессия ECD не связана с большей вероятностью выживания при SQC по сравнению с высокой экспрессией ECD (ОР = 1,02 (0,84-1,24), p = 0,83). Рисунки, сгенерированные с помощью KM Plotter.

Рисунок 8. Кривая выживаемости Каплана-Мейера при аденокарциноме (ADC) у пациентов с курением в анамнезе (А) и у пациентов, которые никогда не курили (Б). Низкая экспрессия ECD (черная кривая) связана с более высокими шансами на выживание у пациентов с курением в анамнезе (ОР = 1,36 (1,05-1,78), p = 0,02) и у тех, кто не курил в анамнезе (ОР = 2,29 (1,21-4,3), p = 0,0084). Данные получены с помощью KM Plotter.

Несмотря на то, что РМЖП еще недостаточно хорошо изучена при раке легких, она связана с исходами при раке шейки матки, молочной железы и желудка (рисунок 9).

При раке шейки матки “подавление” ECD уменьшает характер роста опухоли в клеточных моделях, что позволяет предположить, что ECD является ключевым фактором в процессе заболевания [PMID:34670863].

При раке молочной железы экспрессия ECD положительно коррелирует со степенью злокачественности. Классификация рака - это метод классификации, используемый для оценки прогноза и потенциального ответа на лечение путем характеристики внешнего вида и поведения раковых клеток под микроскопом. Более высокие уровни РМЖП обнаруживаются при раке более высокой степени злокачественности [PMID:22270930]. Это говорит о том, что может существовать потенциальная связь между РМЖП и прогрессированием рака молочной железы, которую следует изучить.

При раке желудка ECD необходим для метастазирования, процесса, при котором рак распространяется на отдаленные участки по всему организму и часто становится неизлечимым [PMID: 29706618].

Рисунок 9. Связь между ТБЭ и негативными исходами при различных видах рака. Роль ТБЭ при раке легких все еще изучается.

Вывод

ECD - это ген, который управляет многими процессами, ведущими к развитию рака, включая рост, пролиферацию и метастазирование. Он уже был идентифицирован как важный маркер рака молочной железы, шейки матки и желудка, но недавние анализы указывают на связь между ECD и раком легких. Как и в случае с другими видами рака, высокая экспрессия ECD коррелирует с более низкой выживаемостью при аденокарциноме легкого (ADC). Поскольку мы продолжаем изучать молекулярные признаки, определяющие рак легких, ECD является еще одним многообещающим маркером для терапии и диагностики ADC, которые изменят жизнь пациентов.

Если у вас есть какие-либо вопросы, комментарии или идеи, мы будем рады их услышать! Не стесняйтесь делиться своими мыслями на форуме проекта.

Спасибо, что продолжаете поддерживать World Community Grid и расширяете возможности наших исследований!

Команда MCM

https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/article.s?articl...

https://www.worldcommunitygrid.org/research/mcm1/overview.do

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:

https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view

https://boinc.berkeley.edu/download_all.php

https://boinc.ru

Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC.

https://github.com/BOINC/boinc

Ссылка на телеграмм https://t.me/TSCRussia

Онкогенные нуклеопорины: Мутировавшие или аномально экспрессируемые белки из комплекса ядерных пор, которые стимулируют прогрессирование рака.

Прогностический маркер: биологический признак, связанный с клиническими исходами, такими как выживаемость или прогрессирование заболевания.

Фон

Проект MCM направлен на выявление молекулярных признаков, которые отличают рак легких от здоровых людей. Среди 26 генов, получивших высокую оценку, DYNLT1 выделяется благодаря своему участию во внутриклеточных транспортных механизмах и его значению в биологии рака.

Этот белок, некаталитический компонент цитоплазматического динеинового моторного комплекса, необходим для клеточных процессов, таких как митоз, нейрогенез и проникновение вируса в клетки-хозяева.

Dynlt1 также регулирует длину первичных ресничек, влияя на критические клеточные сигнальные пути. Кроме того, он взаимодействует с онкогенными нуклеопоринами и вирусными белками, способствуя нарушению регуляции генов и лейкозной трансформации. Эти многогранные роли подчеркивают его значение, как в нормальной физиологии, так и в болезненных состояниях.

Dynlt1 взаимодействует с онкогенными нуклеопоринами, способствуя нарушению регуляции генов и лейкозной трансформации. Он также связывает вирусные белки, такие как мелкий капсидный белок PAPILLOMAVIRUS человека (HPV) L2, помогающий в доставке вирусной нуклеиновой кислоты в ядро хозяина.

С момента своего открытия Dynlt1 был связан с различными раковыми заболеваниями и биологическими процессами. Его экспрессия по типам тканей была изучена, выявляя низкую специфичность ткани, но заметную прогностическую ценность при определенных видах рака.

Исследование DYNLT1 - Роль при раке легких

В контексте рака легких DYNLT1 демонстрирует защитную роль при аденокарциноме легкого (ADC) и плоскоклеточном раке легкого (SQC).

Новые исследования показывают, что повышенная экспрессия DYNLT1 способствует клеточной пролиферации и миграции, что является важнейшими факторами метастазирования рака. Эти данные указывают на то, что DYNLT1 является потенциальной диагностической и терапевтической мишенью для рака легких.

Другие виды рака

DYNLT1 играет важную роль при нескольких основных типах рака и оказывает как защитное, так и негативное влияние на прогноз.

Рак молочной железы: усиливает метаболизм митохондрий за счет ингибирования убиквитинирования VDAC1, способствующего росту опухоли. Это также диагностический и прогностический маркер, связанный с метаболизмом липидов, который имеет решающее значение для прогрессирования рака.

Глиобластома: способствует онкогенезу за счет взаимодействия с сигнальными путями, что подтверждается иммуногистохимическими анализами тканей пациента.

Рак желудка: Экзосомальный miR-15b-3p усиливает онкогенез по пути DYNLT1/каспаза-3/каспаза-9, подчеркивая его роль в злокачественной трансформации.

Вывод

DYNLT1 играет ключевую роль в биологии рака, влияя на клеточный транспорт, сигнальные пути и онкогенез. Его участие в развитии рака легких — наряду с его более широкой ролью в других злокачественных новообразованиях — подчеркивает его потенциал в качестве мишени для диагностических и терапевтических разработок. По мере того, как мы углубляемся в изучение молекулярных особенностей рака легких, DYNLT1 становится перспективным кандидатом для будущих исследований.

Если у вас есть какие-либо вопросы или идеи по поводу этого обновления, не стесняйтесь поделиться ими в теме. Спасибо за поддержку наших исследований!

Команда MCM

https://www.worldcommunitygrid.org/research/mcm1/overview.do

https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/article.s?articleId=822

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:

https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view

https://boinc.berkeley.edu/download_all.php

https://boinc.ru

Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC.

https://github.com/BOINC/boinc

Ссылка на телеграмм https://t.me/TSCRussia

Мы воодушевлены этим конкурсом и его потенциалом для продвижения нашей работы в средних школах не только в Соединенных Штатах, но и во всем мире. Приятно отметить, что Sisler Cyberacademy также участвует в конкурсе, и у них уже есть команда из 12 партнеров.

Чтобы обеспечить достаточное количество рабочих единиц на протяжении всего конкурса, мы будем увеличивать поставку рабочих единиц MCM, OPN, SCC и ARP на время конкурса, с 25 марта по 7 мая. Текущий статус: MCM - готовый; ОПН – готов; ССС – готово; АРП - в процессе.

Мы благодарим вас за вашу постоянную поддержку и продолжим предоставлять обновления по ходу конкурса. Если у вас есть какие-либо вопросы или комментарии, пожалуйста, оставьте их в этой теме, чтобы мы могли ответить.

Команда WCG

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:

https://boinc.ru

https://computationmoonshot.org/

https://www.worldcommunitygrid.org/images/prismic/WCG_Newsletter_Oct_2023.pdf

https://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,46603_offset,0#695455

Фон

Идентификация молекулярных маркеров и их комбинаций (сигнатур) позволяет нам выявлять заболевание на более ранней стадии (диагностические сигнатуры) и стратифицировать пациентов на подгруппы на основе закономерностей прогрессирования заболевания (прогностические сигнатуры), что потенциально может привести к определению того, какие пациенты могут получить пользу от различных вариантов лечения (прогностические сигнатуры). . Проект Mapping Cancer Markers анализирует наборы данных с миллионами точек данных, собранных у пациентов с раком и саркомами, чтобы найти такие диагностические, прогностические и прогностические признаки.

С ноября 2013 года волонтеры World Community Grid пожертвовали проекту более 894 000 лет процессорного времени, помогая анализировать данные о раке и саркоме легких и яичников гораздо более тщательно, чем это было бы возможно в противном случае. Мы безмерно благодарны за эту постоянную поддержку.

Далее описывая 26 генов с наибольшим количеством баллов при раке легких, мы уже обсуждали VAMP1, FARP1, GSDMB, AHD6, IL13RA1, PCSK5 и TLE3 в предыдущих обновлениях MCM. Здесь мы излагаем информацию о HSD17B11. Важно отметить, что на данный момент между всеми этими белками существует сильная связь, как показано на рисунке 1. HSD17B11 является четвертым по количеству связанных белков в нашем списке, при этом FARP1, TLE3, PCSK5 являются более связанными.

Рисунок 1. Физические взаимодействия белков, связывающие 8 белков, на которых мы сосредоточились до сих пор (розовые узлы). Данные из нашей базы данных IID.

HSD17B11 Исследования

HSD17B11 — это ген, который кодирует белок, называемый гидроксистероид-17-бета-дегидрогеназа 11. Гидроксистероид-17-бета-дегидрогеназа 11 может превращать андростан-3-альфа,17-бета-диол в андростерон in vitro, что позволяет предположить, что он может участвовать в выработке андрогена.

Учитывая его структуру (рис. 2), HSD17B11 имеет четыре известных лиганда, которые могут с ним связываться, включая андростерон, глицерин, сульфат-ион и хлорид-ион.

Рисунок 2. Структура белка HSD17B11 (PDB).

Крупный метаанализ показал, что однонуклеотидные полиморфизмы в HSD17B11 в значительной степени связаны с мышечной массой тела [1]. Также было обнаружено, что HSD17B11 является потенциальным биомаркером ишемической болезни сердца [2] и идиопатической необструктивной азооспермии [3].

Было обнаружено, что HSD17B11 играет защитную роль при раке легких (рис. 3), как и другие гены, которые мы представили до сих пор.

Рисунок 3. а) Кривые выживаемости пациентов с низкой и высокой экспрессией HSD17B11 (KMplot). б) Еще более сильная связь обнаружена для аденокарциномы легких и в) для никогда не куривших.

Мы продолжили исследования, чтобы изучить связь между HSD17B11 и другими видами рака. Как показано на рисунке 4, при сравнении раковых тканей и нормальных тканей, HSD17B11 дифференциально экспрессируется при большинстве видов рака (обозначено красным текстом).

При большинстве видов рака его активность повышена, за исключением рака молочной железы, толстой кишки, плоскоклеточного рака легких, рака яичников, почек, щитовидной железы и матки. В литературе HSD17B11 связан с прогнозом рака простаты [4] и выживаемостью при раке поджелудочной железы [5].

Рисунок 4. Экспрессия HSD17B11 в нормальной и раковой ткани при нескольких типах рака. Красный текст представляет значительную разницу между экспрессией в раковой ткани по сравнению с нормальной тканью (TNMplot).

Если у вас есть какие-либо вопросы или комментарии, пожалуйста, оставьте их в этой теме, чтобы мы ответили!

Команда WCG

https://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,46581_offset,0#695182

Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:

https://boinc.ru