Индийский штамм проник в Россию при попустительстве властей
Отсутствие должной реакции ответственных лиц привело к распространению в России коронавируса с тремя мутациями, заявил ведущий научный сотрудник Федерального исследовательского центра фундаментальной и трансляционной медицины (ФИЦ ФТМ) Александр Чепурнов
«Сегодня к нам пришел и активно пришел индийский штамм. Почему не перекрыли границы, когда начались проблемы и стало понятно, что в Индии появился штамм, который обладает двумя или тремя мутациями?» — поинтересовался Чепурнов.
По словам эксперта, у индийского варианта вируса вычленено три мутации, «которые не ловятся теми антителами», которые сегодня вырабатываются у вакцинированных лиц. Отсюда и случаи заражения коронавирусом среди тех, кто привился, в том числе, российским препаратом «Спутник», отметил он.
«Это означает что в 1,5 – 2,5 раза ослабевает вакцина по отношению к этому новому новому варианту. Это уже не моя оценка, а того самого Гинцбурга (директор НИЦ эпидемиологии и микробиологии имени Гамалеи Александр Гинцбург — прим. ИА Красная Весна), который собственно разрабатывал вакцину, — то, что он сам заявлял», — заключил ученый.
Ранее мэр Москвы Сергей Собянин заявил, что почти у 90% недавно заболевших COVID-19 жителей столицы выявили мутировавший индийский штамм коронавируса SARS-CoV-2.
По словам Собянина, для борьбы с этим штаммом уровень антител должен быть вдвое выше, чем для борьбы с первоначальным штаммом SARS-CoV-2, поэтому привившимся год назад жителям Москвы необходимо пройти вакцинацию по второму кругу.
Лучшая вакцина от COVID-19 и бустер Moderna-3
На прошлой неделе массачусетсчкая компания Moderna отличилась на Всемирном конгрессе вакцин 2021 года прошедшем в Вашингтоне с 5-6 мая. Эксперты конгресса, признали вакцину массачусетской компании лучшей от коронавируса.
Подробно - в прессе релизе компании и Welcome to Massachusetts (дайждест на русском языке)
Также Moderna отчиталась об эффективности третьей дозы вакцины против бразильского и южноафриканского штаммов COVID-19. Об этом говорят предварительные данные испытаний опубликованные в пресс-релизе компании. Бостонский старт-ап продолжит исследование и направит результаты испытаний для утверждения третьей дозы вакцины в FDA – управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Источник;
https://WelcometoMA.com/Moderna-3/
https://www.terrapinn.com/conference/world-vaccine-congress-...
КРИОКОНСЕРВАЦИЯ ШТАММОВ ВИРУСОВ И БАКТЕРИЙ В НИЗКОТЕМПЕРАТУРНЫХ МОРОЗИЛЬНЫХ КАМЕРАХ
Сложная эпидемиологическая обстановка в мире в последние годы, включая регулярные вспышки вирусных заболеваний, как, например, эпидемия атипичной пневмонии в 2003 году (коронавирус SARS-CoV-1), эпидемия «свиного» гриппа А (H1N1) в 2009 году, распространение острого респираторного синдрома (MERS-CoV) в 2012-м, вспышки лихорадки Эбола в 2014, 2016 и 2018 годах и развивающаяся с 2019 г. пандемия коронавирусной инфекции (SARS-CoV-2), выдвигает на первый план решение фундаментальных вопросов биологической безопасности, связанной с изучением новых и возвращающихся инфекций, вирусов с высокой степенью изменчивости генома, обладающих повышенной эпидемической опасностью и относящихся к сфере социально значимых инфекций.
Для решения этих вопросов как никогда становится актуальной задача разработки оптимальных условий консервации и длительного хранения вирусных штаммов и создания соответствующих рекомендаций для депонирования вирусов, выделенных во время эпидемических вспышек особо опасных возбудителей или возбудителей социально значимых инфекций.
Наиболее широко используемыми методами консервации в настоящее время являются: лиофилизация; криоконсервация (ниже -80°C) и комбинация обоих методов.
Для хранения лиофилизированного вирусного материала используются низкотемпературные морозильники с температурой охлаждения до -86°C. Для хранения жидких замороженных вирусных суспензий рекомендуется использование ультранизкотемпературных морозильников с диапазоном температур до -150°C или криохранилищ с жидким азотом для хранения образцов при температуре до -196°C.
КРИОГЕННОЕ ОБОРУДОВАНИЕ
О распространенности метода криоконсервации биоматериалов свидетельствует хорошо развитая инфраструктура производства и широкий ассортимент криогенного оборудования, включающего криозамораживатели, криохранилища и транспортные криорезервуары (сосуды Дьюара различного назначения), морозильники, а также различные аксессуары и расходные материалы.
Криозамораживатели предназначены для контролируемого замораживания при помощи жидкого азота. Для криоконсервации микроорганизмов, как правило, не требуется специальных программных замораживателей, как в случае клеток эукариотов, клеточных линий и органов.
Криохранилища представляют собой специализированное оборудование, выпускаемое различными фирмами, которое обеспечивает возможность транспортировки и хранения биоматериалов в жидком азоте.
Низкотемпературные и ультранизкотемпературные морозильники. Выпускается множество типов холодильников с температурой охлаждения до -86°C и до -150°C, которые успешно применяются для хранения вирусов, бактерий и других клеточных материалов. Например, низкотемпературные морозильники от компаний PHCBI (бывш. Panasonic, Япония), Esco (Сингапур), Vestfrost (Дания), Eppendorf (Германия), Haier (КНР) и др.
МОРОЗИЛЬНЫЕ КАМЕРЫ vs КРИОХРАНИЛИЩА
К основным недостаткам стандартных криохранилищ с использованием сосудов Дьюара с жидким азотом для хранения образцов при температуре до -196°C можно отнести:
• низкую оперативность;
• потери жидкого азота в процессе хранения;
• необходимость в регулярных поставках жидкого азота и обеспечении условий для его хранения (оборудование, дополнительные помещения);
• флуктуации температуры в камере;
• высокую вероятность ошибок;
• опасность работы с большими количествами жидкого азота;
• возможность несанкционированного отбора штаммов.
В тоже время, низкотемпературные морозильные камеры обладают рядом серьезных преимуществ, таких как:
• Надежность и легкость в управлении;
• Минимизация ошибок оперирования;
• Наличие защитных противоаварийных систем;
• Высокая вместимость (до 70000 образцов в одном морозильнике);
• Компактность;
• Стабильная температура хранения, исключающая значительные флуктуации температуры в камере;
• Легко реализуемая возможность использования компьютерной системы управления.
Иллюстрацией сравнительных значений флуктуации температуры может служить Рис.1, на котором наглядно представлено распределение температур в различные областях обычного криохранилища с жидким азотом на разной высоте от уровня азота (слева) и в крио-камере сверхнизкотемпературного морозильника (справа).
Рис.1. Сравнительное распределение температуры внутри камеры криосистемы на основе жидкого азота и ультранизкотемпературного морозильника.
Следует отметить, что современные крио-морозильники при необходимости могут быть оборудованы дополнительной аварийной сигнальной системой, работающей на аккумуляторе, и устройствами аварийной подачи паров жидкого азота или углекислого газа (LN2или CO2). При наличии этих систем легко организовать обеспечение надежной работы морозильных камер и хранилищ на их основе при отключении электроэнергии или поломке оборудования с использованием:
• Батареи бесперебойного питания;
• Генератора переменного тока;
• Резервной системы, работающая на жидком азоте.
УЛЬТРАНИЗКОТЕМПЕРАТУРНЫЕ МОРОЗИЛЬНИКИ (до −150°C)
Для хранения жидких замороженных вирусных суспензий рекомендуется использовать ультранизкотемпературные морозильники с диапазоном температур до -150°C. Это связано с тем, что для обеспечения длительного хранения чувствительных образцов необходимо в процессе заморозки получить аморфные кристаллы воды, содержащейся в образце, а в дальнейшем важно избежать перекристаллизации этой воды до более крупных кристаллов, приводящих к разрушению образца. Температура перекристаллизации для замороженной воды составляет в среднем от -115 до -130ºС. При дальнейшем понижении температуры образование кристаллов льда уже не происходит, и вода замерзает аморфной стеклоподобной массой. Таким образом, хранение образцов вирусных суспензий при -150ºС, т.е. при температуре гораздо ниже температуры их рекристаллизации, позволяет хранить такие материалы практически неограниченное время без потери свойств, что является хорошей альтернативой криохранению в жидком азоте или в парах жидкого азота, так как не требует расходных материалов.
Самые современные высокотехнологические модели морозильников для ультранизкого охлаждения предлагают компании PHCBI (бывш. Panasonic, Япония) и Haier Biomedical (КНР). Этими компаниями разработаны горизонтальные морозильники (лари), обладающие всеми техническими особенностями и решениями для надежного хранения образцов, такими как каскадная двухступенчатая система охлаждения, специально сконструированный компрессор, микропроцессорный контроль, высокотехнологичная изоляция камеры на основе V.I.P. панелей из вспененного полиуретана, различные виды сигнализации. Поддержание заданной температуры, пуск и контроль работы компрессора осуществляются автоматически, что гарантирует сохранность биоматериала, экономичность эксплуатации и увеличивает ресурс компрессора. Если компрессор перегревается настолько, что это влияет на эффективность его работы, система подаёт сигнал тревоги. Кроме того, устройство подаёт звуковой и световой сигнал при отклонении от заданной температуры в ту или иную сторону, перебоях в электропитании, отказах датчиков, падении эффективности охлаждения, чрезмерно высокой температуре окружающей среды.
Особо следует отметить уникальную систему «U–COOL», позволяющую информировать пользователя о текущих параметрах работы крио-морозильника и отказах системы с помощью SMS сообщений на мобильный телефон пользователя, с возможностью удалённого редактирования критических параметров и задания рабочей температуры. Данной функцией оснащен ультранизкотемпературный биомедицинский морозильник DW-150W200 (−126 …−150 °C) уже в базовой комплектации.
НИЗКОТЕМПЕРАТУРНЫЕ МОРОЗИЛЬНИКИ (до −86°C)
Низкотемпературные морозильники с рабочей температурой до -86 °C представлены на рынке в широком диапазоне объемов — вплоть до 959 л, как в вертикальном, так и в горизонтальном (лари) исполнении. Для достижения столь низких температур в морозильниках используются различные конструктивные решения, такие как использование каскадной системы охлаждения, установка сверхмощных компрессоров или даже наличие двух независимых систем охлаждения с двумя независимыми компрессорами, каждый из которых может работать самостоятельно при выходе из строя второго компрессора, поддерживая заданную температуру и обеспечивая двойную защиту образцов. Например, целый ряд моделей с двойной независимой системой охлаждения TwinGuard предлагает компания PHCbi. Серия лабораторных морозильников DW-86L…S/ ST (−86°C), выполненная по запатентованной Haier Biomedical технологии TwinCool, позиционируется не только как серия морозильников с повышенной надежностью, но и отличается пониженным энергопотреблением и низким уровнем шума. В этой связи следует также отметить вертикальные низкотемпературные морозильники с технологией Salvum Smart Frequency Conversion, серии DW-86L…BP/BPT, занимающие в мире лидирующие позиции в области энергосбережения, обладая сверхнизким энергопотреблением, вплоть до 8,2 кВтч/сут. В вертикальных морозильниках, сделанных по технологии Salvum, в качестве хладагента применяется углеводородный хладагент HC, при этом компрессоры оборудованы инверторными двигателями с регулируемой частотой вращения, что позволяет экономить электроэнергию и продлевает срок службы компрессора. Модели этой серии характеризуются низким уровнем шума за счёт технологии адаптивного контроля, которая управляет вентиляторами и компрессорами, обеспечивая снижения уровня шума до 43,5 дБ. Для снятия данных предусмотрен USB порт. Модели с индексом «T» имеют панель управления с тачскрином, позволяющей осуществлять отображение параметров в реальном времени через ЖК дисплей. Эта панель управления может быть синхронизирована со смартфоном или персональным компьютером (опция). Модели с новой панелью управления могут быть подключены к информационной системе управления лабораторией Haier BIMS, включающей в себя систему инвентаризации образцов, что позволяет организовывать автоматизированные «умные» криохранилища для безопасного содержания любого количества образцов штаммов вирусов или бактерий.
Для повышения безопасности сохранения образцов и минимизации поступления теплого воздуха из окружающей среды низкотемпературные морозильники оснащаются, помимо внешней двери, дополнительными внутренними дверьми, что гарантирует минимизацию колебаний температуры при открытии.
При необходимости, возможно оснащение криогенных низкотемпературных морозильников дополнительными устройствами, такими как системы аварийной подачи паров жидкого азота или углекислого газа (LN2или CO2), способные поддерживать рабочую температуру в течение не менее 24 часов; логгерами данных на автономном питании для измерения и записи рабочих параметров; дистанционными системами аварийной сигнализации.
СИСТЕМЫ РЕЗЕРВНОГО ПОДДЕРЖАНИЯ ТЕМПЕРАТУРЫ
Как уже отмечалось, современные крио-морозильники могут быть оборудованы дополнительной системой резервного поддержания температуры (так называемая back-up система), которая необходима в первую очередь для обеспечения сохранности биоматериалов при отключении электропитания. В случае повышения температуры в камере морозильника относительно заданной, автоматически включается back-up система и в камере крио-морозильника открывается клапан, через который впрыскивается азот или углекислый газ, что позволяет обеспечивать работоспособность морозильника в случае отключения электроэнергии за счет наличия в back-up системе независимого энергоснабжения.
Аварийная back-up система охлаждения с использованием LN2 (для поддержания температуры от -90°С до -135°С)
Резервная система охлаждения LN2 — это независимая холодильная система для ульранизкотемпературных морозильников. При аварийной потере мощности и увеличении температуры в камере, срабатывает сигнализация, после чего резервная система LN2 автоматически активируется, подавая LN2 в камеру для поддержания требуемой температуры. Резервная система работает от перезаряжаемой батареи. При этом температура в камере поддерживается на уровне примерно -135°С в течение до 24 часов при объеме азота в сосуде Дьюара в 100 л.
Основные преимущества:
• Блокирование впрыска LN2 при открытии двери
• Схема защиты для предотвращения перезаряда батареи
• Легкий вес и портативная конструкция, позволяющая установить систему сверху морозильной камеры Функции сигнализации при низком заряде батареи и показании ошибок датчиков
Аварийная back-up система охлаждения с использованием CO2 (для поддержания температуры от -40°С до -70°С)
Аварийная back-up система охлаждения с использованием CO2 применяются для страхования безопасности образцов, подлежащих хранению в низкотемпературных морозильниках.
• Система компактна и удобна в использовании
• Настройки интерфейса позволяют регулировать температуру
• Простое программирование
• Система может быть установлена на любой низкотемпературный морозильник, имеющий специальное отверстие для присоединения
Преимущества
• На панели управления имеется контрольная кнопка для проверки работоспособности системы
• Сигнализация низкого уровня СО2 в баллоне - предупреждает пользователя о том, что надо заменить баллон с жидким СО2
• Позволяет поддерживать необходимую температуру до 48 часов
АКСЕССУАРЫ И ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ПРИНАДЛЕЖНОСТИ ДЛЯ НИЗКОТЕМПЕРАТУРНЫХ МОРОЗИЛЬНИКОВ
Низкотемпературный морозильник рекомендуется использовать со специальными системами хранения, что обеспечит оптимальное использование пространства. Целесообразно также пользоваться специальным пластиком (пробирки, штативы), выдерживающим низкие температуры. Для большинства клеток оптимальная скорость криоконсервации составляет 1°C/мин при температуре до -80°С, для чего были разработаны специальные штативы для криозаморозки, которые, находясь в морозильной камере, позволяют избежать резкого снижения температуры и обеспечивают медленное и равномерное замораживание клеток в криопробирках и виалах, без необходимости использования программных криозамораживателей.
Криопробирки (1)
Криопробирки применяются для хранения биологических образцов, как одноразовые лабораторные расходные материалы. Криопробирки могут эксплуатироваться при температуре в диапазоне -196°С... +121°С. Криопробирки изготовлены из медицинского полипропилена, имеют круглое дно и прозрачные стенки. Они стерилизованы гамма-излучением и упакованы в стерилизованные пакеты. Силиконовое кольцо, вкладываемое в винтовую крышку, предотвращает загрязнение, вызванное утечкой жидкости, обеспечивая безопасность образцов.
Криобоксы (2)
Для удобства хранения криопробирок используются криобоксы, представляющие собой коробки с гнездами для установки в них криопробирок. Криобоксы разработаны по стандартным размерам и соответствуют стандартным криопробиркам и стеллажам для крио боксов. Криобоксы хорошо вентилируемы и обеспечивают быстрое охлаждение.
Криобоксы изготовлены из полипропилена и пригодны для использования при температурах от -80°С до +121°С. Криобоксы химически устойчивы к спиртам и мягким органическим растворителям.
Стеллажи с выдвижными полками для криобоксов (3)
Стеллаж для криобоксов, выполненный из нержавеющей стали, представляет собой конструкцию с выдвижными полками, устанавливаемую на полку низкотемпературного морозильника. Стеллажи имеют стандартные размеры и подходят для большинства типов криобоксов.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Из представленного материала видно, что криоконсервация микроорганизмов в низкотемпературных камерах, несомненно, является весьма удобным и эффективным способом хранения различных штаммов вирусов и бактерий. При этом необходимо отметить, что данный способ криоконсервации получает всё большее распространения в качестве альтернативы классической схеме консервации с использованием жидкого азота. В табл.1 представлены рекомендованные режимы криохранения для широкого ряда биологических объектов.
Таблица 1. Рекомендованные требования к хранению биоматериалов
В ряде музеев многие бактериальные культуры достаточно успешно хранятся при температурах, которые обеспечивают современные морозильники (обычно до минус 86°С). При этих температурах хранения скорость отмирания может быть в 1000 раз меньше, чем при минус 10°С.
Назван штамм коронавируса против которого вакцины дают сбой
Исполняющий обязанности директора ФГБУ "НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева" Минздрава России Дмитрий Лиознов рассказал в ходе выступления на конгрессе педиатров России об исследовании эффективности применения вакцин от новых штаммов коронавируса.
По словам Лиознова, сегодня проводятся разносторонние исследования о способности вакцин быть активными при британском, бразильском, южноафриканском и американском штаммах коронавируса.
"И в целом мы видим, что вакцины пока защищают от этих возбудителей", - сказал эксперт.
"Хотя южноафриканский, например, показывает немножко сниженную эффективность вакцинации", - в тоже время обратил внимание Лиознов.
При этом врач подчеркнул, что в случае этой мутации вакцина все равно защищает.
https://www.mk.ru/social/health/2021/03/06/nazvan-shtamm-kor...
А от "африканского" штамма – были проведены лабораторные исследования – вакцины, которые сейчас применяются, дают защиту, но непонятно, в какой степени. Она снижена, но насколько, неясно. То есть 95% защиты превратилось в 85 или в 65 – неизвестно. Поэтому некоторое беспокойство это вызывает, но это не конец света, потому что все-таки защита есть.
Максим Скулачев
вирусолог
Ну наконец то, нигерийский коронавирус
Новый штамм коронавируса обнаружили в Нигерии в декабре прошлого года.
«Нигерийский штамм» - это мутировавший коронавирус, который устойчив к вакцинам. Им уже заражен север Италии и некоторые районы Великобритании. В начале марта появились новости о заражении нигерийским коронавирусом в Словении.
В России на данный момент не зафиксировано ни одного случая заражения новым вариантом вируса.
пруф
https://360tv-ru.turbopages.org/360tv.ru/s/news/tekst/nigeri...
Четвертый штамм SARS-CoV-2. Коронавирус становится опаснее?
Потенциально опасные штаммы коронавируса распространяются по миру. Британская разновидность, по предварительным данным, в 1,65 раза увеличивает риск смерти. Мутант, обнаруженный в ЮАР, ускользает от антител. Новую линию выявили в Бразилии, еще один вариант — в США. К чему ведет эволюция SARS-CoV-2 ?
Что такое мутация
При репликации вирусного генома часто случаются ошибки, обычно это точечные мутации — замены, перестановки букв генетического кода, удаления. Особенно это характерно для РНК-вирусов, к которым относится и SARS-CoV-2. Для исправления ошибок есть специальные ферменты, но они не всегда успешно срабатывают, так что вирусы постепенно эволюционируют.
В геноме возбудителя COVID-19 зашита информация о белках, отвечающих за репликацию и воздействие на клетки организма-хозяина, а также формирующих вирусную частицу, включая — поверхностный белок-шип. С его помощью вирус цепляется к клетке и проникает внутрь.
Защитная система организма распознает в белке-шипе чужака и вырабатывает особые белки-антитела, нейтрализующие инфекцию. По этой причине многие виды вакцин — векторные, мРНКовые, субъединичные — тренируют иммунитет, имитируя белок-шип. На него настроены и ПЦР-тесты для обнаружения возбудителя.
Изменения белка-шипа могут приводить к ускользанию коронавируса от тестов, сформированного иммунитета и некоторых вакцин. Поэтому исследователи с самого начала эпидемии выборочно секвенировали геном возбудителя, чтобы следить за его эволюцией. Результаты со всего мира загружают в базу GISAID. Сейчас там уже более полумиллиарда образцов.
Первая мутация коронавируса, которая привлекла большое внимание, возникла в начале пандемии в Китае. Это D614G, что расшифровывается как замена в молекуле белка 614-й по счету аминокислоты аспартата (обозначается буквой D) на глицин (G). Предполагали, что именно благодаря этой мутации вариант быстро распространился по всему миру. Но на опасность вируса она не повлияла.
Британский вариант B.1.1.7
Осенью прошлого года ученые зафиксировали возникновение нового мутанта. Произошло это в английском графстве Кент, отсюда и название — кентский, британский. Подскочила заболеваемость, многие страны прекратили сообщение с Соединенным Королевством. Эксперты признали, что этот вариант возбудителя более заразен. Ему присвоили код — VUI-202012/01: он включает аббревиатуру термина Variant Under Investigation (вариант на рассмотрении), а дальше по порядку — год, месяц и номер.
Уже в середине января 2021-го на брифинге в Агентстве здравоохранения Великобритании заявили, что новый вариант доминирует в стране и, по предварительным оценкам, он более опасен. Код изменили на VOC-202012/01, где VOC — Variant of Concern (вариант, вызывающий тревогу).
VOC-202012/01 произошел от D614G и уже сформировал собственную линию — B.1.1.7. Всего в нем 14 мутаций, из которых значимы три — и все в белке-шипе.
Белок-шип (S-белок) очень большой, это цепь из 1273 пептидов, скрученная и перевитая. Его головная часть служит, фигурально выражаясь, отмычкой от замка в клетку человека. За изменениями этой отмычки ученые наблюдают особенно тщательно, поэтому их сразу насторожила мутация N501Y. Всего лишь замена одной аминокислоты на другую — но вирус стал более заразным.
Еще одна мутация — P681H — обнаружена в том месте, где расщепляется белок. Само по себе это расщепление — новация SARS-CoV-2. Считают, что она делает патоген более вирулентным. К чему приведет ее изменение, еще предстоит выяснить.
Третье значимое изменение — делеция 69-70, удаление шести оснований в гене, кодирующем аминокислоты 69 и 70. Как выяснилось, это сбивает с толку некоторые ПЦР-тесты, в частности системы TaqPath фирмы ThermoFisher Scientific — их широко используют в Великобритании. Они дают положительный результат, если в образце обнаружены сразу три следа возбудителя — из белка-шипа, нуклеокапсидного белка (внутренняя оболочка вируса) и неструктурных белков. Делеция 69-70 приходится как раз на тот участок, который анализирует тест, поэтому результат получается ложноотрицательным.
Однако этот "прокол" тест-систем британцы обернули в свою пользу. Поскольку в 99,6 процента случаев ложноотрицательный результат совпадает с делецией 69-70, а она, в свою очередь, служит маркером VOC-202012/01, то по числу тестов можно буквально в реальном времени следить за распространением нового варианта возбудителя. Сейчас он доминирует в Великобритании и быстро идет по миру.
Отслеживая контакты зараженных этой версией коронавируса, ученые выяснили: скорость распространения у нее на 25-40 процентов выше, чем обычно. И риск смерти больше в 1,65 раза, уточняют эксперты из группы по отслеживанию новых вирусных угроз NERVTAG. Впрочем, оценки предварительные, по мере накопления данных их пересмотрят.
© Freunde von GISAID e.V.
Мутации в спайк-белке. Синие — найдены более ста раз, серые — менее ста раз, розовые — в сайтах гликозилирования, желтые — мутации на участке, цепляющемся за мембрану клетки. Зеленая спираль — человеческий рецептор ACE2
Новый мутант из ЮАР
Большинство вариантов коронавируса возникает точечно и быстро вымирает, лишь немногие формируют линии, способные находить новые жертвы. Долгое время ученые не могли сказать, имеет ли какая-то из мутаций эволюционное преимущество, закрепится ли в популяции или исчезнет. Теперь ситуация иная. В ЮАР обнаружили вариант, который содержит три значимые мутации в белке-шипе. Одна из них аналогична британскому N501Y. Вторая — E484K — также расположена в "отмычке". Как показали лабораторные эксперименты, этот мутант легче ускользает от действия нейтрализующих антител плазмы переболевших.
Сейчас южноафриканскую версию — B.1.351 — встречают более чем в двух десятках стран. А точечную мутацию E484K регистрируют в разных вариантах и многих регионах. Вероятно, возбудитель меняется, приспосабливается к растущему коллективному иммунитету.
Довольно живучий — мутант P.1, выделенный в конце прошлого года в Японии у путешественников из Бразилии. У него 17 мутаций, включая три в белке-шипе: K417T, E484K, N501Y. В городе Манаус, где наблюдалась большая вспышка, его нашли в почти половине тестов. Это указывает на повышенную заразность. В январе бразильский вариант обнаружили в США.
На днях пришла новость об еще одном варианте коронавируса, выявленном в Южной Калифорнии — части самого густонаселенного штата США. Его обозначают как 20C/S:452R. Нужно изучить, насколько быстро он распространяется, предупреждают авторы заметки в "Журнале Американской медицинской ассоциации", среди которых эпидемиолог Энтони Фаучи из Центра исследования вакцин. Кроме того, в калифорнийской версии есть мутация L452R в белке-шипе, сообщают эксперты, и это может помешать лечению ковида некоторыми моноклональными антителами.
В чем опасность новых мутантов
О том, что некоторые мутации не случайны, а появились в результате направленного отбора, пишут российские ученые. В январе они опубликовали результаты расшифровки генома коронавируса, выделенного у женщины, болевшей COVID-19 четыре месяца. Из-за онкологии у нее был понижен иммунитет.
За это время вирус эволюционировал в организме и приобрел две важные мутации в белке-шипе: Y453F и делецию 69-70HV. Раньше такую комбинацию находили у зверьков на норочьих фермах. Уже известно, что она усиливает способность вируса к репликации и ускользанию от защитных и некоторых терапевтических антител. Есть вероятность, что такой вариант возбудителя попадет из больного или норочьего организма в общую популяцию.
Татьяна Пичугина.
Вирус-мутант, новый этап эпидемии?
Новый вид вируса обнаружен доктором Бетт Корбер (Dr Bette Korber), сотрудницей Лос-Аламосской национальной лаборатории США, расположенной в штате Нью-Мексико. Она утверждает, что гибрид произошел от слияния двух штаммов: британского B.1.1.7 и зародившегося в США B.1.429. Пока специалистам известно лишь об одном случае заражения гибридной версией вируса, кроме того, о заразности нового вида данных нет, однако не исключается, что инфицированных пациентов может быть больше.
Издание New Scientist со ссылкой на специалистов сообщает, что новый вид, судя по всему, появился в результате «рекомбинационного события», то есть обмена генами между вирусами, вступившими в контакт при заражении одной клетки.
Отмечается, что в прошлом уже высказывались опасения относительно образования гибридов, однако специалисты полагали, что это маловероятно, потому что для этого необходимы особые условия. Так, человек должен быть одновременно инфицирован двумя штаммами, переданными ему от разных носителей. Поскольку на разных территориях преобладают доминирующие варианты SARS-CoV-2, некоторые ученые полагают, что вероятность заразиться сразу двумя штаммами крайне мала.
New Scientist уточняет, что в случае подтверждения происхождения нового вируса он станет первым гибридом, выявленным за время пандемии COVID-19.
Ранее ученые Рокфеллеровского университета в Нью-Йорке и других исследовательских организаций заявили, что мутировавшие штаммы SARS-CoV-2 из Великобритании, Южной Африки и Бразилии могут незначительно снизить эффективность вакцин, однако инъекции пока все же защищают от болезни COVID-19. Специалисты предположили, что новые варианты вируса легче распространяются и это может привести к увеличению числа случаев заболевания, смертей и госпитализаций.
https://www.newscientist.com/article/2268014-exclusive-two-v...