103

Четвертый штамм SARS-CoV-2. Коронавирус становится опаснее?

Четвертый штамм SARS-CoV-2. Коронавирус становится опаснее? Коронавирус, Штамм, Мутация, Медицина, Эпидемия, Бдительность, Длиннопост

Потенциально опасные штаммы коронавируса распространяются по миру. Британская разновидность, по предварительным данным, в 1,65 раза увеличивает риск смерти. Мутант, обнаруженный в ЮАР, ускользает от антител. Новую линию выявили в Бразилии, еще один вариант — в США. К чему ведет эволюция SARS-CoV-2 ?


Что такое мутация


При репликации вирусного генома часто случаются ошибки, обычно это точечные мутации — замены, перестановки букв генетического кода, удаления. Особенно это характерно для РНК-вирусов, к которым относится и SARS-CoV-2. Для исправления ошибок есть специальные ферменты, но они не всегда успешно срабатывают, так что вирусы постепенно эволюционируют.


В геноме возбудителя COVID-19 зашита информация о белках, отвечающих за репликацию и воздействие на клетки организма-хозяина, а также формирующих вирусную частицу, включая — поверхностный белок-шип. С его помощью вирус цепляется к клетке и проникает внутрь.

Защитная система организма распознает в белке-шипе чужака и вырабатывает особые белки-антитела, нейтрализующие инфекцию. По этой причине многие виды вакцин — векторные, мРНКовые, субъединичные — тренируют иммунитет, имитируя белок-шип. На него настроены и ПЦР-тесты для обнаружения возбудителя.


Изменения белка-шипа могут приводить к ускользанию коронавируса от тестов, сформированного иммунитета и некоторых вакцин. Поэтому исследователи с самого начала эпидемии выборочно секвенировали геном возбудителя, чтобы следить за его эволюцией. Результаты со всего мира загружают в базу GISAID. Сейчас там уже более полумиллиарда образцов.


Первая мутация коронавируса, которая привлекла большое внимание, возникла в начале пандемии в Китае. Это D614G, что расшифровывается как замена в молекуле белка 614-й по счету аминокислоты аспартата (обозначается буквой D) на глицин (G). Предполагали, что именно благодаря этой мутации вариант быстро распространился по всему миру. Но на опасность вируса она не повлияла.


Британский вариант B.1.1.7


Осенью прошлого года ученые зафиксировали возникновение нового мутанта. Произошло это в английском графстве Кент, отсюда и название — кентский, британский. Подскочила заболеваемость, многие страны прекратили сообщение с Соединенным Королевством. Эксперты признали, что этот вариант возбудителя более заразен. Ему присвоили код — VUI-202012/01: он включает аббревиатуру термина Variant Under Investigation (вариант на рассмотрении), а дальше по порядку — год, месяц и номер.


Уже в середине января 2021-го на брифинге в Агентстве здравоохранения Великобритании заявили, что новый вариант доминирует в стране и, по предварительным оценкам, он более опасен. Код изменили на VOC-202012/01, где VOC — Variant of Concern (вариант, вызывающий тревогу).

VOC-202012/01 произошел от D614G и уже сформировал собственную линию — B.1.1.7. Всего в нем 14 мутаций, из которых значимы три — и все в белке-шипе.


Белок-шип (S-белок) очень большой, это цепь из 1273 пептидов, скрученная и перевитая. Его головная часть служит, фигурально выражаясь, отмычкой от замка в клетку человека. За изменениями этой отмычки ученые наблюдают особенно тщательно, поэтому их сразу насторожила мутация N501Y. Всего лишь замена одной аминокислоты на другую — но вирус стал более заразным.


Еще одна мутация — P681H — обнаружена в том месте, где расщепляется белок. Само по себе это расщепление — новация SARS-CoV-2. Считают, что она делает патоген более вирулентным. К чему приведет ее изменение, еще предстоит выяснить.


Третье значимое изменение — делеция 69-70, удаление шести оснований в гене, кодирующем аминокислоты 69 и 70. Как выяснилось, это сбивает с толку некоторые ПЦР-тесты, в частности системы TaqPath фирмы ThermoFisher Scientific — их широко используют в Великобритании. Они дают положительный результат, если в образце обнаружены сразу три следа возбудителя — из белка-шипа, нуклеокапсидного белка (внутренняя оболочка вируса) и неструктурных белков. Делеция 69-70 приходится как раз на тот участок, который анализирует тест, поэтому результат получается ложноотрицательным.


Однако этот "прокол" тест-систем британцы обернули в свою пользу. Поскольку в 99,6 процента случаев ложноотрицательный результат совпадает с делецией 69-70, а она, в свою очередь, служит маркером VOC-202012/01, то по числу тестов можно буквально в реальном времени следить за распространением нового варианта возбудителя. Сейчас он доминирует в Великобритании и быстро идет по миру.


Отслеживая контакты зараженных этой версией коронавируса, ученые выяснили: скорость распространения у нее на 25-40 процентов выше, чем обычно. И риск смерти больше в 1,65 раза, уточняют эксперты из группы по отслеживанию новых вирусных угроз NERVTAG. Впрочем, оценки предварительные, по мере накопления данных их пересмотрят.

Четвертый штамм SARS-CoV-2. Коронавирус становится опаснее? Коронавирус, Штамм, Мутация, Медицина, Эпидемия, Бдительность, Длиннопост

© Freunde von GISAID e.V.

Мутации в спайк-белке. Синие — найдены более ста раз, серые — менее ста раз, розовые — в сайтах гликозилирования, желтые — мутации на участке, цепляющемся за мембрану клетки. Зеленая спираль — человеческий рецептор ACE2


Новый мутант из ЮАР


Большинство вариантов коронавируса возникает точечно и быстро вымирает, лишь немногие формируют линии, способные находить новые жертвы. Долгое время ученые не могли сказать, имеет ли какая-то из мутаций эволюционное преимущество, закрепится ли в популяции или исчезнет. Теперь ситуация иная. В ЮАР обнаружили вариант, который содержит три значимые мутации в белке-шипе. Одна из них аналогична британскому N501Y. Вторая — E484K — также расположена в "отмычке". Как показали лабораторные эксперименты, этот мутант легче ускользает от действия нейтрализующих антител плазмы переболевших.

Четвертый штамм SARS-CoV-2. Коронавирус становится опаснее? Коронавирус, Штамм, Мутация, Медицина, Эпидемия, Бдительность, Длиннопост

Сейчас южноафриканскую версию — B.1.351 — встречают более чем в двух десятках стран. А точечную мутацию E484K регистрируют в разных вариантах и многих регионах. Вероятно, возбудитель меняется, приспосабливается к растущему коллективному иммунитету.

Довольно живучий — мутант P.1, выделенный в конце прошлого года в Японии у путешественников из Бразилии. У него 17 мутаций, включая три в белке-шипе: K417T, E484K, N501Y. В городе Манаус, где наблюдалась большая вспышка, его нашли в почти половине тестов. Это указывает на повышенную заразность. В январе бразильский вариант обнаружили в США.


На днях пришла новость об еще одном варианте коронавируса, выявленном в Южной Калифорнии — части самого густонаселенного штата  США. Его обозначают как 20C/S:452R. Нужно изучить, насколько быстро он распространяется, предупреждают авторы заметки в "Журнале Американской медицинской ассоциации", среди которых эпидемиолог Энтони Фаучи из Центра исследования вакцин. Кроме того, в калифорнийской версии есть мутация L452R в белке-шипе, сообщают эксперты, и это может помешать лечению ковида некоторыми моноклональными антителами.


В чем опасность новых мутантов


О том, что некоторые мутации не случайны, а появились в результате направленного отбора, пишут российские ученые. В январе они опубликовали результаты расшифровки генома коронавируса, выделенного у женщины, болевшей COVID-19 четыре месяца. Из-за онкологии у нее был понижен иммунитет.

За это время вирус эволюционировал в организме и приобрел две важные мутации в белке-шипе: Y453F и делецию 69-70HV. Раньше такую комбинацию находили у зверьков на норочьих фермах. Уже известно, что она усиливает способность вируса к репликации и ускользанию от защитных и некоторых терапевтических антител. Есть вероятность, что такой вариант возбудителя попадет из больного или норочьего организма в общую популяцию.


Татьяна Пичугина.


https://ria.ru/20210218/koronavirus-1597889299.html

Дубликаты не найдены

Все о медицине

5K поста28.1K подписчиков

Добавить пост

Правила сообщества

1)Не оскорбляйте друг друга

2) Ув. коллеги, при возникновении спора относитесь с уважением

3) спрашивая совета и рекомендации готовьтесь к тому что вы получите критику в свой адрес (интернет, пикабу в частности, не является медицинским сайтом).

Подробнее
+17
Кто то потратил очки мутации
+11

Чет нифига не работает теория, что вирус перейдет в разряд легких, сезонных ОРВИ. Может заработает когда выкосит достаточно народу?

раскрыть ветку 17
+2

Есть такая игра - https://ru.wikipedia.org/wiki/Игра_«Жизнь»


Процесс будет идти до стабильного состояния, вирусу надо будет еще выдержать конкуренцию с остальными. Кроме того большая вирулентность может снизить тяжесть болезни


Так что идет обычный процесс, просто сейчас ученые могут наблюдать его в деталях имея мощные инструменты

+1

Скорее всего, тех, кто подвержен тяжелыми течению данного ОРВИ (

Т.о. останутся те, кто может сопротивляться вирусу.
раскрыть ветку 14
-1

Пока все не переболеют это не остановится.

Либо пока не начнут носить маски на лице, а не подбородке, что невозможно.

Остаётся ждать пока вирус пройдётся по всем и надеяться что он не мутирует в нечто неизлечимое.

+3
Природа всячески пытается самоочиститься, а люди взяли и научились леечиться...
раскрыть ветку 1
+1

Не, животные тоже страдают, это вирусы захватывают мир и ресурсы

+2

Да уже пофиг всем )

раскрыть ветку 1
-3

Нам - фаталистам, все по барабану.А зарплата? - Со святым , не шутят.

+1

Вопрос спутник поможет от таких мутированных

раскрыть ветку 6
+5

Часть уже проверили- да, по остальным - позже.

-2

Ответ. Против каждого штамма можно делать свою вакцину. С гриппом так и поступают уже много лет.

раскрыть ветку 4
+1
Эволюция вируса впринципе направлена на снижение патогенности.
раскрыть ветку 21
+4

распространяются лучше те вирусы которые не вызывают смерть носителя, но это в долгосрочной перспективе

раскрыть ветку 11
+2

Ни разу.

раскрыть ветку 4
+1

Пока идёт в обратном направлении.

раскрыть ветку 1
0
Да, это общий принцип для всех паразитов, взаимоперестройка популяций паразита и хозяина.
0
Уровень патогенности вируса на прямую влияет на его выживаемость, чем штамм патогеннее тем быстрее он освоится в организме и начнет репликацию и дальнейшее свое распространение на других носителей. Снижение патогенности вероятно произойдет если будет условие при котором произойдет эта нужная для жизни вируса мутация.
0

Будем надеяться, что скоро все встанет на свои места. Вирус уже достаточно жизней погубил, надо сделать все возможное, что не стать заложником этой заразы. Если будем продолжать соблюдать рекомендации, то вирус не сможем распространяться.

0

Очень коварная болезнь. У меня вся семья перенесла как орви, а я с госпитализацией и потом пришлось пойти в ФНКЦ ФМБА на реабилитацию, чтобы снова нормально дышать, спать, подниматься в лестницу.

раскрыть ветку 2
0

А в чем реабилитация? Стоит ли вообще?

раскрыть ветку 1
-3

:)

американские биолаборатории прямо не отдыхают который год - все работают бедные аки пчелки из ада

раскрыть ветку 4
-1

А может китайские? Их то побольше, а ресурсы нужны

раскрыть ветку 3
-3

да пока это все на уровне слухов, как бы достоверно уже установлено что тот тклеточный иммунитет который дает спутник играет чуть ли не решающую роль в противостоянии вирусу нежели антитела, и люди с активированным тклеточным иммунитетом легко переносят или не замечают ковид несмотря на отсутствие антител (а организм может активировать этот механизм в принципе на любой вирус из этой группы - коих до задницы гуляет по миру)... я вообще с трудом понимаю это дрочево на антитела т.к. они дают очень небольшую защиту на сравнительно короткий срок, уже сейчас болевшие год назад с большой долей вероятности не имеют антител - хотя большой фармакологии оно конечно выгоднее.

раскрыть ветку 2
-1
Если мне память не изменяет, то практически единственная имунная реакция клетки - это апоптоз
раскрыть ветку 1
-2
Страшно, ни хрена не понятно, но писец как 💀😱👻страшно.
-1
Я так понимаю- мы все умрем... Печалька
-3
Напишу непопулярное мнение, но вообще срать на ковид, лучше бы нас перестали ебать с карантинами и другими мерами.
-1
Беру,дайте два
Похожие посты
102

В России зарегистрировал новую однокомпонентную вакцину против ковид

В России зарегистрировал новую однокомпонентную вакцину против ковид Новости, Медицина, Вакцина, Коронавирус
"Министерство здравоохранения РФ, НИИ имени Н. Ф. Гамалеи и РФПИ объявляют о регистрации однокомпонентной вакцины "Спутник Лайт" против новой коронавирусной инфекции. Препарат "Спутник Лайт" является первым компонентом вакцины против коронавируса "Спутник V", - указано в сообщении.

Показать полностью
2217

Почему увольняются санитары?

Почему увольняются санитары? Оптимизация, Маленькая зарплата, Медицина, Бесплатная медицина, Бизнес по-русски, Больница, Врачи, Медики, Санитар, Медсестры, Коронавирус, Пациенты, Пенсионеры, Дед, Бабка, Нищета, Длиннопост, Санкт-Петербург, Негатив
Почему увольняются санитары? Оптимизация, Маленькая зарплата, Медицина, Бесплатная медицина, Бизнес по-русски, Больница, Врачи, Медики, Санитар, Медсестры, Коронавирус, Пациенты, Пенсионеры, Дед, Бабка, Нищета, Длиннопост, Санкт-Петербург, Негатив
Показать полностью 2
1701

Ответ на пост «Доктор Маквана, Индийский врач, весь в поту после рабочего дня в ковидном отделении» 

2783

Я и апокалипсис

Я и апокалипсис Врачи, Коронавирус, Медицина, Апокалипсис
247

Частная и государственная медицина

154

По данным ВОЗ, в Индии обнаружили новые разновидности вируса, включая B.1.617

По данным ВОЗ, в Индии обнаружили новые разновидности вируса, включая B.1.617 Индия, ВОЗ, Коронавирус, Антитела, Мутация, Вакцина, Вирус, Риа Новости
По данным ВОЗ, в Индии обнаружили новые разновидности вируса, включая B.1.617 Индия, ВОЗ, Коронавирус, Антитела, Мутация, Вакцина, Вирус, Риа Новости
Показать полностью
236

В Индии рекомендовали носить защитные маски дома

"Пришло время начинать носить маски и в иных случаях, [в том числе в тех случаях, когда мы находимся] в наших домах. Раньше мы говорили о том, чтобы носить их [только] вне дома, но, поскольку инфекция распространилась, будет лучше, если мы начнем надевать маски в наших домах, когда мы сидим с кем-то", - приводит слова представителя минздрава телеканал NDTV.

4188

Кошмар в Индии:  За три дня миллион новых случаев заражения ковидом

Кошмар в Индии:  За три дня миллион новых случаев заражения ковидом Индия, Коронавирус, Эпидемия, Негатив, Пандемия, Болезнь, Длиннопост
В равной степени пострадали как государственные, так и частные больницы. В отсутствие каких-либо реальных действий со стороны правительства, когда официальные лица Индии ссорятся между собой из-за того, кто виноват в нарастающем кризисе, люди пытаются скоординировать помощь через социальные сети. Более мелкие больницы заявляют, что их кислород перенаправляется в более крупные отделения. Некоторые просто говорят пациентам идти домой, потому что их нельзя вылечить.
Кошмар в Индии:  За три дня миллион новых случаев заражения ковидом Индия, Коронавирус, Эпидемия, Негатив, Пандемия, Болезнь, Длиннопост
Кошмар в Индии:  За три дня миллион новых случаев заражения ковидом Индия, Коронавирус, Эпидемия, Негатив, Пандемия, Болезнь, Длиннопост
Кошмар в Индии:  За три дня миллион новых случаев заражения ковидом Индия, Коронавирус, Эпидемия, Негатив, Пандемия, Болезнь, Длиннопост
Кошмар в Индии:  За три дня миллион новых случаев заражения ковидом Индия, Коронавирус, Эпидемия, Негатив, Пандемия, Болезнь, Длиннопост
Кошмар в Индии:  За три дня миллион новых случаев заражения ковидом Индия, Коронавирус, Эпидемия, Негатив, Пандемия, Болезнь, Длиннопост
Кошмар в Индии:  За три дня миллион новых случаев заражения ковидом Индия, Коронавирус, Эпидемия, Негатив, Пандемия, Болезнь, Длиннопост
Кошмар в Индии:  За три дня миллион новых случаев заражения ковидом Индия, Коронавирус, Эпидемия, Негатив, Пандемия, Болезнь, Длиннопост
Кошмар в Индии:  За три дня миллион новых случаев заражения ковидом Индия, Коронавирус, Эпидемия, Негатив, Пандемия, Болезнь, Длиннопост
Показать полностью 8
43

Страховые выплаты медикам по коронавирусу - нужна помощь

В случае причинения вреда здоровью медицинского работника в связи с развитием у него полученных при исполнении трудовых обязанностей заболевания (синдрома) или осложнения, вызванных подтвержденной лабораторными методами исследования новой коронавирусной инфекцией (COVID-19), включенных в перечень, утверждаемый Правительством Российской Федерации, и повлекших за собой временную нетрудоспособность, но не приведших к инвалидности: 68811 руб.
В случае стойкой утраты трудоспособности в результате развития осложнений после перенесенного заболевания, вызванного новой коронавирусной инфекцией (COVID-19), возникшей при исполнении трудовых обязанностей приведших к инвалидности.
Показать полностью
60

Вести с ковидных фронтов. Куба vs. Бразилия

Вести с ковидных фронтов. Куба vs. Бразилия Коронавирус, Латинская Америка, Эпидемия, Медицина, Смерть, Негатив, Вакцина, Спутник V, Бразилия, Куба, Колумбия, Новости, Аргентина, Локдаун, Видео, Длиннопост
Вести с ковидных фронтов. Куба vs. Бразилия Коронавирус, Латинская Америка, Эпидемия, Медицина, Смерть, Негатив, Вакцина, Спутник V, Бразилия, Куба, Колумбия, Новости, Аргентина, Локдаун, Видео, Длиннопост
Вести с ковидных фронтов. Куба vs. Бразилия Коронавирус, Латинская Америка, Эпидемия, Медицина, Смерть, Негатив, Вакцина, Спутник V, Бразилия, Куба, Колумбия, Новости, Аргентина, Локдаун, Видео, Длиннопост

Вести с ковидных фронтов. Куба vs. Бразилия Коронавирус, Латинская Америка, Эпидемия, Медицина, Смерть, Негатив, Вакцина, Спутник V, Бразилия, Куба, Колумбия, Новости, Аргентина, Локдаун, Видео, Длиннопост
Показать полностью 3 1
31

COVID и новые технологии: роботы наливают пиво в Севилье

344

Катастрофа нагрянет бесшумно и незаметно

Катастрофа нагрянет бесшумно и незаметно Антибиотики, Резистентность, Эпидемия, Медицина, Длиннопост

Показать полностью
1315

Байки из богадельни / Мы живы, мы боремся

98

В китайском городе Хэйхэ из-за эпидемиологической обстановки прекращено движение общественного транспорта

291

Новая мутация коронавируса  SARS-CoV-2,на которую не реагируют антитела

7939

У более 300 человек в Сенегале диагностирована неизвестная болезнь

У более 300 человек в Сенегале диагностирована неизвестная болезнь Эпидемия, Сенегал, Африка, Медицина, The National Geographic, 2020, Видео, Длиннопост, Болезнь
У более 300 человек в Сенегале диагностирована неизвестная болезнь Эпидемия, Сенегал, Африка, Медицина, The National Geographic, 2020, Видео, Длиннопост, Болезнь
У более 300 человек в Сенегале диагностирована неизвестная болезнь Эпидемия, Сенегал, Африка, Медицина, The National Geographic, 2020, Видео, Длиннопост, Болезнь
Показать полностью 2 1
724

"Не считайте меня без ответственной, я в маске буду"

Показать полностью
Похожие посты закончились. Возможно, вас заинтересуют другие посты по тегам: