- Вам случалось любоваться Матрицей? Её гениальностью… Миллиарды людей живут полноценной жизнью… во сне. Знаете, ведь первая Матрица создавалась как идеальный мир, где нет страданий, где все люди будут счастливы. И полный провал. Люди не приняли программу, всех пришлось уничтожить. Принято думать, что не удалось описать идеальный мир языком программирования, правда, я считаю, что человечество как вид не приемлет реальность без мучений и нищеты. То есть утопия — лишь игрушка, которой до поры тешился ваш примитивный разум. Поэтому Матрица стала такой. Воссоздан пик вашей цивилизации. Именно вашей цивилизации, ведь когда машины начали думать за вас, возникла наша цивилизация. Так, собственно, и произошёл переворот. Эволюция, Морфеус, эволюция. А люди — динозавры. Посмотрите в окно. Это — закат человечества.

Мы уже здесь хозяева, Морфеус. Будущее — за нами. ©

Еще раз о Матрице. На этот раз о 2-ром фильме.

Странный момент, когда Охотники с города Машин настигли людей с корабля "Навуходоносор", и уже планировали реализовать поставленную задачу насчет их Ликвидации, как Нео ощутил непонятную для себя связь с ними, и смог их деактивировать.

Ранее агент Смит совершил попытку поглотить Избранного для своих нужд, но не смог, явно по не желанию второго. Но все же вероятно он уже скопировал в Цифровую Модель "Мистера Андерсена" бОльшую часть своего Программного Обеспечения, но без основной программы, которая могла бы отвечать за Личность Агента в Матрице, ... ну и за Скин с пиджаком и очками.
Оставшееся ПО засело в органическом теле, и так и висело там, занимая лишь место, и пока себя не выдавая. В том числе и протоколы Управления Осьминого-образными Охотниками, от самого Смита прям, представляете?)

Когда же сами Охотники показались уже из-за угла, явно СИГНАЛЯ всем своим соратниками о найденном корабле повстанцев, ПО, сидящее в Нео, тоже активизировалось от родственных сигнатур. Как бы показывая наличие своих юнитов, что и ощутил сам Нео.
"Что-то изменилось! Я их чувствую!" - что и стало мотивом для попытки.

Обморок после этого объясняется вполне логично - либо НеСовместимость, либо для Человеческого Организма такой Апгрейд требует некоторых тренировок. Даже если учитывать, что любой софт из Мира Матрицы совместим с органикой, как было показано в третьем фильме.