В 1900 г. у Mauser C-96 появились серьезные конкуренты — пистолет Георга Люггера "Парабеллум" и пистолет Браунинга. На их фоне отчетливо проступили недостатки С-96: большие размеры, неудобство заряжания, сложность изготовления и сборки-разборки, чувствительность к загрязнению. В итоге в самой Германии Маузер был принят лишь на частичное вооружение конных егерей в 1908 г., и то из-за нехватки парабеллумов. При этом потребовалось изменить калибр С-96 до 9 мм, как у штатного патрона 9×19 Парабеллум. Такие пистолеты были помечены красной цифрой 9 на рукоятке, поскольку при стрельбе 9-мм патроном из Маузера калибра 7,63 мм происходил разрыв ствола. Еще 6000 штук Маузеров были изготовлены для итальянского флота и некоторое количество для лейб-гвардии турецкого султана.
Пистолет-карабин Маузера приобрел желанную популярность среди участников африканских и восточных экспедиций. Известно, что именно с Mauser С-96 начинал свою карьеру У. Черчилль.
Во время Суданской кампании, во время битвы при Омдурмане в сентябре 1898 г. дозор 21-го Гусарского полка во главе с 25-летним лейтенантом Черчиллем был окружен значительно превосходящими отряд силами противника. Схватка продемонстрировала несомненное преимущество полуавтоматического огнестрельного оружия перед мечами и копьями.
В России первые Маузеры под названием Маузер № 2 или "Маузер в колодке" появились в 1897 г. и входили в число рекомендованного для приобретения офицерами личного оружия. Маузером № 1 назвали карманную 6,35-мм модель 1910 г.
В 1913 г. Воздухоплавательная часть Главного управления Генерального штаба определила С-96 как принадлежность аэропланов. Также Маузерами укомплектовывались автомобильные и мотоциклетные части. Через несколько лет товарищ Маузер стал одним из самым популярных пистолетов в России.
В 1922-1930 гг. для РККА и ВЧК-ОГПУ было закуплено большое количество 7,63-мм Маузеров, т. н. полицейская модель. На Западе эти пистолеты получили название Боло-маузер - большевистский маузер. На тот момент Германия была вынуждена подчиняться условиям Версальского договора, в соответствии с которыми пистолет имел длину ствола 98 мм при общей длине 255 мм.
С-96 активно использовали и бандиты. В Москве именно с Маузером в руках уголовник Корольков ограбил вождя мирового пролетариата В. И. Ленина. Известен и питерский любитель Маузера - знаменитый Ленька Пантелеев.
Наградные Маузеры С-96 с орденом Красного Знамени на рукоятке получили в свое время Главком Вооруженных сил РСФСР С. Каменев и Командующий Первой Конной армией С. Буденный.
В Гражданскую войну в основном применялись 7,63-мм пистолеты образца 1912 года. Наградные "Маузеры" с орденом Красного Знамени на рукоятке, именовавшиеся "Почетным революционным оружием" (высшей наградой Советской России), получили советский главком Сергей Каменев и командарм Первой Конной Семен Буденный. В 1943-м наградной "Маузер" получил Леонид Брежнев.
"Первый красный офицер" Клим Ворошилов назвал в честь полюбившегося пистолета даже своего коня. Герой Советского Союза, легендарный пограничник, сержант Никита Карацупа, лично уничтоживший 129 диверсантов и задержавший 338 нарушителей границы, также был вооружен "Маузером". Не с чем-нибудь, а с надежным "Маузером" отправился на ледовую зимовку знаменитый полярник Иван Папанин.
Широко использовали "Маузеры" и противники Советской власти, и даже уголовники. С "Маузером" воевал знаменитый командир дроздовцев белый генерал Антон Туркул.
Иностранная помощь белым частям обернулась тем, что маузеры попали в Среднюю Азию к басмачам. В Армении противников Советской власти в начале 1920х годов даже называли "маузеристами", а в Туркестане "Маузеры" обрели популярность среди басмачей.
Петр Ермаков утверждал, что в июле 1918 года именно он из "Маузера" застрелил бывшего императора Николая II. В 1927 году Ермаков сдал "Маузер" в музей в Свердловске (ныне - Екатеринбург). Однако право считаться ликвидатором Николая II оспаривал Яков Юровский, который в 1927 году также сдал свое оружие в московский Музей революции.
Юровский заявил, что пользовался сразу двумя пистолетами - "Кольтом" и укороченным "Маузером". Современные исследователи полагают, что при расстреле использовался только один "Маузер" (всего найдены три пули этой системы), который был у Юровского, а Ермаков стрелял из обычного "Нагана".