Ученым удалось прочесть геном денисовца из зуба возрастом 200 000 лет⁠⁠

Раскопки в Денисовой пещере продолжаются, и в этом году преподнесли новую находку - еще один зуб, хозяин которого получил имя "Denisova-25". Сохранился зуб отлично, так что из него не просто извлекли фрагменты ДНК, а получили высококачественный геном. Хозяином зуба оказался денисовский мужчина - и тут подробности семейных драм палеолита выплыли наружу: предки мужчины активно заводили семьи с неандертальцами.

Предыдущий рекорд по древности высококачественного генома принадлежал неандерталке, жившей около 120 000 лет назад. Кстати, это была женщина из той же самой Денисовой пещеры, а продержалась она на пьедестале 11 лет — ее геном извлекли в 2013 году. Тогда оказалось, что ее родители были близкими родственниками на уровне сводных братьев и сестер, и что такие браки в ее роду не были редкостью. Что касается денисовцев, на сегодняшний день известно семь особей, у которых удалось извлечь фрагменты ядерной и митохондриальной ДНК, а также полный геном девочки, жившей 60-80 000 лет назад, с которой и началась история этого загадочного вида людей.

Зуб Denisova-25 нашёл археолог Максим Козликин в одном из нижних слоев, которому около 200 000 лет. Ученые отправили находку в Институт Макса Планка, где генетики смогли добиться 24-кратного покрытия генома (то есть каждый нуклеотид из цепочки ДНК был прочтен в среднем 24 раза). Это исключительная точность для такой старой ДНК — ведь для восстановления генома достаточно 12-кратного покрытия. Открытие представил Стефан Пейрень (Stephane Peyregne), команда которого работала над секвенированием. Кроме того, учёные сравнили новую последовательность ДНК с образцами неандертальцев, других денисовцев и современных людей.

Сравнение показало, что Денисова пещера была довольно оживлённым местом. Мужчина-денисовец Denisova-25, живший около 200 000 лет назад, происходил из ранней популяции своего вида, которая активно скрещивалась с неандертальцами. Генетически два этих вида разошлись около 400 000 лет назад, что подтверждает и эта ДНК — у генома Denisova-25 300 000 генетических изменений, которые отличают его от неандертальцев. Около 5% генома Denisova-25 принадлежали ранее неизвестной популяции неандертальцев.

Что дало сравнение с другими денисовцами? Ближе всего Denisova-25 оказался к женщине Denisova-3 возрастом 64 000 лет, геном которой с 30-кратным покрытием расшифровали в 2012 году. Кстати, и у того, и у другого индивида присутствует архаическая примесь неясного происхождения - возможно, следы смешения с какими-то припозднившимися Homo erectus.

Но есть и существенные отличия: денисовские последовательности, найденные у современных людей, больше похожи на Denisova-3, чем на Denisova-25. Вероятно, обнаруженный мужчина принадлежал к другой популяции денисовцев. Видимо, денисовцы заселяли Алтай дважды. Самые древние ДНК из отложений в пещере указывают на то, что первые поселенцы появились здесь около 300 000 лет назад и обладатель древнего зуба принадлежал к этой волне, а вторая, в том числе предки Denisova-3, обосновалась в пещере чуть более 60 000 лет назад.

Между этими волнами Денисову пещеру населяли неандертальцы, но и с приходом поздних денисовцев они никуда не делись — так, ДНК из фрагмента кости женщины возрастом более 50 000 лет показывает, что ее мать была неандертальцем, а ее отец денисовец. Кстати, часть ее кости на фото:

Как предполагает Пейрень, это связано с тем, что на Алтае проходили географические границы ареалов обеих групп.

Обо всём этом исследователи рассказали на пресс-конференции в Пуэрто-Вальярте (Мексика). Пока что нет даже фотографии найденного зуба! С нетерпением ждем публикацию с подробностями.

P.S. Нравятся наши посты? Поддержите работу наших авторов любым донатом тут, на Пикабу:)