В комиксах сам Флэш говорил, почему чаще всего двигается на дозвуковой скорости. Объясняет он это тем, что не хочет навредить людям вокруг. Правда в New 52 это пофиксили и теперь он просто боится сломать спидфорс.
По мне, так идеальным оправданием было бы что-то вроде "может ускоряться только 5 секунд, а затем вынужден отдыхать пару минут". Т.е. ограничение такое по умолчанию. Но ведь этого нет, он просто тупит.