А почему на Пикабу тег для кошек называется "кот"? Ведь кот — это конкретно самец, а не все кошки. Правильнее было бы "кошка". Туда же "коты и собаки вместе".

Почему названия многих животных в русском языке совпадают именно с названием самки этого животного?

Особенно домашние животные: кошка, собака, корова, коза, свинья, овца, курица... Конечно, не все, есть осел, например)