В/НА автобусе

Хотел ехать автобусом, У автобуса двери закрылись и я опоздал НА автобус.
И вот бегу я ЗА автобусом, а ИЗ автобуса выглядывает кондукторша. Ну и хорошо, что я не сел В этот автобус, денег то нет совсем.

Посему, когда мы говорим "поехать НА автобусе", мы имеем ввиду на самом объекте, точно так же, как "посидеть НА скамейке".
А когда говорим "еду В автобусе, В автобусе тепло", мы имеем ввиду уже сам салон, В котором можно расположиться "НА скамейке".