Недооценивай Мощь Тёмной Стороны Люк!
Прилетевший на Корусант в 10 ПБЯ, Скайуокер стал находить странные ключи в потайных комнатах бывшего Императорского дворца, ключи к могуществу Императора. Но до того как он смог соединить все кусочки тайны воедино, на Корусант напал имперский флот. Люк сражался на поверхности, когда в небе над столицей разразился мощнейший Шторм Силы, и он вместе с R2 был перемещён на корабль-тюрьму, где во время Войн клонов перевозили пленных джедаев. Как только пленник оказался на борту, корабль направился в Ядро галактики, на планету Бисс. И в цитадели Бисса Люк увидел врага, которого ожидал увидеть меньше всего — Императора Палпатина.
Дух Палпатина избежал смерти, применив тайные знания ситов и технологии клонирующих цилиндров Спаарти. Палпатин вырастил множество копий своего тела и переселялся в них, как только тёмная энергия окончательно разрушала предыдущую оболочку. Так Палпатин избежал смерти на борту второй «Звезды Смерти» и теперь желал сделать Скайуокера своим слугой.
Люк, осознававший, что Император практически непобедим, пал на колени перед ним и согласился примкнуть к тёмной стороне со словами: «Судьба моего отца — моя судьба». Как и многие другие джедаи, он наивно верил, что сможет уничтожить тёмную сторону изнутри, познав её секреты. Люк пренебрёг главным наставлением мастера Йоды — недооценил мощь тёмной стороны. Скайуокер работал на благо светлой стороны, пребывая в тени, как Квинлан Вос во времена Войн Клонов. И так же как этот мастер он, в конце концов, осознал, что не может выбраться из этой ловушки: он слишком глубоко увяз в сетях Тёмной стороны. В попытке восстать против нового наставника Люк Скайуокер проник в лабораторию клонов и стал уничтожать копии Императора. Но прежде чем он успел завершить уничтожение, дух Императора вселился в последнюю оставшуюся копию своего тела и сразился со Скайуокером на световых мечах. Мастерства Люка было недостаточно, чтобы нанести поражение клону, и первая дуэль осталась за Палпатином.
Скайуокер хоть и сорвал несколько планов Императора, среди которых была атака Опустошителей миров на Мон-Каламари, но слишком глубоко погрузился в тёмную сторону, чтобы мыслить ясно. Однако с помощью сестры Леи Люк смог нанести удар по тёмной стороне, прежде чем та полностью его поглотила, и обратить её против нового учителя. Люк Скайуокер снова сразился с Палпатином и одержал победу.