Делаем загрузочную флешку (или HDD) с большим набором возможностей. Можно выбрать только то, что необходимо⁠⁠

Зачем фат32, чем вам нтфс не угодил? Зачем утилиты все эти ненужные ? В консоли
diskpart
list disk
select disk №
clean
create partition primary
list part
select part №
format NTFS QUICK
active
assign
exit

потом просто копируешь туда вендодиск (ну или реаниматор).
Если в чем то не прав, поправьте, но я diskpart проще. Подходит само собой только для венд, с линуксами иначе.

Вставлю свои 5 копеек. Недавно занимался тем же самым вопросом.

В итоге, пришел к выводу, что лучше всего использовать для данных целей easy2boot (http://www.easy2boot.com/). Он, возможно, не настолько прост, как Ваш способ. НО. Утилита довольно гибкая, для добавления своих лайвов достаточно закинуть iso-образы по нужным папкам. Умеет в установку как старых, так и новых windows (через использование imgPTN). Вроде бы также поддерживает преконфигурированную установку.

Умеет в принципе и в дос-версии, юзаю активно оттуда, скажем, Викторию.

А что касается лайвов WinPE с тулзами для админки, не нашел ничего лучше, чем Multiboot 2k10, там самый полный набор софта ИМХО. Ставится отдельно, без easy2boot. Но если чуть подумать и осознать механизмы работы загрузчиков, можно ручками поправить меню и получить хороший такой блендер. Вот ссылка на 2к10: http://rutracker.org/forum/viewtopic.php?t=4802247