Однажды Путин пообещал... — хорошее начало для анекдота.⁠⁠

Пол миллиона предпринимателей это пара районов в большом городе

Пол миллиона предпринимателей - это не тоже самое, что и полмиллиона человек. 
На тот момент во всей России было около 4 млн. предпринимателей. А из-за "гениального" налогового маневра ушло 500 тысяч, т.е 12,5%. Поэтому статистически это просто огромный процент. 

просто в момент написания предложения вспомнился один персонаж.

Вы разве не помните, как совсем недавно - в 2013 году было увеличением налоговой нагрузки на ИП (фед. закон № 237–ФЗ от 23 июля 2013 года) - полмиллиона предпринимателей ушли с рынка. Какие основания считать, что здесь результат будет иным ? 
В России малый бизнес заподдерживали напрочь уже, его доля и так вряд ли превышает 20% в ввп, спасти бюджет за счёт повышения нагрузки на него — утопия, уйдут в тень, или с рынка, поступления, как всегда, сократятся.

двоих. У одного 3 супермаркета ( от 80 до 150 квадратов ).
У другого 1 магазин, сколько квадратов в нем не знаю, но думаю больше 40.
А что, это имеет какое-то значение ?

Процитирую: "Например, базовая доходность самого популярного вида деятельности на ЕНВД — розничной торговли — составляет 1800 руб. с 1 кв. м в месяц. Если предприниматель ведет бизнес в помещении площадью 50 кв. м, то налоговая база по ЕНВД для него составит 1,08 млн руб. в год. С учетом действующего коэффициента–дефлятора — 1,94 млн руб., с учетом нового — 2,25 млн руб. С этой суммы предприниматель будет обязан заплатить 15%. Если подсчитать, то получится, что размер налога увеличится на 46,5 тыс. руб."