Новый метод Секвенирования ДНК-Будущее в оценке качества питьевой и сточных вод.⁠⁠

Данный пост адресован моему единственному подписчику и тем кому интересна информация по очистке воды.

Будет интерес готов помогать в решении существующих проблем по водоподготовке и очистке воды, Знакомить своих подписчиков с новыми международными методами и научными изысканиями.

В Висконсине разработан метод секвенирования ДНК, который можно использовать для анализа питьевой воды и сточных вод.

Секвенирование ДНК - это определение аминокислотной или нуклеотидной последовательности.

Разработанный метод секвенирования ДНК, может идентифицировать и посчитать почти все микроорганизмы в пробе воды, в то время как стандартный микробиологический посев или метод ПЦР дают ограниченую информацию.

Образец воды отправляют в лабораторию Microbe Detectives, где секвенирование ДНК осуществляется путем экстракции, амплификации ПЦР, подготовки библиотеки и анализа данных. Затем извлекается ДНК и помещается в машину под названием секвенсор.

Секвенсор читает каждую отдельную нить ДНК и дает комбинацию букв. Эти последовательности затем отсылаются в базу данных, для определения микроорганизма.

После того, как все эти данные были собраны, создается отчет с указанием того, какие микроорганизмы существуют и какая их общая численности в пробе.

Так секвенирование ДНК может быть использован для идентификации и количественного определения (например, нитрификаторов, для удаления аммиака и бактерий для удаления фосфора). Данный метод также может выявлять кишечную палочку.

Проблема в распространении этого метода состоит в том, что большинство сотрудников на предприятиях привыкли работать по уже давно сформированным методикам и боятся пробовать новые методы.

Так в Новом Орлеане во время ежегодной технической выставки и конференции по водной среде при применении данного метода было обнаружено обилие фекально-ассоциированных бактерий и идентифицирован один штамм Prevotella, который был в очень малом количестве. Сравнивая результаты компания пришла к выводу, что заражение питьевой воды, связано с попаданием в источник конского навоза.

Оригинал текста статьи https://www.wateronline.com/doc/dna-sequencing-the-future-of...