Новая методика моделирования FightAIDS @ Home Team опубликована в отраслевом журнале22 апреля 2019 г.
Новая методика моделирования FightAIDS @ Home Team опубликована в отраслевом журнале
22 апреля 2019 г.
Резюме
Команда FightAIDS @ Home - Phase 2 объединилась с World Community Grid для изучения и уточнения результатов этапа 1 проекта. За последние 18 месяцев они создали новую технику, называемую асинхронный обмен репликами, которая значительно повышает эффективность их вычислений и может иметь значение для других исследователей, которые используют то же программное обеспечение для обнаружения лекарств. Результаты этой работы были недавно опубликованы в журнале химической информации и моделирования.
Компьютерные эксперименты по открытию лекарств требуют точного и очень подробного моделирования молекулярных взаимодействий. К сожалению, традиционные вычислительные ресурсы, даже высокопроизводительные компьютерные кластеры, такие как World Community Grid, часто не могут обеспечить уровень детализации этих сложных взаимодействий, чтобы сделать их настолько точными, насколько это необходимо ученым для дальнейшей работы. Точно так же вычислительные ресурсы World Community Grid огромны, но его базовый дизайн не идеально подходил для конкретных методов молекулярного моделирования, которые использовали ученые FightAIDS @ Home.
На протяжении более 18 месяцев исследовательская группа тесно сотрудничала с разработчиками World Community Grid Кейтом Аплингером и Джонатаном Армстронгом для создания и тестирования асинхронного обмена репликами, нового протокола выборки, который обеспечивает очень тонкую динамическую молекулярную симуляцию. Асинхронный обмен репликами, который подробно описан в статье, недавно опубликованной исследовательской группой, может иметь значение для будущей работы по обнаружению антибиотиков для ученых, которые используют то же программное обеспечение для компьютерного моделирования.
Вы можете прочитать реферат статьи здесь. Спасибо всем, кто жертвует компьютерным временем на поддержку FightAIDS @ Home.
https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jcim.8b00817
https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jcim.8b00817
https://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle....
