ну вопще этот флаг не только конфедерацкий, хочю скозать, што и в росийской империи и в ссср он имел место с небольшими доработками. а вообще о возникновении конкретно флага новороссии тебе расскажут вот тута :
http://k2-3300.livejournal.com/54388.html?thread=86900
http://k2-3300.livejournal.com/54388.html?thread=86900