Чтобы швы герметика были ровными и он к рукам не прилипал, нужно после нанесения обильно побрызгать "мистер мускулом" для стекол. И можно пальцами снять лишнее и выровнять шов. Ну и малярный скотч, если необходимо ограничить область нанесения герметика. Обычный прозрачный силикон на самом деле матовый и тускнеет. Есть клей для стекол кристально прозрачный. С ним работать сложнее, он более густой и красиво сделать равномерный шов сложнее, но сохнет быстро и действительно прозрачный. По поводу стекла. Есть например стекло бесцветное или осветленное или оптически прозрачное или без примесей металла, как то так, у каждой фабрики свое название. Оно в отличие от обычного, не имеет зеленого оттенка и выглядит очень красиво. Можно сделать триплекс или закаленное стекло, оно гораздо прочнее сырого, хотя не знаю, может его не применят для аквариумов.
З.Ы. я в этом ни чего не шарю но интересно