С этой башней связано как минимум два эпизода, которые народ счёл чудом. Первый случился во время нашествия Наполеона в 1812 году. Засев в Кремле, французский император для начала укрепил именно Никольскую башню для обороны, которая не понадобилась.
Никольская башня является также, как, например, и Спасская проездной. Над воротами по традиции размещали надвратную икону. Никольская башня имела икону Николая Чудотворца, он же Никола Можайский, он же Никола-с-градом. В правой руке Николай держит меч, в левой город Можайск, который он взялся защищать, когда к нему подошел враг.
Покидая московский Кремль, французы взорвали здание Арсенала, отчего половина Никольской башни, находившаяся неподалеку, обвалилась, однако уцелела икона и даже в фонаре не погасла лампада, что свидетели расценили как чудо и несомненное вмешательство самого Николая Чудотворца.
Второй эпизод случился во время празднования 1 мая в 1918 году. Дабы не смущать колонны трудящихся, шествующих мимо, икону задрапировали красной тканью. Однако в самый разгар праздничной демонстрации кумач пал. Здесь версии очевидцев разнятся. По одной версии ткань сдернул порыв ветра. По другой кумач опал сам, будто бы разрезанный мечом святого. После этого к иконе началось настоящее паломничество.
Икона много лет считалась утраченной, однако уже в наши, столь же неспокойные времена икона обнаружилась на прежнем месте: оказалось, что во времена богоборчества ее не демонтировали, а попросту загородили. Реставраторы нашли образ Николая уцелевшим на 50%. Кстати, на Спасской башне с иконой произошла подобная история, где образ Спасителя сохранился на 80%.