С развитием генетики, интерес вызывают не только вопросы о происхождении популяций, но также и отдельных людей, особенно если они принадлежали знатному роду. В частности, вопросы о происхождении элиты средневековой Руси IX–XVI вв., где важнейшими действующими лицами были представители правящего рода Рюриковичей, долгое время были предметом дискуссий. Ранее отцовские линии в виде гаплогрупп Y-хромосомы Рюриковичей были реконструированы по биологическим материалам современных людей, чьё происхождение, c разной степенью достоверности восходит к Рюрику. А что касается исследований древних геномов, то их осложняют трудности в идентификации останков Рюриковичей и другой знати. Поскольку до начала XV в. имена погребенных отсутствовали на погребальных сооружениях, надгробиях и саркофагах. Места погребений той эпохи устанавливаются по летописным сообщениям и спискам имён для поминовения XVI–XVII вв. Помимо этого практики повторного использования старых погребальных сооружений, перемещение почитаемых останков и их изъятие в ходе антирелигиозной кампании в советское время, привели к тому, что значительная часть останков XI–XIV вв. из погребений в древнерусских храмах и не только, оказалась утрачена или не может быть достоверно связана с определенными историческими личностями.

К примеру, в 1967 году на территории Черниговского Спасо-Преображенского собора во время строительных работ был случайно обнаружен череп мужчины 25-35 лет со следами ран от меча, без археологического документирования. Останки были предположительно отнесены одному из внуков Ярослава Мудрого - Глебу Святославичу, князю тмутараканскому и новгородскому, жившему в 11 веке. Однако точно определить кто был похоронен в каменном саркофаге возле Черниговского Спасо-Преображенского собора не представляется возможным. Особенно в свете недавнего анализ ДНК этого человека, который показал, что он был носителем гаплогруппы Y-хромосомы I2a1a2b1a1a и обладателем митохондриальной линии H5a2a.

Датировки (только археологические): Саркофаг найден на заднем дворе собора. Глубина верхней плиты саркофага составляла 1,9-2,0 м от современной поверхности. Стратиграфия несколько пострадала от более позднего нарушения грунта: трубы водоснабжения проложены на высоте 0,2 м над изголовьем саркофага. Археологи относят его к XI веку нашей эры.
гаплогруппа – Y-хромосомы I2a1a2b1a1a
гаплогруппа мтДНК – H5a2a

Поэтому особую ценность представляют те немногочисленные захоронения, где костные останки по археологическому контексту, антропологическим данным и комплексу исторических свидетельств надёжно отнесены к представителям рода Рюриковичей.

К таким достоверным захоронениям относится погребение в Спасо-Преображенском соборе Переславля-Залесского князя Дмитрия Александровича, второго сына Александра Ярославича Невского. Прямые сообщения о погребении Дмитрия Александровича в Спасо-Преображенском соборе содержит ряд летописей, в том числе Новгородская четвёртая, Воскресенская, Никоновская летописи, а также Московский великокняжеский свод конца XV века.

А поиск места погребения был облегчен ещё и тем фактом, что после захоронения князя Дмитрия Александровича в 1294 году и его наследника бездетного старшего сына Ивана в 1302 году с последующим переходом Переяславского княжества Москве, этот храм как престижная усыпальница использовался реже чем многие другие в средневековье. Изучив все доступные документы, можно было полагать, что погребение Ивана Дмитриевича находилось в юго-западной части собора, под хорами, а погребение князя Дмитрия Александровича – в юго-восточной части, в южной алтарной апсиде, где до реставрации 1891 г. находились отмечавшие места погребений более поздние кирпичные надгробия XVII в. В результате сам саркофаг с останками, был обнаружен отрядом Института археологии РАН под руководством Владимира Валентиновича Седова в 2014 г.

Князь Дмитрий Александрович унаследовавший после смерти великого князя Александра Ярославича Невского – Переславское княжество, в разные годы также был новгородским князем и великим князем владимирским. Князь умер в 1294 году на Ламском Волоке, возвращаясь в Переславль из Твери, и был похоронен в Спасо-Преображенском соборе Переславля.

Результаты

Палеогенетический анализ

В результате полногеномного секвенирования фрагментов древней ДНК из наиболее информативного образца - ладьевидной кости стопы Nev2.3, сгенерировано более 15 млн чтений, определены 532154 однонуклеотидных полиморфизма (ОНП). В процессе обработки данных секвенирования установлено, что это был мужчина с митохондриальной гаплогруппой F1b1 и гаплогруппой Y хромосомы N1a1a1a1a1a1a7a~ N-Y59140.

Анализ Y-хромосомы князя Дмитрия Александровича и других предполагаемых представителей рода Рюриковичей

На основании результатов генетических исследований трех древних потомков Рюрика и предполагаемых 43 современных Рюриковичей выдвинуты гипотезы о трех возможных отцовских линиях Рюрика, а именно N1a, R1a и I2a.

В результате филогенетического позиционирования Y хромосома князя Дмитрия Александровича кластеризовалась с Y хромосомами современных вероятных потомков Рюриковичей, принадлежащих к гаплогруппе N1a, которые произошли из различных аристократических родов: Мстиславичей и Юрьевичей, потомков Мономаха от великого князя Мстислава Владимировича и великого князя Киевского Юрия Долгорукого, а также Ольговичей, черниговских Рюриковичей, потомков князя Олега Святославича или «Гориславича».

При этом важно отметить, что вероятные захоронения князя Глеба Святославича Черниговского, из рода Ольговичей, с линией I2a и Изяслава Ингваревича Луцкого, из рода Мстиславичей, с линией R1a, не подтверждены археологическими данными, что ставит под сомнение и гипотезы, которые вытекают из генетического анализа указанных образцов.

В целом как древние, так и современные предполагаемые Рюриковичи с линиями гаплогрупп R1a и I2a, обладают высокой гетерогенностью нуклеотидной последовательности Y хромосом и не указывают на единое происхождение по прямой мужской линии. В то время как большинство ныне живущих потомков Рюрика по прямой мужской линии согласно их родословным, с гаплогруппой N1a, обладают максимально похожими вариантами Y хромосомы как между собой, так и с Y хромосомой князя Дмитрия Александровича. Что совместно с полногеномными данными средневековых и современных Рюриковичей указывает на то, что, как минимум, со времени великого князя Ярослава Мудрого (XI в), мужчины этого рода были носителями гаплогруппы Y-хромосомы N1a.

Поиск живших в прошлом людей наиболее близких к князю Дмитрию Александровичу по Y-хромосоме

На филогенетическом дереве Y хромосомы видно, что помимо современных Рюриковичей, линия Дмитрия Александровича группируется с древними людьми середины II тысячелетия до н.э. Оленеостровского могильника в Кольском заливе Баренцева моря.

В предыдущих работах на примере этих образцов был показан поток генов из Сибири на север и восток Европы (восточно-евразийская компонента).

Высокая степень биологического соответствия Y-хромосомы представителя русского княжеского рода и людей эпохи раннего металла привела авторов работы к гипотезе о возможном вкладе восточно-евразийского генофонда в формирование североевропейского населения раннего средневековья, поскольку, согласно летописям, Рюриковичи имели с ними генетическую связь.

Авторы работы исследовали вклад людей с Большого Оленьего острова в формирование средневекового населения, жившего вдоль побережья Балтийского моря из современных Финляндии, Дании, Швеции и Норвегии, используя геномы периода «викингов» из работы 2020 года, обзор которой тоже есть на канале. В статистических анализах удалось выявить существенный вклад геномов древних представителей Большого Оленьего острова в формирование генофонда популяций периода «викингов», скорее всего, благодаря контактам последних с финно-угорским населением прибалтийского региона. При этом у представителей периода «викингов» с гаплогруппой N1a этот вклад выше чем у носителей линий R1a. Результаты показывают, что в формировании генофонда отдельных жителей из Швеции, Норвегии и Балтийского региона участвовали и люди из Сибири с восточноазиатскими корнями. При этом в наиболее подходящих моделях, помимо европейских охотников-собирателей, неолитических земледельцев и степных скотоводов, скандинавские популяции моделировались с участием обитателей Большого Оленьего острова или представителей хунну железного века.

Здесь стоит адекватно воспринимать компоненты в моделях. В данном случае хунну добавлены для проверки географического происхождения компоненты из Сибири, если говорить упрощённо.

А что касается предков князя Дмитрия Александровича по мужской линии, то с большой вероятностью, среди них были мужчины, оставившие могильник на Большом Оленьем острове в Кольском заливе Баренцева моря около 3600 лет назад.

Анализ мтДНК князя Дмитрия Александровича

Митохондриальную гаплогруппу F1b1, определенную у князя Дмитрия Александровича относят к восточно-евразийскому кластеру, она встречается с разной частотой у большинства исследованных древних и современных популяций Байкальского региона и сопредельных территорий Центральной Азии.

Помимо этого, митохондриальные гаплогруппы F1b1b и F1b1f обнаружены у одного представителя раннеаварского периода и двух представителей среднеаварского периода VII в. из междуречья Дуная и Тисы, геномные профили которых схожи с таковыми у представителей элиты раннеаварского периода из того же региона и на 90–98% состоят из предковой компоненты как у жителей бассейна Амура периода древнемонгольских племен Сяньби (AR_Xianbei_P_2c), с генетическим профилем восточной степи, маркером которого выступает генетическая компонента древних северо-восточных азиатов (ANA), как и у представителей неолита из пещеры Чёртовы ворота в Приморье.

Погребения мужчин с митохондриальными линиями F1b1b и F1b1f, а также с линией Y-хромосомы N1a1a1a1a3a (F4205) характеризовались довольно богатым погребальным инвентарем с золотыми и позолоченными предметами, что указывает на их принадлежность к знати.

● A1811 – Женщина, захороненная с костями овец или коз. мтДНК F1b1f
● A1812 – Мужчина из богато обставленной могилы, с золотыми серьгами, золотыми заколками для волос, ремешками из золотой фольги с переплетающимися узорами из серебра
и мечом, украшенным золотыми пластинами.
мтДНК – F1b1f, Y-хромосомы – N1a1a1a1a3a (F4205)
● A1821 – Пожилой мужчина, захороненный с исключительно богатыми погребальным инвентарём, включающим позолоченный меч и пояс. мтДНК – F1b1b, N1a1a1a1a3a (F4205)

Однако с уверенностью говорить о происхождении материнской линии князя Дмитрия Александровича довольно сложно, так как практически во всех исторических периодах прослеживается повышенная изменчивость и разнообразие митохондриальных гаплогрупп в одном регионе.

Здесь также важно понимать разницу между генофондом популяций и отдельно взятых людей, особенно представителей знатных родов, у которых была широко распространена практика привлечения самых разных по своему происхождению женщин для союзов, официального и неофициального характера, в качестве выгодных или вынужденных политических шагов. Поэтому материнская линия F1b князя Дмитрия Александровича могла быть связана как с древними миграциями из Сибири, так и с миграциями кочевников раннего средневековья. При этом у этих разных по времени групп могло быть общее происхождение этих линий.

Результаты анализа главных компонент

Генетическую близость генома князя Дмитрия Александровича к другим известным древним и современным популяциям оценили с помощью метода главных компонент (PCA).

Сразу стоит отметить, что надо адекватно понимать положение на этом графике отдельных представителей популяций, особенно из знатного рода. Если положение большинства образцов сочетается с их географией, то положение отдельно взятых людей от смешанных союзов будет где-то между положением его родителей. При этом генетическая схожесть в этом анализе не подразумевает общую историю, а лишь схожие пропорции генетических компонент.

В нашем случае геном князя Дмитрия Александровича занимает промежуточное положение между древними и современными образцами из Европы и Центральной Азии. Наиболее близкими генетически и хронологически к князю Дмитрию Александровичу, расположены некоторые представители авар позднеаварского периода из междуречья Дуная и Тисы, а также из предполагаемого вторичного центра власти Аварского каганата к востоку от Тисы.

Здесь стоит напомнить, что в Аварском каганате (VI–IX вв.), помимо европеоидного большинства ярко выраженный монголоидный тип, имели, преимущественно, представители элиты, который размывался со временем к позднеаварскому периоду.

Как известно из работы 2022 года, популяции аварского периода демонстрируют значительную генетическую изменчивость, а их образцы разбросаны на графике анализа главных компонент от популяций Западной Евразии до популяций Северо-Восточной Азии.

Однако несмотря на эту общую неоднородность, существуют четкие закономерности генетической подструктуры, соответствующие как хронологии и географии Карпатского бассейна, так и социально-археологическим категориям. Почти все представители элиты раннеаварского периода образуют плотный кластер с высоким содержанием компоненты «древних северо-восточных азиатов» (АНА) до 98%. Однако образцы представителей элиты позднеаварского периода уже сильнее смещены в сторону Западной Евразии, а количество родословной «древних северо-восточных азиатов» у них сократилось уже до 70-80%.

При этом среди простых жителей раннего и позднего аварского периодов преобладал более западный генетический профиль, демонстрирующий сильную связь с населением Карпатского бассейна доаварского периода, с нулевым или небольшим вкладом компоненты «древних северо-восточных азиатов». И как раз именно к этой группе образцов относится расположенный рядом с князем Дмитрием Александровичем представитель позднеаварского периода со смешанным генетическим профилем (Hungary_LateAvar), примерно, на 80% состоящим из компоненты максимально выраженной у предшествующих местных жителей Карпатского бассейна и на 20% из компоненты «древних северо-восточных азиатов» из восточной степи.

Анализ примесей (Admixture)

В анализе примесей, по предковым компонентам отмечено генетическое сходство князя Дмитрия Александровича с представителями раннесредневекового населения востока Скандинавии периода викингов.

Что может свидетельствовать в пользу версии о «варяжском» (скандинавском) происхождении Рюрика, родоначальника княжеского рода, призванного на Русь, о чем прямо говорит Летопись. При этом авторы, используя термин «викинги», подчёркивают, что это неоднородная и сложная по своему историческому формированию европейская популяция, объединенная лишь образом жизни и ареалом проживания. Однако есть и отличие генома князя от скандинавских популяций эпохи «викингов», в том числе с территории современной России, это отличие связано с наличием у него дополнительной восточно-евразийской компоненты (обозначенной синим цветом на графике), отсутствующей в таком количестве у подавляющего большинства «викингов». Эта компонента максимально выражена у нганасан, финно-угорского народа Западной Сибири манси, представителей народа хань в Китае, у элиты авар из междуречья Дуная и Тисы (Hungary_DanubeTisza_MLAvar), а также у более древних представителей эпохи раннего неолита Байкала и Монголии (Russia_Shamanka_Eneolithic. SG и Mongolia_North_N). В меньшей степени эта компонента обнаружена у жителей раннего средневековья с территории современной Финляндии (Finland_Levanluhta), у кочевника Прикаспийской степи (Russia_Medieval_Nomad), современника князя Дмитрия Александровича, а также у более древних ираноязычных степных кочевников железного века с территорий современных Казахстана и Кыргызстана (Kazakhstan_TianShan_Saka, Kyrgyzstan_TianShan_Hun). Суммарно, на основании данных анализа главных компонент, анализа примесей и информации о митохондриальной ДНК можно утверждать, что в геноме князя Дмитрия Александровича имеется существенный вклад восточной предковой компоненты, что отличает его от раннесредневекового населения востока Скандинавии, «викингов» и средневекового славянского образца из Владимира (Сунгирь6), но сближает в первую очередь с древним населением Финляндии, Кольского полуострова и раннесредневековым населением Центральной Европы с этой компонентой. Вероятно, этот вклад получен и по мужской, и по женской линиям, что соответствует процессам древней миграции из Сибири по степному евразийскому коридору в 1 тыс. до н.э.–1 тыс. н.э.

Моделирование генома князя Дмитрия Александровича из геномов предковых популяций

После анализа различных комбинаций предковых компонент наиболее подходящая модель указывает на вклад в происхождение князя Дмитрия Александровича трех компонент, как у следующих популяций:

1. Раннесредневекового населения востока Скандинавии с острова Эланд. Или славян, представленных геномами Шекшово9 и Сунгирь6.

2. Представителей степных кочевых народов евразийских степей железного века или раннесредневекового населения Центральной Европы (степных кочевников с территории Венгрии).

3. Восточно-евразийской компоненты.

Предсказание фенотипических признаков князя Дмитрия Александровича на основании генетических данных

С большой вероятностью глаза князя Дмитрия Александровича были карими (P = 0.962), волосы темными (P = 0.810) или коричневыми (P = 0.555), а оттенок кожи промежуточным (0.635), т.е. не светлым и не темным.

Выводы

Благодаря палеогенетике и применению статистических методов проверки гипотез, подтверждается связь Рюриковичей со Скандинавией по мужской линии, хотя отсутствие генетических данных от населения с территории севера Руси в период, непосредственно предшествовавший становлению княжеского правления, не позволяет предметно судить о присутствии предков князя Дмитрия Александровича и других Рюриковичей на материковом севере и северо-востоке Европы. Анализ генеалогического древа Рюриковичей показал, что современные представители этого рода, с гаплогруппой Y-хромосомы N1a, группирующиеся с образцом князя Дмитрия Александровича, относятся к трем разным ветвям этого рода – Ольговичам, Мстиславичам и Юрьевичам. Которые восходят к князю Ярославу Мудрому, как к ближайшему их общему предку.

В свою очередь митохондриальная гаплогруппа F1b1 у князя Дмитрия Александровича может свидетельствовать о вкладе восточных популяций в его генотип, что подтверждается и аутосомными данными. Согласно результатам анализа главных компонент и анализа примесей, геном князя Дмитрия Александровича имеет сходство с геномами представителей скандинавских популяций эпохи «викингов», но отличается от них заметным вкладом восточной компоненты. Что может быть связано с распространенной практикой браков русских князей с дочерями половецких ханов с конца XI в. Такие браки скрепляли союзнические отношения и усиливали политическое взаимодействие.

Мать Дмитрия, супруга Александра Невского – Александра Брячиславна происходит из рода полоцких Изяславичей. Сведения о женах этих князей скудны, имя и происхождение матери Александры неизвестно. Однако, известно, что представители полоцкой ветви Рюриковичей не избегали брачных союзов с половчанками. Из половецкого рода происходила вторая жена полоцкого князя Святополка Изяславича (1050–1113), Елена, дочь хана Тугоркана.

Однако восточная компонента в геноме Дмитрия Александровича могла быть получена одновременно и по мужской, и по женской линиям, отражая браки Рюриковичей с представительницами династий Центральной и Южной Европы, как сербские Вукановичи или венгерские Арпады, к примеру. Элиты этих территорий могли в большей степени, чем «простое» местное население, сохранить восточные гены, привнесенные миграционными потоками первого тысячелетия нашей эры. Исходя из перечисленных вероятностей, объяснения присутствия «восточной компоненты» в геноме Дмитрия Александровича, пока остаются гипотетическими, как и состав его предков по материнской линии.

Но несмотря на оставшиеся вопросы, впервые на примере представителя древнего рода Рюриковичей показана генетическая составляющая сложного характера межэтнических взаимодействий в формировании знати средневековой Руси.

Источник: Жур К.В., Шарко Ф.С., Седов В.В., Добровольская М.В., Волков В.Г., Максимов Н.Г., Сеславин А.Н., Макаров Н.А., Прохорчук Е.Б. Рюриковичи: первый опыт реконструкции генетического облика правящего рода средневековой Руси по данным палеогеномики // Acta Naturae. - 2023. - Т. 15. - №3. - C. 50-65. doi: https://doi.org/10.32607/actanaturae.23425

Взято отсюда https://youtube.com/@konkaron

Если в сообществе не принято обращаться с такими просьбами, то прошу прощения, в правилах об этом ничего не сказано.

https://youtu.be/4eT7o8NrZj4

Результаты GEDMATCH (самый точный)

Каждая линия на этом рисунке представляет собой отношение предок-потомок в новой генеалогии современных и древних геномов. Толщина линии соответствует тому, как часто в [существующих] данных эти отношения наблюдались, и линии окрашиваются на основе предполагаемого возраста предка. Источник изображения: Воспроизведено с разрешения Wohns et al., Унифицированная генеалогия современных и древних геномов. Science (2022). doi: 10.1126/science.abi8264.

Согласно новому исследованию, опубликованному 24 февраля в журнале Science, чтобы построить это генеалогическое древо, или генеалогию, исследователи просеяли тысячи последовательностей генома, собранных как у современных*, так и у древних людей, а также у древних родственников человека. Эти геномы были получены из 215 популяций, разбросанных по всему миру. Используя компьютерный алгоритм, команда выявила чёткие паттерны генетических вариаций внутри этих последовательностей, выделив, где они совпадают, а где различаются. Основываясь на этих закономерностях, исследователи провели теоретические родственные линии между геномами и получили представление о том, какие варианты генов, или аллели, вероятно, несли общие предки этих людей.

*В этой статье, под "современными людьми", подразумевают людей прошлого, которые генетически были нашими прямыми предками. Более подробно читайте относительно свежую статью Александра Маркова "Происхождение человечества в свете новых данных палеоантропологии и генетики". – прим. ред.

В дополнение к выявлению этих генеалогических связей команда приблизилась к тому, где в мире жили общие предки секвенированных особей. Они оценили эти местоположения, основываясь на возрасте отобранных геномов и месте, где был отобран каждый геном.

"То, как мы оценивали, места проживания предков, в частности, имеет весьма предварительный характер," – сказал первый автор Энтони Уайлдер Уонс, который на момент проведения исследования был докторантом Института больших данных Оксфордского университета. Несмотря на свои ограничения, эти данные по-прежнему отражают основные события в эволюционной истории человека. Например, "мы определённо видим неопровержимые доказательства события вне Африки", то есть первоначального расселения Homo sapiens из Восточной Африки в Евразию и за её пределы, – сказал Уонс, который сейчас является постдокторским исследователем в Институте Брода Массачусетского технологического института и Гарварда.

Метод, который использовали исследователи, "хорошо работает для уточнения известных мест обитания предков, а по мере совершенствования выборки он потенциально может выявить неизвестные в настоящее время перемещения человека", – написали в комментариях, к также опубликованной статье в журнале Science Аида Андрес, адъюнкт-профессор в области генетики, эволюции и окружающей среды Института генетики Университетского колледжа Лондона (UCL), и Джасмин Рис, докторант Института генетики UCL.

Таким образом, в будущем, когда появится больше данных, такой анализ потенциально может выявить главы человеческой истории, которые в настоящее время нам неизвестны.

Построение генеалогического древа человека

Чтобы создать единую генеалогию человечества, исследователи сначала объединили геномные данные из нескольких больших общедоступных наборов данных, включая проект "1000 геномов", проект "Разнообразие генома человека" и проект "Разнообразие генома Саймонса". Из этих наборов данных они собрали около 3600 высококачественных последовательностей генома современных людей; "высококачественные" последовательности генома – последовательности с очень небольшим количеством пробелов или ошибок, которые в основном собраны в правильном порядке, согласно публикации 2018 года в журнале Nature Biotechnology.

По словам Вонса, высококачественные геномы древних людей было труднее найти, так как ДНК древних образцов имеет тенденцию сильно деградировать. Однако, копаясь в ранее опубликованных исследованиях, команде удалось найти восемь высококачественных древних геномов гомининов для включения в своё древо. Они включали три генома неандертальца, возраст, одного из которых, как полагают, превышает 100 000 лет; геном денисовца примерно 74 000-82 000 лет; и четыре генома нуклеарной семьи, жившей в горах Алтая в России около 4600 лет назад.

Неандертальцы и денисовцы – вымершие родственники Homo sapiens.

В дополнение к этим высококачественным древним геномам команда выявила более 3500 дополнительных геномов более низкого качества со значительной деградацией, возраст которых варьируется от нескольких сотен до нескольких тысяч лет.

Эти деградированные геномы не учитывались в основном древовидном построении, но команда просеяла фрагменты, чтобы увидеть, какие изолированные аллели могут быть идентифицированы в образцах. Эти разрозненные данные помогли исследователям подтвердить, когда различные аллели впервые появились в генеалогической летописи, поскольку образцы, из которых были взяты геномы, были датированы радиоуглеродным методом.

Древние геномы обеспечивают "уникальный снимок генетического разнообразия в прошлом", который может помочь выявить, когда и где впервые появился генетический вариант и как он распространился впоследствии, сообщили Андрес и Рис в совместном заявлении Live Science.

"Хотя это исследование не интегрировало низкокачественные древние геномы в процессе построения древа, их использование для определения возраста вариантов внутри древа всё ещё является мощным средством для этих целей и обещает много захватывающих достижений в будущем".

Уонс и его коллеги использовали эти данные, чтобы перепроверить, имеют ли линии происхождения, обозначенные в их генеалогическом древе, смысл с точки зрения времени – и в большинстве случаев они это сделали.

"Очень обнадеживает тот факт, что... в 90% случаев мы согласуемся с образцами, которые археологи могут датировать радиоуглеродным методом," – сказал Уонс. "Но есть, вы знаете, 5% или 10% этих генетических вариантов, где мы видим противоречивые оценки" относительно того, когда они впервые появились, согласно противоречивым результатам археологических записей и оценкам, сделанным алгоритмом, – отметил он. В этих случаях команда скорректировала своё древо, чтобы отразить время, которое можно было подтвердить с помощью радиоуглеродного датирования, сказал он.

Хотя построенное древо основанное всего на нескольких тысячах образцов генома, окончательное генеалогическое древо "на самом деле отражает довольно много о генеалогии всего человечества," – сказал Уонс. Используя древо в качестве каркаса, команда затем провела свой географический анализ, чтобы увидеть, когда и где, вероятно, жили теоретические предки выбранных ими популяций. Исходя из этого, они не только нашли чёткие доказательства миграции из Африки, но и обнаружили потенциальные доказательства взаимодействия между Homo sapiens и ныне вымершими гоминидами, такими как денисовцы, сказал он.

Например, их результаты показали, что предки современных людей могли быть найдены в Папуа-Новой Гвинее около 280 000 лет назад, за сотни тысяч лет до появления самых ранних свидетельств обитания современных людей в этом регионе. Это не обязательно означает, что H. sapiens действительно занимал эту территорию так давно, "но это, возможно, говорит о том, что есть какая-то генетическая вариация, которая встречается только в этом регионе, и указывает на то, что там действительно существует давняя родословная, которая не встречается в других местах," – сказал он.

Часть этой уникальной родословной может происходить от скрещивания современных людей с денисовцами, как было также предложено в исследовании, опубликованном в 2019 году в журнале Cell, которое обнаружило геномные доказательства скрещивания современных людей с несколькими группами денисовцев.

"Древовидные схемы, сгенерированные в этом исследовании, несомненно, окажутся полезными для тех, кто изучает эволюцию человека," – написали Андрес и Рис в своём комментарии. Одним из ограничений является то, что большая часть геномного секвенирования была проведена в евразийских популяциях, поэтому, хотя новое исследование включало тысячи современных геномов, данные не могут полностью охватить глобальное генетическое разнообразие, сообщили они Live Science по электронной почте. "Дальнейшая интеграция недопредставленного населения будет продолжать устранять это ограничение," – сказали они.

"В этих оценках много неопределенности," – сказал Уонс о недавних результатах команды. "Разве только у нас был бы геном всех, кто когда-либо жил, данные о том, где и когда они жили, это был бы единственный способ узнать правду." Команда реконструировала человеческую историю настолько точно, насколько это было возможно, учитывая имеющиеся данные, но с большим количеством образцов генома и более сложным программным обеспечением древо определённо можно было бы усовершенствовать," сказал он.

"Преимущество созданных нами методов заключается в том, что они потенциально могут работать с миллионами образцов," – сказал Уонс. "Значит, по мере того как у нас будет больше данных, мы получим более точные оценки."

Уонс сказал, что сейчас он работает над разработкой новых алгоритмов машинного обучения, чтобы улучшить оценки того, где и когда жили наши предки. В отдельном проекте он планирует использовать тот же метод построения древовидных схем, чтобы лучше понять генетическую основу заболеваний человека. Для этого он планирует точно определить место происхождения аллелей, связанных с болезнями, а затем восстановить, как и когда эти варианты генов распространились в различных популяциях.

Тот же метод можно было бы использовать и для отслеживания эволюционной истории других организмов, таких как медоносные пчелы или крупный рогатый скот, и даже таких инфекционных агентов, как вирусы, добавил он.

Источник

Экспериментирую с новыми форматами. Пилотный выпуск.

Палеогенетики выявили крупномасштабную миграцию на юг Великобритании в период от среднего до позднего бронзового века

Команда международных исследователей, благодаря полногеномным данным от 793 человек, 416 из которых было из Великобритании, выявила ранее неизвестную миграцию людей на юг Великобритании в период от среднего до позднего бронзового века, более чем за полтора тысячелетия до саксонского периода, возможно с территории Франции. Попутно решив задачку с увеличенным компонентом ранних европейских земледельцев у современных британцев, особенно в южной части Великобритании по сравнению с ранним бронзовым веком. Анализ примесей показал, что этот компонент увеличивался на в южной части Великобритании от раннего бронзового века до позднего с 31 до 36% и зафиксировался на 38% в железном веке, когда поток миграций сократился и Великобритания находились в относительной генетической изоляции от большей части континентальной Европы.

Что отражено в росте аллеля, обеспечивающего толерантность к лактозе до ~ 50% к тому времени по сравнению с ~ 7% в Центральной Европе, где его частота быстро возросла только тысячелетие спустя.

Это говорит о том, что молочные продукты использовались качественно по-разному в Великобритании и в Центральной Европе в течение этого периода.

А в целом эти вновь выявленные мигранты внесли около половины предков в жителей Англии и Уэльса железного века, тем самым поддерживая теорию, что кельтский язык распространился по южной части Британии из Франции в конце бронзового века. И возможно сосуществовал там с другими языками.

Самое большое генеалогическое древо, составленное по древней ДНК на сегодняшний день

Древо включает 27 членов семьи из пяти поколений, обнаруженных в могильнике Хазлтон Северный, возрастом около 5700 лет.

Где патрилинейность сыграла ключевую роль в определении того, кто был похоронен в гробнице, поскольку все 15 передач из поколения в поколение происходили по мужской линии. Отец-основатель семейства имел потомство от 4-х женщин. Потомки двух из этих женщин были похоронены в одной и той же половине гробницы на протяжении всех поколений. Это говорит о том, что материнские подлинии были сгруппированы в ветви, отличительность которых была признана во время их захоронения. Отсутствие взрослых дочерей предполагает их погребение в других местах, вероятно, рядом с мужьями. Интересно, что помимо рождённых от отца-основателя и его потомков, в этой же гробнице были захоронены и дети от других мужчин, что авторы работы интерпретируют как факт усыновления. Помимо этого, 8 человек не были близкими биологическими родственниками основной линии, что повышает вероятность того, что родство также охватывало социальные связи, независимые от биологического родства. При этом все проанализированные люди, за исключением одного, избегали близкородственных связей.

Размеры средневековых боевых коней

Команда учёных, в поисках крупных коней – дестриэ, исследовала останки 1964 лошадей из 171 археологического памятника по всей Великобритании, живших в период с 300 по 1650 гг. н. э. По факту это крупнейшая выборка.

Невзирая на экономическую и политическую роль лошадей того периода они были относительно небольших размеров. В среднем лошади саксонского и норманнского периодов (V-XII веков), оказались размером шотландского пони. Лошади саксонского периода среднем схожи с позднеримскими, при этом разнообразие лошадей было меньше чем позднеримский период и вновь восстанавливается только в период позднего средневековья.

А крупные аномальные образцы появляются только с нормандского периода 1066-1200 годы и далее.

Для норманнского периода максимальная высота в холке зафиксировано 150 сантиметров это для лошади из замка Троубридж графства Уилтшир. Её размеры уже соответствует размерам современными легким верховым лошадям. Кстати здесь стоит отметить, что шотландские пони были не такие уж и маленькие (рост верховых шотландских пони — 132-140 см).

А в период высокого средневековья 1200-1350 годы впервые появляются лошади выше 160 сантиметров. Но только в период постсредневековья (1500-1650 годы), средний рост лошадей становится больше. При этом в постсредневековый период увеличивается и разнообразие размеров лошадей, отмене 120 сантиметров, до, почти, 170 сантиметров. И наконец их рост приближается к росту современных тяжеловозов и полукровных пород лошадей. При этом авторы работы отмечают что дальнейший поиск крупных боевых рыцарских лошадей дестриэ, должен переместиться на домашние помойке и живодёрни.

Кем были шумерские "кунга"?

Ещё до появления домашних лошадей в Месопотамии в конце третьего тысячелетия до нашей эры, клинописные таблички и печати, свидетельствовали о преднамеренном разведении животных, похожих на лошадей и называемых горные лошади, а также "кунга", которые были в шесть раз дороже ослов. Упоминания об этих ценных непарнокопытных также можно найти в нескольких глиняных табличках, в которых подробно описываются расходы на корм, например, ячмень для непарнокопытных бога Шара, покровителя города Уммы и обожествленного царя Шульги из Ура.

Размер и скорость крупных самцов кунга, делали их более предпочтительными по сравнению с ослами для буксировки четырехколесных боевых повозок, которые предшествовали колесницам с лошадьми. Более мелкие животные использовались в сельском хозяйстве. Центром разведения кунга был город Нагар, современный сирийский Тель-Брак на севере древней Месопотамии, чьи правители также дарили кунга элите союзных территорий.

Именно эти животные, предположительно были изображены на королевских печатях по всему региону, а также на штандарте войны и мира из Ура на территории современного Ирака.

А после появления в регионе домашних лошадей, использование этих животных сократилось, и они в конечном итоге исчезли. Но кем были эти кунга? Морфометрический анализ непарнокопытных, обнаруженных в богатых погребениях раннего бронзового века в сирийском Умм-эль-Марра, не дал точных результатов.

И вот новый генетический анализ образцов, возрастом около 4,5 тыс. лет, показал, что это были самые ранние из известных межвидовых гидридов, в истории человечества, а именно смесь ныне вымерших, сирийских куланов с домашними ослицами.

И как предполагают авторы эти гибриды были бесплодными, поэтому не оставили следов, а в последствии были заменены лошадьми.

Новоассирийский кожаный доспех в Турфане

В 2013 году в могильнике Янхай, в 43 км к юго-востоку от современного Турфана, Синьцзян-Уйгурского автономного района КНР, были обнаружены остатки кожаного чешуйчатого доспеха.

Эта находка вызвала ряд вопросов, о времени и месте создания доспехов. И вот недавно были опубликованы результаты радиоуглеродного датирования, с подробностями конструкции доспехов и сравнительным анализом находки с аналогами из разных регионов.

Доспехи, датируемые 786-543 годами до н. э., первоначально были изготовлены из примерно 5444 мелких чешуек и 140 крупных, которые вместе с кожаными шнурками и подкладкой весил около 4-5 кг, и мог надеваться без сторонней помощи.

Благодаря сравнительному анализу авторы предполагают, что доспех мог быть изготовлена в Новоассирийском царстве и не имеет аналогов в соседних с Турфаном регионах того времени. Хотя в данном случае сохранности способствовал засушливый климат.

При этом неясно как он попали в Синьцзян.

Однако если место производства доспеха определено верно, то это является одним из редких доказательств передачи технологий с запада на восток в 1 тысячелетии до нашей эры, когда усилились социальные и экономические преобразования.

Древние нубийцы конца 1-го тысячелетия н. э.

Относительно мало известно о генетическом ландшафте Нубии до исламских миграций, которые начались в конце 1-го тысячелетия нашей эры. В новой работе, в дополнение к 3-м ранеесеквенированным геномам, авторы представляют данные ДНК 66 человек с двух кладбищ в районе нильского острова Кулубнарти в Северном Судане христианского периода (~ 650-1000 гг. н.э.), с многочисленными свидетельствами социальной стратификации между двумя кладбищами.

У исследованных представителей нубийцев было около 43% предков, родственным нилотам, а оставшаяся родословная была из-за пределов Египта и была схожей с таковой в Леванте бронзового и железного веков. При этом генофонд Кулубнарти – сформировавшийся в течение как минимум тысячелетия, содержит непропорционально большое количество западноевразийских предков, связанных с Левантом по женской линии. По отдельным признакам исследователи определили, что на 2-х кладбищах хоронили людей разного достатка.

При этом авторы не нашли генетических различий между людьми, захороненных на обоих кладбищах, которые по археологическим и антропологическим данным можно разделить по достатку и уровню жизни. А стало быть в древнем нубийском обществе социальный статус не зависел от происхождения. А наличие захороненных родственников между кладбищами говорит о возможности перехода из одного социального слоя в другой.

Помимо этого, современные нубийцы не являются прямыми потомками нубийцев Кулубнарти, что свидетельствует о дополнительном генетическом вкладе со времен христианского периода.

Фарерские острова были заселены раньше, чем считалось

Фарерские острова, входящие в состав современного Королевства Дании, расположены в Северной Атлантике между Норвегией и Исландией.

В середине IX века н. э. они были заселены викингами, однако несколько косвенных свидетельств предполагали более ранние даты заселения Фарерских островов выходцами с Британских. В новой работе, авторы, используя озёрные отложения, фекальные биомаркеры и фрагменты осадочной древней ДНК овец, определили, что люди и домашний скот жили на Фарерских островах, примерно за 350 лет до прибытия туда викингов с территорий современной Норвегии, а именно около 500 г. н. э. Возможно это были кельты.

Но более точно кто это был, ещё предстоит установить.

Источники:
1. Patterson, N., Isakov, M., Booth, T. et al. Large-scale migration into Britain during the Middle to Late Bronze Age. Nature 601, 588–594 (2022). doi.org/10.1038/s41586-021-04287-4
2. Fowler, C., Olalde, I., Cummings, V. et al. A high-resolution picture of kinship practices in an Early Neolithic tomb. Nature 601, 584–587 (2022). doi.org/10.1038/s41586-021-04241-4
3. Aleksander Chrószcz, Piotr Baranowski, Andrzej Janowski, Dominik Poradowski, Maciej Janeczek, Vedat Onar, Beata Sudoł, Przemysław Spychalski, Agnieszka Dudek, Waldemar Sienkiewicz, Albert Czerski, Withers height estimation in medieval horse samples from Poland: Comparing the internal cranial cavity‐based modified Wyrost and Kucharczyk method with existing methods, International Journal of Osteoarchaeology, doi.org/10.1002/oa.3073 (2021).
4. E. Andrew Bennett, Jill Weber, Wejden Bendhafer, Sophie Champlot, Joris Peters, Glenn M. Schwartz, Thierry Grange, Eva-Maria Geigl. The genetic identity of the earliest human-made hybrid animals, the kungas of Syro-Mesopotamia. Science Advances, 2022; 8 (2) DOI: doi.org/10.1126/sciadv.abm0218
5. Patrick Wertmann, Dongliang Xu, Irina Elkina, Regine Vogel, Ma'eryamu Yibulayinmu, Pavel E. Tarasov, Donald J. La Rocca, Mayke Wagner. No borders for innovations: A ca. 2700-year-old Assyrian-style leather scale armour in Northwest China. Quaternary International, 2021; DOI: doi.org/10.1016/j.quaint.2021.11.014
6. Sirak, K.A., Fernandes, D.M., Lipson, M. et al. Social stratification without genetic differentiation at the site of Kulubnarti in Christian Period Nubia. Nat Commun 12, 7283 (2021). doi.org/10.1038/s41467-021-27356-8
7. Curtin, L., D’Andrea, W.J., Balascio, N.L. et al. Sedimentary DNA and molecular evidence for early human occupation of the Faroe Islands. Commun Earth Environ 2, 253 (2021). doi.org/10.1038/s43247-021-00318-0