Может быть потому, что он наиболее универсален, не слишком сложен, предоставляет доступ к достаточно низкому уровню работы с ресурсами и высокую производительность. Кроме того, коспиляторы/интерпретаторы многих языков из гифки написаны на C.
Но вообще это же просто смешная гифка, не надо воспринимать её слишком серьёзно )
Кстати, здесь обыгрывается устойчивая фраза "голый C" (не ++, не #, без всяких наворотов), распространённая в комьюнити разработчиков )
Vanilla это немного другое, это применяется не только к языкам, а шире, например: ванильное ядро - ядро из офф репозитория, без каких-то непринятых в стейбл патчей; ванильный по отношению к языку программирования скорее имеет значение "неизменённый компилятор/интерпретатор". То есть PHP, который можно скачать с php.net - ванильный. А kPHP от VK, или HHVM от FB - это уже "кастомки".