Нуу... Тут это имеет смысл, хотя бы потому, что МГУ у нас не один. Например, Мордовский Государственный Университет тоже сокращается как МГУ. Хотя в обоих случаях точнее было бы говорить не московский и мордовский МГУ, а МГУ им. М.В.Ломоносова и Н.П.Огарева соответственно.