EyeWire - помощь ученым в игровой форме⁠⁠

Проект был создан в результате кооперации между Массачусетским технологическом институтом (MIT) и Институтом медицинских исследований им. Макса Планка.

Цель проекта — создать карту связей (коннектом) между нейронами в сетчатке, а также идентифицировать отдельные суб-типы нейронов.

На текущем этапе основные усилия направлены на реконструкцию трехмерной структуры нейронов на основе двухмерных срезов.

На подготовительном этапе проводилось снятие активности нейронов с помощью двухфотонного лазерного микроскопа и получение срезов (послойных двухмерных изображений) сетчатки. Срезы затем анализировались с помощью методов искусственного интеллекта. На следующем этапе подключились добровольцы, помогающие воссоздать 3D-структуру нейронов. Любой желающий может стать участником проекта. Процесс воссоздания организован в виде компьютерной игры.

Вот как это собственно выглядит:

На картинке мы видим срез нейронов. Синим показан уже воссозданный сегмент нейрона. Рядом сразу же формируется 3D модель построенного участка

Нам необходимо создать смежный кусочек. Мы помечаем участок рядом, реконструируемая нами часть помечается зеленым цветом (для наглядности, в процессе игры будем продолжать синий цвет)

Рядом сразу же все формируется трехмерный образ

Не обращайте внимание на то, что так быстро и такой большой участок, миссия обучающая. Далее мы обычным скроллом перемещаемся вверх и вниз по срезам, помечая не отделенные от нашей заливки области. В итоге мы формируем целый участок нейрона в заданном объеме

Реконструкции от разных участников сравниваются между собой, на основе чего воссоздается наиболее точная трехмерная модель участка. Затем участки объединяются в общую модель нейрона. Хоть сайт и на английском, обучающие миссии как и сам процесс будут предельно понятны любому. За выполнение дают баллы, пользователи внесшие наибольший вклад будут указаны в итоговой научной работе. Непосредственно мы в течение миссии работаем с подобным куском

Который объединится с другими в такую сеть

Не, даже не в такую. Вот в такую

Примерно за 9 месяцев работы проекта с помощью пользователей удалось воссоздать уже 245 таких нейронов. На следующем этапе планируется анализ связей (синапсов) между нейронами. Чтобы потом объединить все нейроны в такой огромный квадрат

Которая также является лишь малой областью 200х200 микрометров.

Ссылка: http://eyewire.org/